MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 11820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017584	CCG	2	6	177692	177697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_017584	CAC	2	6	177831	177836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_017584	GCC	2	6	178518	178523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_017584	TCTTG	2	10	178554	178563	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
505	NC_017584	GGC	2	6	178573	178578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017584	TCCT	2	8	179396	179403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_017584	GC	3	6	179460	179465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
508	NC_017584	GTT	2	6	179467	179472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017584	CGCGGG	2	12	179497	179508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017584	G	6	6	179519	179524	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017584	GGT	2	6	179529	179534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017584	G	7	7	179545	179551	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017584	GGC	2	6	180269	180274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017584	CGG	2	6	180318	180323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017584	TCC	2	6	180330	180335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_017584	GGGC	2	8	180344	180351	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
517	NC_017584	AGTTT	2	10	180373	180382	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017584	CGA	3	9	183227	183235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017584	GCG	2	6	183261	183266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017584	G	6	6	183272	183277	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017584	GCC	2	6	183285	183290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_017584	GGAT	2	8	185036	185043	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017584	CG	3	6	186771	186776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_017584	CGG	2	6	186785	186790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_017584	GCC	2	6	186800	186805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_017584	CCT	2	6	187177	187182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_017584	CGG	2	6	187215	187220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017584	CG	3	6	187225	187230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
529	NC_017584	TCCTC	2	10	187235	187244	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
530	NC_017584	GATG	2	8	187267	187274	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017584	A	6	6	187283	187288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017584	AGC	2	6	187311	187316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017584	TCCG	2	8	187344	187351	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
534	NC_017584	CGC	2	6	187363	187368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_017584	CGGG	2	8	187425	187432	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
536	NC_017584	GT	3	6	187437	187442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017584	AGA	2	6	187453	187458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017584	GGA	2	6	187465	187470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017584	GGA	2	6	187798	187803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017584	GCC	2	6	189501	189506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_017584	CGA	2	6	189904	189909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_017584	TCTT	2	8	189919	189926	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
543	NC_017584	GTC	2	6	189935	189940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_017584	CGG	2	6	191674	191679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_017584	GGC	3	9	191683	191691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017584	T	6	6	191705	191710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017584	TTC	2	6	191713	191718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017584	GT	3	6	191727	191732	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017584	G	6	6	191736	191741	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017584	GCG	2	6	191757	191762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017584	A	6	6	191802	191807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017584	GGT	2	6	191812	191817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017584	GGT	2	6	191878	191883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017584	GAG	2	6	191959	191964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017584	A	6	6	191978	191983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017584	CGA	2	6	192036	192041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_017584	GCG	2	6	192047	192052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_017584	GTCT	2	8	192148	192155	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
559	NC_017584	A	7	7	192167	192173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017584	CGA	2	6	192219	192224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_017584	CGG	2	6	192225	192230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_017584	CGG	2	6	192238	192243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017584	TTG	2	6	192272	192277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017584	GCT	2	6	192299	192304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_017584	CGAA	2	8	192328	192335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
566	NC_017584	GGGC	2	8	192342	192349	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
567	NC_017584	TTCC	2	8	192394	192401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_017584	TATAAG	2	12	192434	192445	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017584	GGC	2	6	192558	192563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_017584	AAT	2	6	192650	192655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017584	CCA	2	6	192756	192761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_017584	CGA	2	6	192765	192770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_017584	GCCA	2	8	192794	192801	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
574	NC_017584	GCA	2	6	192839	192844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_017584	GTGA	2	8	192892	192899	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017584	GAT	2	6	192938	192943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017584	AGA	2	6	192956	192961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017584	CAG	2	6	192982	192987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_017584	GTT	2	6	193013	193018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017584	GTG	2	6	193131	193136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017584	GGA	2	6	193173	193178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017584	GGC	2	6	193193	193198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_017584	TGC	2	6	193511	193516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_017584	GTC	2	6	193523	193528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_017584	TCGTG	2	10	193532	193541	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
586	NC_017584	GGA	2	6	193637	193642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017584	GGGCT	2	10	193678	193687	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
588	NC_017584	AC	3	6	193688	193693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_017584	AC	3	6	193856	193861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
590	NC_017584	AGG	2	6	193915	193920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017584	CCT	2	6	193997	194002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_017584	AAG	2	6	194069	194074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017584	CGG	2	6	194131	194136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_017584	GGT	2	6	194162	194167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017584	GGT	2	6	194203	194208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017584	CCA	2	6	194260	194265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_017584	GTC	2	6	194377	194382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_017584	CCA	2	6	194402	194407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_017584	CCT	2	6	194447	194452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_017584	CCA	2	6	194484	194489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_017584	CT	3	6	194545	194550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
602	NC_017584	CTG	2	6	194575	194580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017584	T	6	6	194601	194606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017584	CGT	2	6	194607	194612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017584	TTC	2	6	194703	194708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017584	CAAG	2	8	194780	194787	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
607	NC_017584	TGG	2	6	194799	194804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017584	ACCC	2	8	194903	194910	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
609	NC_017584	GGA	2	6	194983	194988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017584	TAG	2	6	195012	195017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017584	GCGA	2	8	195020	195027	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
612	NC_017584	G	6	6	195167	195172	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017584	ACC	2	6	195173	195178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_017584	GAC	2	6	195200	195205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_017584	TCG	2	6	195418	195423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_017584	GGA	2	6	195485	195490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017584	GAT	2	6	195602	195607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017584	ACC	2	6	195609	195614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_017584	CAGA	2	8	195698	195705	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
620	NC_017584	AAC	2	6	195738	195743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_017584	ACC	2	6	195748	195753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_017584	AAC	2	6	195805	195810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_017584	AGG	2	6	195812	195817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017584	AGC	2	6	195828	195833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017584	AAAG	2	8	195842	195849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017584	TTCT	2	8	195927	195934	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
627	NC_017584	CCG	2	6	196054	196059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_017584	GTT	2	6	196190	196195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017584	CCT	2	6	196196	196201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_017584	GCAG	2	8	196217	196224	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
631	NC_017584	GA	3	6	196305	196310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017584	GTG	2	6	196368	196373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017584	CAT	2	6	196380	196385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_017584	G	7	7	196386	196392	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017584	GAC	2	6	196450	196455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_017584	AGAGG	2	10	196493	196502	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017584	CGG	2	6	196532	196537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_017584	TAC	2	6	196706	196711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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644	NC_017584	TGG	2	6	196918	196923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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767	NC_017584	TGG	2	6	230685	230690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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770	NC_017584	GA	3	6	232983	232988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
771	NC_017584	GGA	2	6	233014	233019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
772	NC_017584	TCA	2	6	233087	233092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
773	NC_017584	TAT	2	6	233127	233132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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776	NC_017584	CTC	2	6	233186	233191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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