MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 plasmid CMR15_mp

Total Repeats: 6555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017589	CG	3	6	1949193	1949198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6502	NC_017589	GC	3	6	1949243	1949248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6503	NC_017589	GCCGC	2	10	1949257	1949266	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6504	NC_017589	TGCCG	2	10	1949269	1949278	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6505	NC_017589	GCG	2	6	1949309	1949314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_017589	GC	3	6	1949357	1949362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6507	NC_017589	GCAT	2	8	1949387	1949394	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6508	NC_017589	A	6	6	1949423	1949428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_017589	GCCG	2	8	1949436	1949443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6510	NC_017589	CCCA	2	8	1949455	1949462	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6511	NC_017589	CCGA	2	8	1951013	1951020	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6512	NC_017589	CCG	2	6	1951029	1951034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6513	NC_017589	GCG	2	6	1951070	1951075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_017589	GGC	2	6	1951082	1951087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_017589	CCA	2	6	1951091	1951096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6516	NC_017589	CG	3	6	1951098	1951103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6517	NC_017589	AGCG	2	8	1951925	1951932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6518	NC_017589	CAC	2	6	1952053	1952058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6519	NC_017589	GA	3	6	1952066	1952071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_017589	ACGC	2	8	1952091	1952098	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6521	NC_017589	CG	4	8	1952099	1952106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6522	NC_017589	CCG	2	6	1952202	1952207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6523	NC_017589	CTG	2	6	1952706	1952711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_017589	CCG	2	6	1952741	1952746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6525	NC_017589	CGC	2	6	1952846	1952851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6526	NC_017589	GTC	2	6	1952854	1952859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_017589	TGCC	2	8	1952890	1952897	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6528	NC_017589	CAC	2	6	1952907	1952912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6529	NC_017589	ACGCG	2	10	1952928	1952937	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6530	NC_017589	CAT	2	6	1955384	1955389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_017589	GTCC	2	8	1955398	1955405	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6532	NC_017589	CAG	2	6	1955440	1955445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_017589	CATACC	2	12	1955450	1955461	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
6534	NC_017589	CG	3	6	1955486	1955491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6535	NC_017589	CG	4	8	1955499	1955506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6536	NC_017589	CTG	2	6	1955521	1955526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_017589	CACG	2	8	1955534	1955541	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6538	NC_017589	CGC	2	6	1955542	1955547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6539	NC_017589	GCC	3	9	1955552	1955560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6540	NC_017589	GCC	2	6	1955674	1955679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6541	NC_017589	TCG	2	6	1957114	1957119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_017589	CGGC	2	8	1957379	1957386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6543	NC_017589	ATG	2	6	1958891	1958896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_017589	GC	4	8	1958928	1958935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6545	NC_017589	GAC	2	6	1958943	1958948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_017589	CGAG	2	8	1958953	1958960	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6547	NC_017589	GAT	2	6	1958997	1959002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_017589	GC	3	6	1959004	1959009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6549	NC_017589	TCG	2	6	1959012	1959017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_017589	GCC	2	6	1959086	1959091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6551	NC_017589	GCCC	2	8	1959101	1959108	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6552	NC_017589	AGC	2	6	1959165	1959170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_017589	GCG	2	6	1959188	1959193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_017589	TGC	2	6	1959223	1959228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_017589	AAGC	2	8	1959299	1959306	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.