MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 3439

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017569	TTA	2	6	3	8	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017569	TGT	2	6	51	56	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017569	TTG	3	9	57	65	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017569	TCT	2	6	877	882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017569	TAA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017569	AGT	2	6	5486	5491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017569	ATT	3	9	9474	9482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017569	TAA	2	6	11133	11138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017569	ATT	2	6	12994	12999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017569	TAT	2	6	17481	17486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017569	TCA	2	6	19235	19240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017569	TGA	2	6	19249	19254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017569	TAT	2	6	19294	19299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017569	AGA	2	6	19317	19322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017569	TAA	2	6	19326	19331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017569	AAT	2	6	21660	21665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017569	ATT	3	9	21727	21735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017569	TGG	2	6	21803	21808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017569	TGA	2	6	21819	21824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017569	AAG	2	6	22318	22323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017569	CAA	2	6	23337	23342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017569	TCC	2	6	24020	24025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017569	ATA	2	6	24071	24076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017569	GTA	2	6	24179	24184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017569	GGA	2	6	24185	24190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017569	TAA	2	6	24289	24294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017569	ATA	2	6	24322	24327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017569	CAT	2	6	24347	24352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017569	AAT	3	9	24368	24376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017569	TAA	2	6	24673	24678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017569	CCA	2	6	24708	24713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017569	CAC	2	6	24715	24720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017569	ACA	2	6	24750	24755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017569	ATT	2	6	24881	24886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017569	AAT	2	6	26315	26320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017569	TAA	2	6	26821	26826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017569	AAT	2	6	26962	26967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017569	GAT	2	6	27241	27246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017569	ATT	2	6	27263	27268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017569	TAA	2	6	27346	27351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017569	AAT	3	9	28595	28603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017569	TAA	2	6	29326	29331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017569	ATA	2	6	29385	29390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017569	TCA	2	6	29992	29997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017569	AAT	2	6	33569	33574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017569	ATC	2	6	33636	33641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017569	TTC	2	6	33679	33684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017569	AAT	2	6	33885	33890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017569	CTT	2	6	33932	33937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017569	TCC	2	6	33994	33999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017569	TAC	2	6	34043	34048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017569	TCC	2	6	34053	34058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_017569	TCA	2	6	34171	34176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017569	TAT	2	6	36027	36032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017569	AGT	2	6	43290	43295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017569	ATC	2	6	43416	43421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017569	TCC	2	6	43557	43562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017569	GTG	2	6	43711	43716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017569	TTA	2	6	43780	43785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017569	CAT	2	6	43802	43807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017569	CCA	2	6	43813	43818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017569	ATC	2	6	43854	43859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017569	TAT	2	6	44003	44008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017569	CTA	2	6	44150	44155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017569	AGT	2	6	44186	44191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017569	CTC	2	6	44217	44222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017569	AGA	2	6	44255	44260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017569	CAG	2	6	44310	44315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017569	TGC	2	6	44341	44346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017569	CCT	2	6	44402	44407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017569	AGT	2	6	44510	44515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017569	TCA	2	6	48609	48614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017569	TAA	2	6	48631	48636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017569	CTT	2	6	50295	50300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017569	TAA	2	6	52210	52215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017569	TAG	2	6	55961	55966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017569	TAA	2	6	56111	56116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017569	TCA	2	6	56135	56140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017569	TTG	2	6	56235	56240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017569	GCG	2	6	56408	56413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017569	ACA	2	6	56503	56508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017569	CTT	2	6	56635	56640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017569	TCT	2	6	56646	56651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017569	TAA	2	6	56704	56709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017569	AAT	2	6	56744	56749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017569	TAA	2	6	56770	56775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017569	CAG	2	6	56936	56941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017569	ATA	2	6	58539	58544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017569	ATT	2	6	63001	63006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017569	TTA	2	6	64801	64806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017569	ATT	2	6	72639	72644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017569	CTC	2	6	72862	72867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017569	AAT	2	6	73052	73057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017569	AAC	2	6	73067	73072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017569	TTA	2	6	73374	73379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017569	TAA	2	6	73583	73588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017569	CTT	3	9	73589	73597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017569	TAT	2	6	75548	75553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017569	ATA	2	6	79735	79740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017569	ATA	2	6	79757	79762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017569	AAT	3	9	79789	79797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017569	ATA	2	6	79809	79814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017569	ATC	2	6	79851	79856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017569	TGA	2	6	79880	79885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017569	ACC	2	6	79888	79893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017569	TAA	2	6	80972	80977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017569	TAG	2	6	81088	81093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017569	ATT	2	6	81915	81920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017569	CAA	2	6	81929	81934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017569	ATA	2	6	81937	81942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017569	CTT	2	6	81988	81993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017569	ACA	2	6	82695	82700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017569	ATT	2	6	82751	82756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017569	TAA	2	6	86732	86737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017569	TGA	2	6	89117	89122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017569	AAG	2	6	89317	89322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017569	ACC	2	6	89371	89376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017569	ATA	2	6	89870	89875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017569	TAA	2	6	90677	90682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017569	AAC	2	6	90767	90772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017569	ATC	2	6	90781	90786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017569	TAA	2	6	90853	90858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017569	TGT	2	6	90878	90883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017569	ACA	2	6	91500	91505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017569	TTG	2	6	91702	91707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017569	TAA	2	6	91869	91874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017569	GAA	2	6	91894	91899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017569	TTC	2	6	91910	91915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017569	AAT	2	6	91938	91943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017569	ATT	2	6	92449	92454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017569	GGA	2	6	95906	95911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017569	GTT	2	6	96148	96153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017569	TGT	2	6	96378	96383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017569	CAT	2	6	96432	96437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017569	TTA	2	6	96483	96488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017569	AAC	2	6	96523	96528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017569	TCT	2	6	96599	96604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017569	TAG	2	6	96702	96707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017569	GTA	2	6	96710	96715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017569	AAC	2	6	96736	96741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017569	AGT	2	6	96821	96826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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