MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017569	TATT	2	8	822	829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017569	AAAG	2	8	842	849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017569	TTTA	2	8	11023	11030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017569	AATT	2	8	11073	11080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017569	ATTG	2	8	11092	11099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017569	ATTT	2	8	11149	11156	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017569	CAAT	2	8	12056	12063	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017569	ACAA	2	8	12120	12127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017569	TTTA	2	8	23872	23879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017569	TTAC	2	8	24313	24320	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017569	TTTG	2	8	24656	24663	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017569	AAAG	2	8	26331	26338	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017569	TGAT	2	8	28573	28580	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017569	ATTT	2	8	33778	33785	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017569	AACC	2	8	33811	33818	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017569	ATTT	2	8	33874	33881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017569	AAAC	3	12	34121	34132	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017569	TTAT	2	8	34192	34199	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017569	TACC	2	8	43535	43542	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017569	TGAT	2	8	43950	43957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017569	CGAA	2	8	44031	44038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017569	AGTA	2	8	44063	44070	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017569	AATC	2	8	44096	44103	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017569	CCTT	2	8	44128	44135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017569	CTTT	2	8	48561	48568	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017569	TAGA	2	8	55925	55932	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017569	TTTC	2	8	56866	56873	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017569	TTAA	2	8	64789	64796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017569	TAAA	2	8	73020	73027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017569	ATTG	2	8	76806	76813	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017569	ATGC	2	8	79749	79756	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017569	AAAT	2	8	79828	79835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017569	TAAG	2	8	83892	83899	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017569	AGAA	2	8	90712	90719	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017569	ATAA	2	8	91723	91730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017569	TTAA	2	8	91758	91765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017569	GATA	2	8	95898	95905	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017569	CCTC	2	8	96184	96191	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_017569	AATA	2	8	97062	97069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017569	TAAA	2	8	97126	97133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017569	TAAG	2	8	97303	97310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017569	CTTC	2	8	97892	97899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017569	AAAG	2	8	98075	98082	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017569	TGTA	2	8	99107	99114	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017569	GAAA	2	8	99142	99149	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017569	AAAG	2	8	99225	99232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017569	TGAG	2	8	99590	99597	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017569	AATA	2	8	99636	99643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017569	AATT	2	8	100032	100039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017569	ATTT	2	8	101158	101165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017569	CTAT	2	8	102687	102694	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017569	TATT	2	8	106831	106838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017569	AGAA	3	12	107529	107540	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017569	ATTT	2	8	109896	109903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017569	CTAC	2	8	110227	110234	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017569	TAAA	2	8	110452	110459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017569	ATCT	2	8	111134	111141	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017569	TTTC	2	8	111725	111732	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017569	TCTT	2	8	111840	111847	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017569	ATAA	2	8	112759	112766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017569	ATAA	2	8	112813	112820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017569	ATTT	2	8	120405	120412	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017569	TTTA	2	8	120537	120544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017569	TTTA	2	8	127841	127848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017569	TGTA	2	8	141608	141615	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017569	TTAA	2	8	148131	148138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017569	TAAT	2	8	151125	151132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017569	TTAA	2	8	151204	151211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017569	TAAA	2	8	151960	151967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017569	CTAT	2	8	154104	154111	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017569	TTGT	2	8	155069	155076	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017569	AAAT	2	8	155121	155128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017569	ATTT	2	8	155256	155263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017569	GTTT	2	8	155354	155361	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017569	TTTA	2	8	155492	155499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017569	CTTT	2	8	156198	156205	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017569	GTTT	2	8	156702	156709	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017569	TTAT	2	8	156962	156969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017569	AAAT	2	8	157058	157065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017569	AAGA	2	8	158915	158922	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017569	TTAA	2	8	159631	159638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017569	GACA	2	8	162972	162979	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017569	ATAA	2	8	176096	176103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017569	ATTT	2	8	181310	181317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017569	TATT	2	8	181917	181924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017569	CTTA	2	8	186969	186976	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017569	GTTT	2	8	188413	188420	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017569	GTAA	2	8	189317	189324	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017569	TCTA	2	8	202045	202052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017569	TATG	2	8	203945	203952	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017569	TTAG	2	8	207805	207812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017569	TTTA	2	8	214263	214270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017569	AAAC	2	8	214334	214341	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017569	ATTT	2	8	214840	214847	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017569	TTAA	2	8	218850	218857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017569	CACT	2	8	222844	222851	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017569	ATTG	2	8	223593	223600	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017569	AAAG	2	8	223656	223663	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017569	CCAA	2	8	224867	224874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017569	ATGC	2	8	226412	226419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017569	ATTT	2	8	226438	226445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017569	AAAT	2	8	228616	228623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017569	TTGG	2	8	237901	237908	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017569	TAAA	2	8	248200	248207	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017569	TTAA	2	8	253144	253151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017569	GTTT	2	8	257994	258001	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017569	AACC	2	8	258034	258041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017569	TAAA	2	8	261220	261227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017569	ATTG	2	8	261319	261326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017569	GGGT	2	8	261872	261879	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017569	TCTT	2	8	264863	264870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017569	TCTA	2	8	264874	264881	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017569	TCTT	2	8	264899	264906	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017569	TGTC	2	8	266135	266142	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017569	TAAA	2	8	267287	267294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017569	AAAG	2	8	269134	269141	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017569	ACCA	2	8	271521	271528	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017569	ACTT	2	8	272289	272296	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017569	TGTT	3	12	273994	274005	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017569	TATT	2	8	275560	275567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017569	CAAC	2	8	275658	275665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017569	CGGG	2	8	280761	280768	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017569	GTTT	2	8	282471	282478	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017569	AATT	2	8	283557	283564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017569	GTTC	2	8	284893	284900	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017569	ATGT	2	8	288828	288835	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017569	TGAA	2	8	290374	290381	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017569	GGGC	2	8	291570	291577	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017569	CAAA	2	8	294689	294696	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017569	ACTT	2	8	295159	295166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017569	GGGC	2	8	296153	296160	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017569	AATC	2	8	301484	301491	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017569	CGGG	2	8	302901	302908	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017569	CAAC	2	8	304526	304533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017569	ACTT	2	8	308890	308897	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017569	TTTG	2	8	311097	311104	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017569	CATC	2	8	311303	311310	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017569	GCTT	2	8	311390	311397	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017569	TTCG	2	8	311815	311822	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017569	AGTC	2	8	312202	312209	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017569	TTTG	2	8	312261	312268	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017569	TTTG	2	8	314569	314576	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017569	TTTA	2	8	316983	316990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017569	TTTG	2	8	318612	318619	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017569	ATAA	2	8	319913	319920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017569	TTAT	2	8	319923	319930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017569	TTAT	2	8	322524	322531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017569	AATC	2	8	322532	322539	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017569	AAAT	2	8	322608	322615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017569	AAAC	2	8	326435	326442	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_017569	ACCA	2	8	328060	328067	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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