MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 11820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017584	CCG	2	6	991598	991603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3002	NC_017584	AAAT	2	8	991797	991804	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017584	GCG	2	6	991807	991812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_017584	GTG	2	6	991902	991907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017584	GGT	2	6	991980	991985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017584	TGC	2	6	992010	992015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_017584	CAT	2	6	992072	992077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_017584	CTG	2	6	992084	992089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_017584	TCG	2	6	992107	992112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_017584	ATA	2	6	992164	992169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017584	CGTT	2	8	992277	992284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3012	NC_017584	AAC	2	6	992303	992308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_017584	CTT	2	6	996068	996073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_017584	TGA	2	6	996106	996111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017584	CG	3	6	996157	996162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_017584	GCC	2	6	996168	996173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_017584	GATC	2	8	996179	996186	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3018	NC_017584	GCC	2	6	996246	996251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_017584	G	6	6	996253	996258	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017584	CA	3	6	996270	996275	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_017584	ACC	2	6	996320	996325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_017584	CCG	2	6	996326	996331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_017584	GC	3	6	998453	998458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3024	NC_017584	CGG	2	6	999535	999540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_017584	GA	3	6	999564	999569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017584	CGC	2	6	999580	999585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_017584	CCCGG	2	10	999603	999612	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3028	NC_017584	CT	3	6	999626	999631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_017584	AGA	2	6	999647	999652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017584	GGT	2	6	999673	999678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017584	CGG	2	6	999697	999702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_017584	TAT	2	6	999719	999724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017584	CG	3	6	999726	999731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_017584	TAAT	2	8	1001178	1001185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_017584	G	6	6	1001231	1001236	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017584	G	6	6	1001281	1001286	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_017584	GTC	2	6	1001313	1001318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_017584	CGA	2	6	1001323	1001328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_017584	CGC	2	6	1002253	1002258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_017584	GCC	2	6	1002269	1002274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_017584	GCGCG	2	10	1002283	1002292	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3042	NC_017584	GTC	2	6	1002305	1002310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_017584	GAAA	2	8	1002331	1002338	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_017584	GCGA	2	8	1002346	1002353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3045	NC_017584	AGC	2	6	1002355	1002360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_017584	ATA	2	6	1006205	1006210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_017584	ACA	2	6	1006256	1006261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_017584	GTT	2	6	1006306	1006311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_017584	TCG	2	6	1011507	1011512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_017584	GGC	2	6	1011870	1011875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_017584	CGG	2	6	1011901	1011906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_017584	GCG	2	6	1011915	1011920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_017584	GCC	2	6	1011926	1011931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_017584	CGCTC	2	10	1012100	1012109	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3055	NC_017584	GCGTC	2	10	1012114	1012123	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3056	NC_017584	GTC	2	6	1012234	1012239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_017584	CGAT	2	8	1012252	1012259	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3058	NC_017584	GGC	2	6	1012260	1012265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_017584	GGC	2	6	1012268	1012273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_017584	A	6	6	1012316	1012321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017584	A	6	6	1012325	1012330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017584	GAC	2	6	1012359	1012364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_017584	GCC	2	6	1012369	1012374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3064	NC_017584	GGC	2	6	1012485	1012490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_017584	ACGG	2	8	1012503	1012510	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3066	NC_017584	CGA	2	6	1012524	1012529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_017584	G	6	6	1012540	1012545	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017584	CAT	2	6	1012599	1012604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_017584	TCG	2	6	1012606	1012611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_017584	TTGG	2	8	1012628	1012635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_017584	GTG	2	6	1012640	1012645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_017584	GAT	2	6	1012674	1012679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_017584	CGC	2	6	1012713	1012718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_017584	GCT	2	6	1013928	1013933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_017584	C	6	6	1014084	1014089	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3076	NC_017584	TGG	2	6	1014112	1014117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_017584	CG	3	6	1014131	1014136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3078	NC_017584	GCC	2	6	1014142	1014147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3079	NC_017584	AG	3	6	1014184	1014189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_017584	GGAA	2	8	1014196	1014203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_017584	GC	3	6	1014227	1014232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_017584	GGGT	2	8	1015955	1015962	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017584	CGC	2	6	1015972	1015977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_017584	CGCGG	2	10	1016984	1016993	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3085	NC_017584	ATC	2	6	1017037	1017042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_017584	A	7	7	1020019	1020025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_017584	GA	3	6	1020052	1020057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_017584	CGA	2	6	1021023	1021028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_017584	GCCA	2	8	1021854	1021861	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3090	NC_017584	GC	3	6	1021877	1021882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3091	NC_017584	CT	3	6	1021910	1021915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3092	NC_017584	CGC	2	6	1021956	1021961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3093	NC_017584	TCC	2	6	1021982	1021987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3094	NC_017584	ACC	2	6	1021996	1022001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3095	NC_017584	CCGG	2	8	1022005	1022012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3096	NC_017584	GTCAGG	2	12	1022020	1022031	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3097	NC_017584	GAC	2	6	1022234	1022239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_017584	CAAGT	2	10	1022265	1022274	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3099	NC_017584	GAA	2	6	1022278	1022283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017584	TCC	2	6	1022377	1022382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3101	NC_017584	GC	3	6	1022387	1022392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_017584	CGA	2	6	1025226	1025231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_017584	A	7	7	1026785	1026791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_017584	AG	3	6	1027292	1027297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_017584	TGGCG	2	10	1027369	1027378	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3106	NC_017584	CGG	2	6	1027379	1027384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_017584	AATT	2	8	1027424	1027431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017584	TCT	2	6	1027432	1027437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_017584	CCCGA	2	10	1031969	1031978	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3110	NC_017584	CGA	3	9	1031982	1031990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_017584	GCG	2	6	1032016	1032021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_017584	GCC	2	6	1032045	1032050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3113	NC_017584	CGG	2	6	1032090	1032095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_017584	ATT	2	6	1032133	1032138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_017584	CGG	2	6	1032141	1032146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_017584	CGG	2	6	1032165	1032170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_017584	TGTC	2	8	1032184	1032191	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3118	NC_017584	CAT	2	6	1032317	1032322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_017584	AGC	2	6	1032325	1032330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_017584	GTG	2	6	1032369	1032374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017584	AGCA	2	8	1037172	1037179	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3122	NC_017584	AAC	2	6	1037201	1037206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_017584	GCCG	2	8	1040515	1040522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_017584	TCC	2	6	1041410	1041415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_017584	A	6	6	1041428	1041433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017584	GGC	2	6	1041435	1041440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_017584	TGGT	2	8	1041475	1041482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_017584	AAAG	2	8	1041491	1041498	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_017584	ATC	2	6	1042288	1042293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_017584	TCC	2	6	1042929	1042934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3131	NC_017584	TCA	2	6	1045168	1045173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3133	NC_017584	T	6	6	1045904	1045909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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