MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 7224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_017569	TAT	2	6	2105536	2105541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_017569	CTT	2	6	2105559	2105564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_017569	A	8	8	2105571	2105578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_017569	A	7	7	2105580	2105586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_017569	GAAA	2	8	2105589	2105596	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_017569	T	6	6	2105601	2105606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_017569	AAT	2	6	2107426	2107431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_017569	ATT	2	6	2107455	2107460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_017569	TAG	2	6	2107466	2107471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_017569	A	6	6	2108062	2108067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_017569	ATT	2	6	2109110	2109115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_017569	TTC	2	6	2109271	2109276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_017569	CTT	2	6	2109277	2109282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_017569	AGC	2	6	2109314	2109319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_017569	TCT	2	6	2109438	2109443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_017569	T	7	7	2109446	2109452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_017569	TTC	2	6	2109623	2109628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_017569	TGCTCC	2	12	2109707	2109718	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7019	NC_017569	CTC	2	6	2109739	2109744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7022	NC_017569	AT	3	6	2109798	2109803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_017569	TATTG	2	10	2109892	2109901	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_017569	ATA	2	6	2109943	2109948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_017569	ATA	2	6	2109971	2109976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7032	NC_017569	ATA	2	6	2110180	2110185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_017569	CTT	2	6	2110205	2110210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7035	NC_017569	TC	3	6	2110326	2110331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7043	NC_017569	AAAG	2	8	2110520	2110527	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7046	NC_017569	A	9	9	2115061	2115069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_017569	TTGG	2	8	2115092	2115099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_017569	T	6	6	2115105	2115110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_017569	ATT	4	12	2115119	2115130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7051	NC_017569	TAA	2	6	2115149	2115154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_017569	TAT	2	6	2115158	2115163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7055	NC_017569	TA	4	8	2115258	2115265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_017569	ATT	2	6	2115271	2115276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_017569	ATAA	2	8	2115299	2115306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_017569	AT	3	6	2115309	2115314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_017569	TAC	2	6	2115322	2115327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7061	NC_017569	ATT	3	9	2115378	2115386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_017569	T	7	7	2115403	2115409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_017569	TAT	2	6	2116852	2116857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_017569	T	7	7	2116878	2116884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_017569	ATC	2	6	2116893	2116898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7067	NC_017569	TTTA	2	8	2120194	2120201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7071	NC_017569	TA	3	6	2120961	2120966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_017569	ATAAA	2	10	2123856	2123865	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7080	NC_017569	A	7	7	2125654	2125660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7094	NC_017569	A	8	8	2127023	2127030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_017569	AGTGA	2	10	2127036	2127045	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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7101	NC_017569	TA	4	8	2127184	2127191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_017569	TATT	2	8	2127210	2127217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_017569	TGAA	2	8	2127241	2127248	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_017569	ATT	2	6	2127262	2127267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_017569	A	8	8	2127272	2127279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7107	NC_017569	AAC	2	6	2127614	2127619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7108	NC_017569	ATA	2	6	2127677	2127682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7111	NC_017569	A	6	6	2127828	2127833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7127	NC_017569	TA	3	6	2131699	2131704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7130	NC_017569	T	7	7	2131778	2131784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_017569	A	6	6	2131813	2131818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7132	NC_017569	CTA	2	6	2132081	2132086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.