MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 11820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017584	C	7	7	439234	439240	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1502	NC_017584	GCG	2	6	439409	439414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_017584	GC	3	6	439470	439475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_017584	CT	3	6	439523	439528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_017584	GGTCGA	2	12	439587	439598	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1506	NC_017584	TCG	2	6	439632	439637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_017584	CGC	2	6	439642	439647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_017584	CCG	2	6	443177	443182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_017584	C	8	8	447893	447900	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1510	NC_017584	GAG	2	6	447929	447934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017584	TCT	2	6	450025	450030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_017584	ATTCC	2	10	450063	450072	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1513	NC_017584	CTT	2	6	450104	450109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_017584	ACC	2	6	450138	450143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_017584	CTGGT	2	10	450757	450766	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1516	NC_017584	T	6	6	450785	450790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017584	TCG	3	9	451794	451802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_017584	GGGCG	2	10	455015	455024	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1519	NC_017584	GC	4	8	455059	455066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_017584	G	6	6	455082	455087	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017584	GTCC	2	8	456713	456720	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_017584	GTC	2	6	456747	456752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_017584	CGG	2	6	456797	456802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_017584	CAG	2	6	456818	456823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_017584	GC	3	6	456845	456850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_017584	GCG	2	6	456871	456876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_017584	G	6	6	456904	456909	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017584	G	6	6	456911	456916	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017584	GGC	2	6	456974	456979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_017584	GCC	2	6	456996	457001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_017584	CGC	2	6	457007	457012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_017584	CGC	2	6	457023	457028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_017584	TCT	2	6	457036	457041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_017584	C	6	6	457054	457059	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1535	NC_017584	GCC	2	6	457071	457076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_017584	G	6	6	457080	457085	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017584	CGC	2	6	457095	457100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_017584	GCG	3	9	457101	457109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_017584	CG	3	6	457108	457113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_017584	CCGG	2	8	457813	457820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1541	NC_017584	GA	3	6	457840	457845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017584	GAGG	2	8	458343	458350	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017584	GC	3	6	458371	458376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_017584	GAT	2	6	458397	458402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017584	CCA	2	6	458773	458778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_017584	CGT	3	9	459995	460003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_017584	CGC	2	6	460016	460021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_017584	GAT	2	6	460032	460037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017584	TGG	2	6	460040	460045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017584	CTT	2	6	460642	460647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_017584	CTT	2	6	460658	460663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_017584	GAA	2	6	460699	460704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017584	CT	3	6	461130	461135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_017584	T	6	6	461135	461140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017584	GAA	2	6	461207	461212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017584	CCG	2	6	462245	462250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_017584	CGG	2	6	462269	462274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_017584	TCG	3	9	462283	462291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_017584	GC	3	6	462370	462375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_017584	CGG	2	6	462380	462385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_017584	CTT	2	6	462441	462446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_017584	GC	3	6	462484	462489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_017584	C	6	6	464285	464290	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1564	NC_017584	CGG	2	6	464308	464313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_017584	AGG	2	6	465084	465089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017584	AACG	2	8	465492	465499	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1567	NC_017584	A	6	6	465512	465517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017584	GAG	2	6	465518	465523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017584	CTT	2	6	465537	465542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_017584	GA	3	6	465548	465553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017584	CGG	2	6	466782	466787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_017584	CCGA	2	8	466806	466813	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_017584	CCGG	2	8	466893	466900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_017584	GGCG	2	8	466923	466930	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_017584	G	7	7	466933	466939	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017584	GCG	2	6	467926	467931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_017584	CGG	2	6	468050	468055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_017584	CTG	2	6	468096	468101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_017584	AGTC	2	8	468168	468175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1580	NC_017584	GTG	2	6	468183	468188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017584	G	7	7	468192	468198	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017584	CGG	2	6	468459	468464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_017584	GGCC	2	8	469725	469732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_017584	CGAAG	2	10	470976	470985	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1585	NC_017584	CAGGG	2	10	471002	471011	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1586	NC_017584	CGA	3	9	471060	471068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_017584	CGGG	2	8	471078	471085	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1588	NC_017584	CGC	2	6	471108	471113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_017584	CGGGG	2	10	471121	471130	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1590	NC_017584	G	6	6	471142	471147	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017584	C	6	6	471160	471165	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1592	NC_017584	GGCG	2	8	471175	471182	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_017584	CGG	2	6	471203	471208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1596	NC_017584	G	6	6	476873	476878	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017584	CGG	2	6	476890	476895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_017584	CCCGG	2	10	476917	476926	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1599	NC_017584	GAC	2	6	476964	476969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_017584	G	6	6	478444	478449	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_017584	GCG	2	6	478503	478508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_017584	CGC	2	6	479875	479880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1603	NC_017584	AAG	2	6	480630	480635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017584	G	6	6	480666	480671	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017584	G	6	6	480711	480716	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017584	CG	3	6	482261	482266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_017584	CGG	3	9	484426	484434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_017584	AAAGG	2	10	487134	487143	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017584	GTC	2	6	487156	487161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_017584	CGG	2	6	487177	487182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_017584	TCG	2	6	487187	487192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_017584	TCC	2	6	488763	488768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_017584	ACC	2	6	488823	488828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1614	NC_017584	GGC	3	9	488836	488844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_017584	GCCG	2	8	488881	488888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1619	NC_017584	GC	3	6	491460	491465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_017584	GC	3	6	491469	491474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_017584	GGTCG	2	10	491479	491488	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1622	NC_017584	TCC	2	6	491507	491512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1623	NC_017584	G	6	6	492485	492490	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017584	CCG	2	6	492497	492502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_017584	TC	3	6	493342	493347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_017584	GGGC	2	8	493428	493435	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1627	NC_017584	GCT	2	6	493437	493442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_017584	CG	3	6	493834	493839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_017584	GT	3	6	493841	493846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017584	CTT	2	6	495174	495179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_017584	C	6	6	496180	496185	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1632	NC_017584	GCC	2	6	496187	496192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1633	NC_017584	TTCC	2	8	496602	496609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_017584	AGA	2	6	496610	496615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_017584	CT	3	6	496667	496672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1636	NC_017584	ATG	2	6	496709	496714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1917	NC_017584	TCA	2	6	591659	591664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1920	NC_017584	CG	3	6	591853	591858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1921	NC_017584	GGCC	2	8	591875	591882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1953	NC_017584	TCC	2	6	613132	613137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1954	NC_017584	TGG	2	6	613169	613174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1978	NC_017584	CGC	2	6	625333	625338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2000	NC_017584	AGA	2	6	632132	632137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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