MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 7224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017569	TGTTT	2	10	1380023	1380032	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_017569	A	6	6	1380083	1380088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_017569	AAT	2	6	1380093	1380098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_017569	A	6	6	1380139	1380144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_017569	A	6	6	1381683	1381688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_017569	TTA	2	6	1381689	1381694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_017569	TCA	2	6	1381715	1381720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_017569	T	7	7	1383323	1383329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_017569	TTC	2	6	1383333	1383338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_017569	AAC	2	6	1383364	1383369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_017569	ATT	2	6	1383400	1383405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_017569	T	6	6	1383419	1383424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_017569	A	6	6	1383445	1383450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_017569	A	7	7	1383456	1383462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_017569	ATT	2	6	1383467	1383472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_017569	CTT	2	6	1384463	1384468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_017569	ATA	2	6	1384472	1384477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_017569	TTTTG	2	10	1384504	1384513	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_017569	ATT	2	6	1385646	1385651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_017569	ATC	2	6	1388780	1388785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_017569	TCT	2	6	1388891	1388896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_017569	AAC	2	6	1388972	1388977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_017569	GAG	2	6	1389058	1389063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_017569	TGG	2	6	1389081	1389086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_017569	T	6	6	1389093	1389098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_017569	A	7	7	1389100	1389106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_017569	TTCT	2	8	1389120	1389127	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4530	NC_017569	TCT	2	6	1389313	1389318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4532	NC_017569	TCT	2	6	1389412	1389417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4534	NC_017569	TAA	2	6	1389944	1389949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_017569	A	6	6	1389948	1389953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_017569	TTG	2	6	1389991	1389996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_017569	T	7	7	1397653	1397659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_017569	TCTT	2	8	1397669	1397676	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4539	NC_017569	TTA	2	6	1397680	1397685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4542	NC_017569	ATA	2	6	1397717	1397722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_017569	AG	3	6	1397723	1397728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_017569	CT	3	6	1397743	1397748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4545	NC_017569	TGAAAA	2	12	1397769	1397780	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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4549	NC_017569	TCT	2	6	1402291	1402296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4552	NC_017569	ATT	2	6	1402371	1402376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_017569	ATTAT	2	10	1402388	1402397	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_017569	ATT	2	6	1402442	1402447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_017569	T	6	6	1402456	1402461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_017569	A	7	7	1402506	1402512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_017569	T	6	6	1406293	1406298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_017569	T	7	7	1406329	1406335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_017569	GAAA	2	8	1407867	1407874	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4561	NC_017569	AT	3	6	1408615	1408620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_017569	A	6	6	1409242	1409247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_017569	T	6	6	1409375	1409380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_017569	TAAG	2	8	1409393	1409400	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_017569	TAT	2	6	1409401	1409406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_017569	TTA	2	6	1410151	1410156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_017569	TTAT	2	8	1410169	1410176	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_017569	TA	3	6	1410203	1410208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_017569	AAT	2	6	1410228	1410233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_017569	AT	3	6	1410313	1410318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_017569	TA	3	6	1410334	1410339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_017569	ATTCT	2	10	1410340	1410349	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4573	NC_017569	A	6	6	1410372	1410377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_017569	ATT	2	6	1410389	1410394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4577	NC_017569	AAT	2	6	1413177	1413182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4579	NC_017569	TAA	2	6	1415198	1415203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_017569	GTAG	2	8	1415208	1415215	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_017569	TAT	2	6	1415216	1415221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_017569	AT	3	6	1415220	1415225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4584	NC_017569	TA	3	6	1415276	1415281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_017569	A	7	7	1415290	1415296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_017569	GA	3	6	1415354	1415359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4590	NC_017569	T	6	6	1415463	1415468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_017569	A	8	8	1415488	1415495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4594	NC_017569	ATA	2	6	1415814	1415819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_017569	CGG	2	6	1415852	1415857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4598	NC_017569	CTT	2	6	1416070	1416075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_017569	CAG	2	6	1416150	1416155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_017569	GTG	2	6	1416232	1416237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_017569	AGT	2	6	1416310	1416315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_017569	GAT	2	6	1416591	1416596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_017569	TTC	2	6	1416653	1416658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_017569	TGC	2	6	1416674	1416679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_017569	GTC	2	6	1416686	1416691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_017569	CAT	2	6	1416754	1416759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_017569	ATC	2	6	1416822	1416827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_017569	CA	3	6	1416848	1416853	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4609	NC_017569	AC	3	6	1417018	1417023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_017569	CTTA	2	8	1417197	1417204	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4611	NC_017569	T	7	7	1417217	1417223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_017569	TGGT	2	8	1417226	1417233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_017569	AAGA	2	8	1417272	1417279	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_017569	ACT	2	6	1417428	1417433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_017569	GCCT	2	8	1417474	1417481	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4616	NC_017569	AGG	2	6	1417489	1417494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_017569	ATTTA	2	10	1417534	1417543	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_017569	ACA	2	6	1417566	1417571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_017569	AGCG	2	8	1417590	1417597	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4620	NC_017569	GAAA	2	8	1417682	1417689	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_017569	CGA	2	6	1417729	1417734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_017569	CA	3	6	1417771	1417776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4623	NC_017569	GGA	2	6	1417878	1417883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_017569	AGT	2	6	1417907	1417912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_017569	GCGA	2	8	1417914	1417921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4626	NC_017569	TA	3	6	1417943	1417948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_017569	GAT	2	6	1418018	1418023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_017569	G	6	6	1418064	1418069	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_017569	TCC	2	6	1418074	1418079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4630	NC_017569	AGC	2	6	1418196	1418201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4632	NC_017569	TAGT	2	8	1418315	1418322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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