MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 11820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017584	GA	3	6	2129748	2129753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_017584	GC	3	6	2129755	2129760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_017584	G	6	6	2129828	2129833	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_017584	A	6	6	2129836	2129841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_017584	GTATT	2	10	2129857	2129866	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_017584	TCC	2	6	2130806	2130811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_017584	T	6	6	2133140	2133145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_017584	C	8	8	2133215	2133222	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6009	NC_017584	CGGC	2	8	2133301	2133308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6010	NC_017584	GCG	2	6	2133341	2133346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_017584	TCCGT	2	10	2133352	2133361	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6012	NC_017584	T	6	6	2135762	2135767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_017584	TC	3	6	2136640	2136645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6014	NC_017584	CT	3	6	2137714	2137719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_017584	CCG	2	6	2137777	2137782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_017584	TGG	2	6	2137800	2137805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_017584	G	6	6	2137804	2137809	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_017584	CCG	2	6	2137834	2137839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_017584	CCA	2	6	2137852	2137857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6020	NC_017584	GCC	2	6	2140341	2140346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_017584	GGA	2	6	2140843	2140848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_017584	TGAA	2	8	2140858	2140865	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_017584	ATT	2	6	2140880	2140885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_017584	CGG	2	6	2140896	2140901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_017584	T	6	6	2140984	2140989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_017584	CA	3	6	2141946	2141951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6027	NC_017584	GTT	2	6	2143604	2143609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_017584	CGC	2	6	2143616	2143621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_017584	AGA	2	6	2143627	2143632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_017584	GC	3	6	2144392	2144397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_017584	GCAGC	2	10	2144436	2144445	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6032	NC_017584	CGC	2	6	2145563	2145568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_017584	GGATC	2	10	2148794	2148803	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6034	NC_017584	CG	3	6	2149778	2149783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_017584	GTC	2	6	2150720	2150725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_017584	T	7	7	2150726	2150732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_017584	CTTGG	2	10	2150735	2150744	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6038	NC_017584	ATC	2	6	2150894	2150899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_017584	CCGTC	2	10	2151648	2151657	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6040	NC_017584	AACAA	2	10	2151658	2151667	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6041	NC_017584	CAC	2	6	2151675	2151680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_017584	CCT	2	6	2152469	2152474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6043	NC_017584	GCC	2	6	2152487	2152492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_017584	C	6	6	2152538	2152543	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6045	NC_017584	GC	3	6	2152553	2152558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_017584	TC	3	6	2153315	2153320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6047	NC_017584	TCC	2	6	2156127	2156132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_017584	GAAC	2	8	2156172	2156179	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6049	NC_017584	G	6	6	2156194	2156199	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_017584	ATC	3	9	2156237	2156245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_017584	CCT	2	6	2156248	2156253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6052	NC_017584	GCG	2	6	2156739	2156744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_017584	AT	3	6	2156767	2156772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_017584	CGG	2	6	2156784	2156789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_017584	GC	3	6	2157328	2157333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_017584	GT	3	6	2157382	2157387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_017584	GATAAT	2	12	2157404	2157415	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_017584	T	7	7	2157418	2157424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_017584	TCG	3	9	2158817	2158825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_017584	TC	3	6	2158869	2158874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6061	NC_017584	ACG	2	6	2158883	2158888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_017584	GGA	2	6	2158908	2158913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_017584	CTC	2	6	2158923	2158928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_017584	GGT	2	6	2159943	2159948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_017584	CGC	2	6	2161008	2161013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6066	NC_017584	GCG	2	6	2161043	2161048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_017584	G	6	6	2161570	2161575	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_017584	ATA	2	6	2162475	2162480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_017584	CGC	2	6	2162500	2162505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6070	NC_017584	GTG	2	6	2162533	2162538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_017584	AGGC	2	8	2162558	2162565	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6072	NC_017584	GCG	2	6	2162577	2162582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_017584	CGC	2	6	2162697	2162702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_017584	CGCC	2	8	2162713	2162720	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6075	NC_017584	CGC	2	6	2164763	2164768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6076	NC_017584	CGC	2	6	2164811	2164816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6077	NC_017584	GCGA	2	8	2164830	2164837	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6078	NC_017584	TCG	3	9	2164840	2164848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_017584	GGC	2	6	2164878	2164883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_017584	GGC	3	9	2166806	2166814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_017584	GGC	2	6	2166829	2166834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_017584	CCCG	2	8	2166853	2166860	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6083	NC_017584	CGG	2	6	2166898	2166903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_017584	CGG	2	6	2166908	2166913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_017584	ACA	2	6	2166987	2166992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_017584	A	7	7	2166992	2166998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6089	NC_017584	TTA	2	6	2168249	2168254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_017584	TTG	2	6	2168260	2168265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_017584	GCG	2	6	2168282	2168287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_017584	ACG	2	6	2168312	2168317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6094	NC_017584	CGGA	2	8	2168404	2168411	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6095	NC_017584	GCC	2	6	2170090	2170095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6097	NC_017584	ACG	2	6	2170146	2170151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_017584	CGC	3	9	2170768	2170776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_017584	GAC	2	6	2171661	2171666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_017584	GAG	2	6	2171684	2171689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_017584	CGG	2	6	2171984	2171989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_017584	A	6	6	2172036	2172041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_017584	C	6	6	2172152	2172157	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6104	NC_017584	AGG	2	6	2172185	2172190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_017584	TTC	2	6	2172198	2172203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_017584	GGTAA	2	10	2174096	2174105	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_017584	GT	3	6	2174121	2174126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_017584	CTTC	2	8	2177874	2177881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6109	NC_017584	GGA	2	6	2179310	2179315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_017584	GTC	2	6	2180267	2180272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_017584	GGGCGT	2	12	2180273	2180284	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6112	NC_017584	TC	3	6	2180332	2180337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_017584	TG	3	6	2180354	2180359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_017584	G	7	7	2180368	2180374	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_017584	CGG	3	9	2180392	2180400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_017584	CGG	2	6	2180413	2180418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_017584	C	6	6	2180460	2180465	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6118	NC_017584	TAT	2	6	2180466	2180471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_017584	GTTT	2	8	2180495	2180502	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_017584	GGT	2	6	2180654	2180659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_017584	GCG	2	6	2180682	2180687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_017584	CAG	2	6	2181029	2181034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_017584	CCGG	2	8	2181251	2181258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6124	NC_017584	C	6	6	2181321	2181326	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6125	NC_017584	GC	3	6	2181339	2181344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_017584	CCT	2	6	2181348	2181353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6127	NC_017584	TTC	2	6	2182405	2182410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_017584	CGG	2	6	2182440	2182445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_017584	GCC	2	6	2183546	2183551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6130	NC_017584	CGG	2	6	2183564	2183569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_017584	T	6	6	2183574	2183579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_017584	CAA	2	6	2183592	2183597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6134	NC_017584	CG	3	6	2185775	2185780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6261	NC_017584	C	6	6	2231572	2231577	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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6263	NC_017584	GTT	2	6	2233127	2233132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6401	NC_017584	CA	3	6	2301475	2301480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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