MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 11820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017584	ATC	2	6	1791044	1791049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_017584	ACC	3	9	1791062	1791070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_017584	GTCT	2	8	1791248	1791255	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5004	NC_017584	GCG	2	6	1791294	1791299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_017584	GGT	2	6	1791304	1791309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017584	CGA	2	6	1791359	1791364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_017584	GAA	2	6	1791373	1791378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017584	GCC	2	6	1791389	1791394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_017584	GCG	2	6	1791398	1791403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_017584	ACG	2	6	1791412	1791417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_017584	CGC	2	6	1791442	1791447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_017584	CCG	2	6	1791453	1791458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_017584	GC	3	6	1791492	1791497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_017584	TTC	2	6	1791502	1791507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_017584	GACC	2	8	1791516	1791523	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_017584	GCC	2	6	1791531	1791536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_017584	CAA	2	6	1791540	1791545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_017584	CGT	2	6	1791573	1791578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_017584	CCGC	2	8	1791656	1791663	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5020	NC_017584	CGC	2	6	1791684	1791689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_017584	TCG	2	6	1791701	1791706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_017584	TGGTT	2	10	1791849	1791858	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017584	GCG	2	6	1791859	1791864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_017584	CT	3	6	1791905	1791910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5025	NC_017584	GCT	2	6	1791911	1791916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_017584	TCG	2	6	1791943	1791948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_017584	G	6	6	1792160	1792165	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017584	AGGGG	2	10	1792212	1792221	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017584	AGG	2	6	1792224	1792229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017584	GGCGC	2	10	1792234	1792243	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5031	NC_017584	GAAA	2	8	1792267	1792274	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017584	CCG	2	6	1792407	1792412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_017584	CTGGT	2	10	1792701	1792710	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5034	NC_017584	CGA	2	6	1792748	1792753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_017584	GTATC	2	10	1792909	1792918	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5036	NC_017584	TCG	2	6	1793539	1793544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_017584	CAC	2	6	1793545	1793550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_017584	CTG	2	6	1793565	1793570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_017584	TGG	2	6	1793591	1793596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017584	AAG	2	6	1793632	1793637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017584	GCC	2	6	1793675	1793680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_017584	GAGG	2	8	1794479	1794486	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017584	GTC	2	6	1794489	1794494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_017584	CAAGG	2	10	1794515	1794524	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5045	NC_017584	TGG	2	6	1794534	1794539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017584	CG	3	6	1794610	1794615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_017584	CG	3	6	1794690	1794695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_017584	TATGG	2	10	1794721	1794730	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017584	GC	3	6	1794750	1794755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_017584	CCTT	2	8	1794763	1794770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_017584	CA	3	6	1795968	1795973	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5052	NC_017584	AGGGA	2	10	1796002	1796011	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017584	CGG	2	6	1796695	1796700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_017584	CGC	2	6	1796749	1796754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_017584	GCG	2	6	1796864	1796869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_017584	ACG	2	6	1796870	1796875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_017584	GCTT	2	8	1796879	1796886	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5058	NC_017584	AGTCC	2	10	1796931	1796940	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5059	NC_017584	G	6	6	1798685	1798690	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017584	CGA	2	6	1798694	1798699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_017584	C	6	6	1798711	1798716	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5062	NC_017584	T	6	6	1798717	1798722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_017584	CG	3	6	1799439	1799444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_017584	GCC	2	6	1799500	1799505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_017584	CCACC	2	10	1799515	1799524	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5066	NC_017584	TCG	2	6	1799534	1799539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_017584	TA	3	6	1799599	1799604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017584	TCC	2	6	1799613	1799618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_017584	CGG	2	6	1799629	1799634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_017584	CGC	2	6	1799640	1799645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5071	NC_017584	CGG	2	6	1799656	1799661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_017584	GGT	2	6	1799677	1799682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017584	GCGG	2	8	1799695	1799702	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5074	NC_017584	GAT	2	6	1805199	1805204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017584	CCT	2	6	1806157	1806162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5076	NC_017584	GTG	2	6	1806179	1806184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_017584	TTA	3	9	1806229	1806237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017584	GCC	2	6	1806302	