MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 7224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017569	ACC	2	6	998818	998823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_017569	CTC	2	6	998838	998843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_017569	TCT	2	6	998855	998860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_017569	TAT	2	6	998874	998879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_017569	ATT	2	6	999396	999401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_017569	T	7	7	999400	999406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_017569	ATG	2	6	999418	999423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_017569	ATT	3	9	1000147	1000155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_017569	T	6	6	1000172	1000177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_017569	ATA	2	6	1001950	1001955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_017569	ATTTTA	2	12	1001978	1001989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_017569	TA	3	6	1010383	1010388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_017569	TTA	2	6	1010397	1010402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_017569	ATT	2	6	1010502	1010507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_017569	CTT	2	6	1010522	1010527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_017569	T	6	6	1010551	1010556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_017569	TAAAAA	2	12	1011143	1011154	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_017569	T	7	7	1011184	1011190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_017569	T	6	6	1011192	1011197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_017569	A	6	6	1011214	1011219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_017569	T	6	6	1011231	1011236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_017569	TCC	2	6	1011241	1011246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_017569	TTA	2	6	1013334	1013339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_017569	TCT	2	6	1013369	1013374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_017569	GTT	2	6	1013383	1013388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_017569	TACAA	2	10	1013401	1013410	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3527	NC_017569	CCTACA	2	12	1013438	1013449	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_017569	TGT	2	6	1013472	1013477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_017569	T	7	7	1013601	1013607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_017569	T	6	6	1013640	1013645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_017569	AT	3	6	1015238	1015243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_017569	ATT	2	6	1015270	1015275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_017569	ATT	2	6	1015283	1015288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_017569	AAT	2	6	1015304	1015309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_017569	GCTAA	2	10	1015346	1015355	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3536	NC_017569	ACTT	2	8	1015413	1015420	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3537	NC_017569	ATT	3	9	1015455	1015463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_017569	T	7	7	1015497	1015503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_017569	TTAA	2	8	1017890	1017897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_017569	T	6	6	1019648	1019653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_017569	ATTT	2	8	1019676	1019683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_017569	CTA	2	6	1019708	1019713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_017569	T	6	6	1020220	1020225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_017569	CAA	2	6	1022895	1022900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_017569	A	6	6	1022937	1022942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_017569	AATTA	2	10	1022945	1022954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_017569	ATAA	2	8	1025984	1025991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_017569	CTT	2	6	1025995	1026000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_017569	T	6	6	1026016	1026021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_017569	A	6	6	1026115	1026120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_017569	AAAAC	2	10	1026129	1026138	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3552	NC_017569	GTTT	2	8	1026148	1026155	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_017569	AGT	2	6	1026160	1026165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_017569	T	6	6	1026207	1026212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_017569	GTT	2	6	1026227	1026232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_017569	T	7	7	1026248	1026254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_017569	CAT	2	6	1026262	1026267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_017569	TAGGA	2	10	1026287	1026296	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_017569	TTAT	2	8	1026297	1026304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_017569	CATAGC	2	12	1026358	1026369	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_017569	GTT	2	6	1026376	1026381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_017569	A	6	6	1026400	1026405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017569	TC	3	6	1026407	1026412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3564	NC_017569	ATT	2	6	1026426	1026431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_017569	T	7	7	1026454	1026460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_017569	AT	3	6	1026513	1026518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_017569	TTC	2	6	1026531	1026536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3569	NC_017569	ATA	2	6	1026650	1026655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_017569	GTTT	2	8	1026755	1026762	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_017569	TCA	2	6	1026778	1026783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_017569	GTA	2	6	1026859	1026864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_017569	TAT	2	6	1026872	1026877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_017569	AGAT	2	8	1026890	1026897	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_017569	AAG	2	6	1028305	1028310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3577	NC_017569	AAAC	2	8	1031881	1031888	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3578	NC_017569	AT	3	6	1031895	1031900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_017569	TTTA	2	8	1031912	1031919	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_017569	A	6	6	1031955	1031960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_017569	ATTTA	2	10	1033390	1033399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_017569	A	6	6	1033883	1033888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_017569	A	8	8	1033909	1033916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_017569	A	9	9	1033925	1033933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_017569	AT	3	6	1036115	1036120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_017569	ATA	2	6	1036522	1036527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_017569	TAA	2	6	1036531	1036536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_017569	A	6	6	1037341	1037346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_017569	ATA	2	6	1037355	1037360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_017569	ACC	2	6	1037365	1037370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3591	NC_017569	A	6	6	1037428	1037433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_017569	AAAAC	2	10	1037836	1037845	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3593	NC_017569	GACC	2	8	1040064	1040071	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3594	NC_017569	TAT	2	6	1040115	1040120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_017569	A	6	6	1040127	1040132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_017569	ATTTT	2	10	1040888	1040897	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_017569	T	6	6	1040894	1040899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_017569	TTA	2	6	1042460	1042465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_017569	A	6	6	1042465	1042470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_017569	CTT	2	6	1045584	1045589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_017569	CATTT	2	10	1045635	1045644	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3602	NC_017569	CATA	2	8	1045697	1045704	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3603	NC_017569	T	7	7	1045755	1045761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_017569	ATGA	2	8	1045762	1045769	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_017569	T	6	6	1045770	1045775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_017569	TTA	2	6	1045781	1045786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_017569	ATAA	2	8	1045790	1045797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_017569	ACT	2	6	1045798	1045803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_017569	TAC	2	6	1050818	1050823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_017569	TA	3	6	1051954	1051959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_017569	AAT	2	6	1051962	1051967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_017569	T	6	6	1052675	1052680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_017569	ATT	2	6	1052704	1052709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_017569	TCT	2	6	1052724	1052729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_017569	T	6	6	1052739	1052744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_017569	T	7	7	1052803	1052809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_017569	A	8	8	1052830	1052837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_017569	TAAC	2	8	1052856	1052863	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3619	NC_017569	TAA	2	6	1052864	1052869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_017569	T	6	6	1053512	1053517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_017569	A	7	7	1053524	1053530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_017569	A	6	6	1053848	1053853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_017569	T	8	8	1053892	1053899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_017569	TAAAA	2	10	1053914	1053923	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_017569	GAT	2	6	1058048	1058053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_017569	ACT	2	6	1058056	1058061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_017569	TATC	2	8	1058063	1058070	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3628	NC_017569	A	9	9	1058097	1058105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_017569	ATT	2	6	1058116	1058121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_017569	T	7	7	1058834	1058840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_017569	ATA	2	6	1060364	1060369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_017569	CAA	2	6	1060433	1060438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_017569	A	7	7	1060437	1060443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_017569	T	6	6	1060456	1060461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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