MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 7224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017569	TCAAA	2	10	1159245	1159254	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4002	NC_017569	A	6	6	1159292	1159297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017569	TGT	2	6	1159376	1159381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017569	T	7	7	1159404	1159410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017569	CAT	2	6	1159433	1159438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_017569	CCA	2	6	1159450	1159455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_017569	CTT	2	6	1159460	1159465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_017569	TTG	2	6	1159479	1159484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017569	CT	4	8	1159497	1159504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4010	NC_017569	TC	3	6	1159517	1159522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_017569	T	6	6	1159529	1159534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017569	TTA	2	6	1159561	1159566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017569	T	7	7	1159593	1159599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017569	TAA	2	6	1159626	1159631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017569	CGG	2	6	1159646	1159651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_017569	GAG	2	6	1159680	1159685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017569	CTT	2	6	1159802	1159807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_017569	TTTA	2	8	1159875	1159882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017569	AGT	2	6	1159959	1159964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017569	T	7	7	1160011	1160017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017569	ATG	2	6	1160023	1160028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017569	TTA	2	6	1160041	1160046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017569	GTA	2	6	1160060	1160065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017569	TC	4	8	1160078	1160085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4025	NC_017569	ATA	2	6	1160101	1160106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017569	AGGA	2	8	1160136	1160143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017569	TTC	2	6	1160187	1160192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_017569	TTC	2	6	1160238	1160243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_017569	ATCA	2	8	1160247	1160254	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4030	NC_017569	AAAT	2	8	1160270	1160277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017569	T	6	6	1160300	1160305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017569	TTA	2	6	1162179	1162184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017569	ATA	2	6	1162199	1162204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017569	A	6	6	1162204	1162209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017569	T	6	6	1162232	1162237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017569	TTAT	2	8	1162243	1162250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017569	CTT	2	6	1162255	1162260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_017569	AG	3	6	1162267	1162272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017569	CAT	2	6	1162303	1162308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_017569	TATC	2	8	1162326	1162333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4041	NC_017569	AT	3	6	1162355	1162360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017569	AAT	2	6	1162414	1162419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017569	CTAG	2	8	1162478	1162485	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4044	NC_017569	CTA	2	6	1162539	1162544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_017569	CAG	2	6	1162560	1162565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017569	CTT	2	6	1162578	1162583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_017569	T	7	7	1162587	1162593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017569	TCC	2	6	1162725	1162730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4049	NC_017569	AT	3	6	1162836	1162841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017569	ATC	2	6	1162896	1162901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_017569	TCC	2	6	1162914	1162919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_017569	CCCTCT	2	12	1162951	1162962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_017569	TTTCT	2	10	1162977	1162986	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4054	NC_017569	T	6	6	1162986	1162991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017569	ACT	2	6	1163012	1163017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_017569	AAAC	2	8	1163047	1163054	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4057	NC_017569	TTTTAT	2	12	1163073	1163084	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017569	ATTGG	2	10	1163176	1163185	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017569	A	6	6	1163218	1163223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017569	T	7	7	1164641	1164647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017569	AAT	2	6	1168477	1168482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017569	GAA	2	6	1174874	1174879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017569	TCAAAT	2	12	1175636	1175647	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4064	NC_017569	TTGA	2	8	1178878	1178885	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017569	CTT	2	6	1178886	1178891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_017569	AATA	2	8	1178904	1178911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017569	T	7	7	1178924	1178930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017569	AG	3	6	1181137	1181142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017569	T	6	6	1182064	1182069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017569	TAA	2	6	1189397	1189402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017569	CTAA	2	8	1189408	1189415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4072	NC_017569	ATG	2	6	1189430	1189435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017569	TA	3	6	1191315	1191320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017569	TAT	2	6	1191887	1191892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017569	CT	3	6	1191928	1191933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4076	NC_017569	AAG	2	6	1193609	1193614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017569	A	7	7	1194164	1194170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_017569	ATT	2	6	1194192	1194197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017569	ATT	2	6	1194200	1194205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017569	CTT	2	6	1195715	1195720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_017569	T	7	7	1195732	1195738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017569	TTA	2	6	1195776	1195781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017569	A	7	7	1196531	1196537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017569	T	6	6	1196561	1196566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017569	ATT	2	6	1197032	1197037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017569	TAC	2	6	1197071	1197076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4088	NC_017569	AT	3	6	1198626	1198631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_017569	AAT	2	6	1199602	1199607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017569	CTT	2	6	1201438	1201443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4092	NC_017569	TGC	2	6	1202414	1202419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_017569	ATAA	2	8	1202435	1202442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017569	T	7	7	1202453	1202459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_017569	T	6	6	1202461	1202466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017569	T	6	6	1202469	1202474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017569	T	10	10	1202512	1202521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017569	A	7	7	1202523	1202529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017569	ATC	2	6	1204451	1204456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_017569	ATT	2	6	1205542	1205547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017569	A	6	6	1208746	1208751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017569	A	6	6	1208760	1208765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017569	A	7	7	1208787	1208793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017569	T	7	7	1211246	1211252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017569	T	6	6	1211255	1211260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017569	ATT	2	6	1213830	1213835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017569	AAT	2	6	1214120	1214125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017569	T	8	8	1214136	1214143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017569	AG	3	6	1214202	1214207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017569	A	6	6	1214233	1214238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017569	GGT	2	6	1216554	1216559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017569	AATG	2	8	1216570	1216577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017569	ATT	2	6	1216601	1216606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017569	AT	3	6	1216629	1216634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017569	AAAT	2	8	1216635	1216642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017569	TAT	2	6	1216646	1216651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017569	AGT	2	6	1216661	1216666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017569	A	6	6	1216711	1216716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017569	GTT	2	6	1217578	1217583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4121	NC_017569	TTA	2	6	1217625	1217630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017569	GTAA	2	8	1217731	1217738	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017569	TGC	2	6	1217813	1217818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_017569	TAG	2	6	1217833	1217838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017569	GCG	2	6	1217898	1217903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_017569	TGT	2	6	1217998	1218003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4128	NC_017569	GGT	2	6	1218122	1218127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017569	T	7	7	1219173	1219179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017569	AGAT	2	8	1219193	1219200	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_017569	A	7	7	1219234	1219240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017569	A	7	7	1219269	1219275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_017569	A	6	6	1219295	1219300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4135	NC_017569	TTTAC	2	10	1219530	1219539	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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