1806307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5079	NC_017584	CCCCG	2	10	1806316	1806325	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5080	NC_017584	TGA	2	6	1806343	1806348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017584	GCC	2	6	1806397	1806402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_017584	AGA	2	6	1808477	1808482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017584	TCG	3	9	1808493	1808501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_017584	CTC	2	6	1808905	1808910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5085	NC_017584	AGCCG	2	10	1808935	1808944	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5086	NC_017584	GCCT	2	8	1809025	1809032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5087	NC_017584	CGCC	2	8	1811390	1811397	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5088	NC_017584	AGCCAA	2	12	1811413	1811424	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_017584	CGC	2	6	1811430	1811435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5090	NC_017584	GGC	2	6	1811446	1811451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_017584	CG	3	6	1811469	1811474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_017584	AG	3	6	1811499	1811504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_017584	GAA	2	6	1811514	1811519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017584	TCTT	2	8	1811543	1811550	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5095	NC_017584	CCA	2	6	1811922	1811927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5096	NC_017584	A	6	6	1812075	1812080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017584	TCT	2	6	1812108	1812113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_017584	CGC	2	6	1812141	1812146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_017584	CAG	2	6	1812154	1812159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_017584	G	8	8	1812793	1812800	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_017584	ACG	2	6	1813069	1813074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_017584	ACC	2	6	1813076	1813081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_017584	GA	3	6	1813084	1813089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017584	CTG	2	6	1814197	1814202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_017584	CGC	2	6	1814212	1814217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_017584	CGG	2	6	1814239	1814244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_017584	T	6	6	1814253	1814258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_017584	AAGGG	2	10	1818018	1818027	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017584	CCA	2	6	1818034	1818039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5110	NC_017584	GAT	2	6	1818161	1818166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017584	CGA	2	6	1818172	1818177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_017584	GCA	2	6	1818188	1818193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_017584	CGG	2	6	1818221	1818226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_017584	GCG	2	6	1820556	1820561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_017584	GCG	2	6	1821255	1821260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_017584	A	6	6	1821287	1821292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_017584	G	7	7	1822770	1822776	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_017584	CGGG	2	8	1825834	1825841	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5119	NC_017584	GTG	2	6	1825843	1825848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017584	TCG	2	6	1825970	1825975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_017584	CG	3	6	1825980	1825985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5122	NC_017584	CCGCT	2	10	1825999	1826008	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5123	NC_017584	GCC	2	6	1827416	1827421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5124	NC_017584	TCG	2	6	1827447	1827452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_017584	TATG	2	8	1827488	1827495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_017584	CT	3	6	1827587	1827592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5127	NC_017584	CCG	2	6	1827593	1827598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_017584	AAGGGG	2	12	1828313	1828324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_017584	CGGCC	2	10	1828342	1828351	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5130	NC_017584	CGG	2	6	1828453	1828458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_017584	GATC	2	8	1828469	1828476	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5132	NC_017584	TG	3	6	1828516	1828521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_017584	TAC	2	6	1828544	1828549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5134	NC_017584	ATGA	2	8	1828552	1828559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_017584	CGG	2	6	1828596	1828601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5136	NC_017584	ACGG	2	8	1828603	1828610	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5137	NC_017584	GAC	2	6	1828645	1828650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5140	NC_017584	CG	3	6	1830099	1830104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5141	NC_017584	GCG	2	6	1830123	1830128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5142	NC_017584	CTT	2	6	1830181	1830186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5151	NC_017584	GC	3	6	1832913	1832918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5152	NC_017584	GGT	2	6	1832963	1832968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5159	NC_017584	CGG	2	6	1833740	1833745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5163	NC_017584	TCC	2	6	1835335	1835340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5166	NC_017584	CAGA	2	8	1835523	1835530	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5250	NC_017584	CGG	2	6	1877934	1877939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5251	NC_017584	CGG	2	6	1880938	1880943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5252	NC_017584	CGG	2	6	1880984	1880989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5254	NC_017584	CGG	2	6	1881003	1881008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5256	NC_017584	C	6	6	1881595	1881600	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5257	NC_017584	ATTTAG	2	12	1884515	1884526	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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5260	NC_017584	T	7	7	1884639	1884645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5261	NC_017584	CGG	2	6	1886008	1886013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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