MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 11820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017584	TTTC	2	8	297143	297150	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_017584	AT	3	6	297175	297180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017584	CAA	2	6	297212	297217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_017584	CCA	2	6	297244	297249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_017584	TCG	2	6	297257	297262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_017584	GA	3	6	297269	297274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017584	AC	3	6	301123	301128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_017584	GAT	2	6	301141	301146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017584	CGT	2	6	301195	301200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_017584	TGG	2	6	301210	301215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017584	CCG	2	6	301263	301268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_017584	CGG	2	6	301293	301298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_017584	G	7	7	301297	301303	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017584	TGCC	2	8	301309	301316	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_017584	GAT	2	6	301356	301361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017584	GAA	2	6	302841	302846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017584	ATCG	2	8	302881	302888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_017584	GCG	2	6	302895	302900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_017584	CGC	2	6	302935	302940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_017584	T	6	6	302986	302991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017584	CGGT	2	8	302999	303006	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_017584	CTC	2	6	304504	304509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_017584	AC	3	6	304535	304540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_017584	AAG	2	6	304556	304561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017584	CGG	2	6	304589	304594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_017584	CCG	2	6	304632	304637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_017584	TGGGG	2	10	306659	306668	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017584	TGG	2	6	306688	306693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017584	CGC	2	6	306709	306714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_017584	TGG	2	6	306903	306908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017584	CAGC	2	8	306974	306981	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_017584	G	6	6	307070	307075	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017584	CCG	2	6	307086	307091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_017584	GCCATC	2	12	307150	307161	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_017584	CGC	2	6	307162	307167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_017584	C	7	7	307181	307187	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1037	NC_017584	CGCGG	2	10	307199	307208	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1038	NC_017584	GGC	2	6	307215	307220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017584	T	6	6	307272	307277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017584	AGTC	2	8	307278	307285	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_017584	TTA	2	6	309408	309413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017584	TCC	2	6	313381	313386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_017584	GGA	2	6	313401	313406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017584	CG	3	6	313440	313445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_017584	TCC	2	6	313451	313456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_017584	AATATC	2	12	314516	314527	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1047	NC_017584	AAC	2	6	314558	314563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_017584	CGGG	2	8	314655	314662	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_017584	CGG	2	6	314777	314782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_017584	GTG	2	6	314843	314848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017584	ATTTAG	2	12	316994	317005	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017584	ATC	2	6	317041	317046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_017584	T	8	8	317059	317066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017584	T	6	6	317078	317083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017584	T	6	6	317091	317096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017584	ATG	2	6	318278	318283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017584	TTA	2	6	320473	320478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017584	GGA	2	6	320526	320531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017584	GC	3	6	322794	322799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_017584	CGC	2	6	322811	322816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_017584	CCG	2	6	322827	322832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_017584	CGG	2	6	322853	322858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_017584	GC	3	6	322885	322890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_017584	T	6	6	322917	322922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017584	A	6	6	322954	322959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017584	AGG	2	6	323016	323021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017584	TAA	2	6	323121	323126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017584	TCC	2	6	323147	323152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_017584	TTC	2	6	323160	323165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_017584	GTC	2	6	323256	323261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_017584	T	7	7	323268	323274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017584	T	6	6	323276	323281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017584	TTA	2	6	323285	323290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017584	TTG	2	6	323298	323303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017584	ATTTT	2	10	323563	323572	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017584	T	7	7	323569	323575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017584	AT	3	6	323581	323586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017584	AG	3	6	323602	323607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017584	TTC	2	6	323610	323615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_017584	AAT	2	6	323730	323735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017584	AAGA	2	8	323740	323747	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017584	GAAAA	2	10	323780	323789	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017584	GTT	2	6	323790	323795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017584	T	7	7	323820	323826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017584	TGT	2	6	323841	323846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017584	TTC	2	6	323878	323883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_017584	CAA	2	6	323950	323955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_017584	CAG	2	6	324003	324008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_017584	A	6	6	324025	324030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017584	G	6	6	324070	324075	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017584	GGC	2	6	324107	324112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_017584	GGC	2	6	324132	324137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_017584	GTC	2	6	324256	324261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_017584	AAC	2	6	325665	325670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_017584	A	7	7	325675	325681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017584	CGG	2	6	325765	325770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_017584	TTCA	2	8	325778	325785	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_017584	G	6	6	325859	325864	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017584	AGG	2	6	325876	325881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017584	GAGG	2	8	325884	325891	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017584	GCC	2	6	325921	325926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_017584	CG	3	6	325994	325999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_017584	G	7	7	326079	326085	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017584	CGG	2	6	326097	326102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_017584	A	6	6	326206	326211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017584	GCG	2	6	327180	327185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017584	ACGGGG	2	12	327198	327209	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1108	NC_017584	GCGCC	2	10	327216	327225	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1109	NC_017584	CAG	2	6	329053	329058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_017584	G	7	7	329072	329078	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017584	G	6	6	329083	329088	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017584	GCC	2	6	329096	329101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_017584	CCT	2	6	330876	330881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_017584	A	7	7	330888	330894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017584	TGC	2	6	330895	330900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_017584	CTT	2	6	333701	333706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017584	CCGC	2	8	334285	334292	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1118	NC_017584	GCG	2	6	334304	334309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_017584	A	6	6	334406	334411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017584	TGCT	2	8	334476	334483	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_017584	GTT	2	6	334496	334501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017584	TCT	3	9	334504	334512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_017584	TAA	2	6	334551	334556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017584	CGGA	2	8	334570	334577	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_017584	ACG	2	6	334614	334619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_017584	GAC	2	6	334692	334697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_017584	CTG	2	6	334714	334719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_017584	CGGC	2	8	335481	335488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_017584	TCC	2	6	335491	335496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_017584	C	8	8	335593	335600	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1131	NC_017584	G	6	6	336064	336069	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017584	GGC	2	6	336144	336149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_017584	GAC	2	6	336944	336949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_017584	GAC	2	6	336976	336981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_017584	A	7	7	337328	337334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_017584	T	6	6	338140	338145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1414	NC_017584	TAC	2	6	420362	420367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1416	NC_017584	CAT	2	6	420430	420435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1451	NC_017584	TG	3	6	423561	423566	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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