MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 7224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017569	TTG	2	6	282889	282894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017569	ATC	2	6	283071	283076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_017569	T	6	6	283095	283100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017569	A	6	6	283158	283163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017569	TTGAT	2	10	283185	283194	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017569	TTA	2	6	283211	283216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017569	TCT	2	6	283297	283302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017569	TTG	2	6	283304	283309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017569	T	6	6	283379	283384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017569	CTT	2	6	283399	283404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_017569	T	6	6	283428	283433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017569	AATT	2	8	283557	283564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017569	ATT	2	6	283575	283580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017569	T	6	6	283579	283584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017569	T	6	6	283606	283611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017569	ACA	2	6	283615	283620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_017569	GTT	2	6	283636	283641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017569	CTA	2	6	283732	283737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_017569	AGT	2	6	283895	283900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017569	TTC	2	6	283903	283908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_017569	GTC	2	6	284744	284749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_017569	TTG	2	6	284884	284889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017569	GTTC	2	8	284893	284900	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_017569	TTTTAT	2	12	285220	285231	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017569	T	6	6	285572	285577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017569	T	6	6	285605	285610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017569	TGT	2	6	285743	285748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017569	GTT	2	6	285755	285760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017569	T	6	6	285762	285767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017569	TA	3	6	285774	285779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017569	TAA	2	6	288113	288118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017569	GAT	2	6	288776	288781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017569	ATGT	2	8	288828	288835	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017569	TAA	2	6	288860	288865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017569	TTG	3	9	288898	288906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017569	TGAA	2	8	290374	290381	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017569	TAA	2	6	290399	290404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017569	T	6	6	290845	290850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1041	NC_017569	A	7	7	291045	291051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1044	NC_017569	T	7	7	291301	291307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017569	T	6	6	291368	291373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1051	NC_017569	TTGAA	2	10	291653	291662	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017569	TTCAA	2	10	292349	292358	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1053	NC_017569	T	6	6	292820	292825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017569	ATT	2	6	292826	292831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017569	TTGAA	2	10	293701	293710	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1058	NC_017569	TA	3	6	293811	293816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017569	T	7	7	293818	293824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1062	NC_017569	T	6	6	294350	294355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017569	CAACTC	2	12	294365	294376	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_017569	CAG	2	6	294428	294433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1069	NC_017569	TTA	2	6	294557	294562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017569	T	8	8	294582	294589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017569	TGG	2	6	294606	294611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1073	NC_017569	A	7	7	294633	294639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017569	CAA	2	6	294654	294659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1092	NC_017569	T	6	6	297161	297166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017569	T	8	8	297170	297177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017569	ACT	2	6	297265	297270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1099	NC_017569	TCTTTA	2	12	300230	300241	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1101	NC_017569	TGT	2	6	300335	300340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017569	T	7	7	300931	300937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017569	GTG	2	6	300942	300947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017569	T	6	6	301048	301053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017569	TTA	2	6	301317	301322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017569	T	6	6	301339	301344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017569	TTA	2	6	301419	301424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017569	AATC	2	8	301484	301491	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1110	NC_017569	GTA	2	6	301518	301523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1112	NC_017569	CGGG	2	8	302901	302908	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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1117	NC_017569	CTT	2	6	303778	303783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_017569	A	6	6	303836	303841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017569	TTG	2	6	303868	303873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017569	GTT	2	6	303881	303886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1122	NC_017569	CAAC	2	8	304526	304533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_017569	ATT	2	6	304563	304568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017569	TTGAA	2	10	304577	304586	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017569	TTCAA	2	10	304615	304624	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1126	NC_017569	TTA	2	6	305614	305619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1128	NC_017569	GTG	2	6	305734	305739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017569	T	6	6	305878	305883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017569	T	7	7	305928	305934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017569	T	6	6	305995	306000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017569	GTC	2	6	306032	306037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_017569	TTA	2	6	306102	306107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017569	T	6	6	306124	306129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017569	TTGAA	2	10	306281	306290	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017569	TGT	2	6	306358	306363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_017569	AGTTT	2	10	307481	307490	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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