MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 7647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017560	AGC	2	6	579754	579759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_017560	AT	3	6	579760	579765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017560	TTATT	2	10	579823	579832	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017560	AACA	2	8	579836	579843	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4005	NC_017560	AAT	2	6	579859	579864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017560	ATG	2	6	579884	579889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017560	TA	3	6	579937	579942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017560	T	6	6	579966	579971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017560	A	6	6	579994	579999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017560	ATAC	2	8	580016	580023	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4011	NC_017560	T	6	6	580032	580037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017560	TA	4	8	580041	580048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017560	A	6	6	580083	580088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017560	TCT	2	6	580126	580131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_017560	TAT	3	9	580132	580140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017560	AAAGCA	2	12	580142	580153	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4017	NC_017560	TAA	2	6	580219	580224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017560	A	6	6	580223	580228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017560	GCA	2	6	580233	580238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_017560	A	6	6	580321	580326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017560	TTTA	2	8	580329	580336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017560	AT	3	6	580352	580357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017560	ATTA	2	8	580391	580398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017560	TAG	2	6	580438	580443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017560	ATT	2	6	581412	581417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017560	TG	4	8	581449	581456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017560	TA	3	6	581475	581480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017560	TTA	2	6	581486	581491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017560	ATA	2	6	581502	581507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017560	TAA	2	6	581623	581628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017560	A	6	6	581627	581632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017560	GTG	2	6	581639	581644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017560	TAAA	2	8	581656	581663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017560	AAT	2	6	581811	581816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017560	TTTTA	2	10	582855	582864	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017560	TTA	2	6	582897	582902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017560	ATT	2	6	582908	582913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017560	TAA	2	6	582915	582920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017560	ATA	2	6	583654	583659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017560	TA	3	6	583666	583671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017560	TAT	2	6	583680	583685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017560	ATT	2	6	583699	583704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017560	ATT	2	6	584163	584168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017560	CAA	2	6	584264	584269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_017560	TGT	2	6	584291	584296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017560	GTA	2	6	584376	584381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017560	TA	3	6	584445	584450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017560	TAA	2	6	584464	584469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017560	AAAT	2	8	584495	584502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017560	AAT	2	6	584514	584519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017560	TG	3	6	585298	585303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017560	ATC	2	6	585321	585326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_017560	GATT	2	8	585337	585344	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017560	ATA	2	6	585353	585358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017560	GAAT	2	8	585359	585366	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017560	ATA	3	9	587883	587891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017560	TAT	2	6	587899	587904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017560	TATAA	2	10	588001	588010	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017560	ATT	2	6	588085	588090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017560	TGTTT	2	10	588101	588110	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017560	TA	3	6	589509	589514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017560	TTA	2	6	589536	589541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017560	AAT	2	6	589544	589549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017560	AT	3	6	589548	589553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017560	TAA	2	6	589799	589804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017560	GTT	2	6	589810	589815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017560	A	6	6	589819	589824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4069	NC_017560	A	6	6	594915	594920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017560	TAT	2	6	596029	596034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4072	NC_017560	AATA	2	8	596157	596164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017560	TA	3	6	597962	597967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017560	CAA	2	6	597968	597973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_017560	TAT	2	6	598025	598030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4077	NC_017560	ACT	2	6	599403	599408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4079	NC_017560	ATT	2	6	599469	599474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017560	TTATA	2	10	600246	600255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4082	NC_017560	ACA	2	6	602751	602756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4084	NC_017560	ATT	2	6	603058	603063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017560	TAAAT	2	10	603081	603090	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4088	NC_017560	CTT	2	6	604024	604029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4092	NC_017560	TA	3	6	604192	604197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017560	AT	3	6	604208	604213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4095	NC_017560	ATT	2	6	604229	604234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4099	NC_017560	AAT	2	6	604400	604405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4102	NC_017560	AGTA	2	8	605230	605237	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017560	ATC	2	6	605243	605248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_017560	TAT	2	6	605270	605275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017560	ATT	2	6	605317	605322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017560	T	6	6	605340	605345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017560	TTAT	2	8	605440	605447	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017560	TAAA	2	8	605521	605528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017560	TGG	2	6	605565	605570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017560	TTG	2	6	605588	605593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4113	NC_017560	ATC	2	6	605745	605750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4115	NC_017560	ATT	2	6	605860	605865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017560	AC	3	6	605868	605873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_017560	TAA	2	6	605890	605895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017560	AAAG	2	8	605920	605927	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017560	CTA	2	6	605947	605952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_017560	T	7	7	605953	605959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017560	GTA	2	6	605977	605982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4124	NC_017560	ACA	2	6	608791	608796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_017560	ATT	2	6	608831	608836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017560	CTG	2	6	608878	608883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_017560	T	6	6	608914	608919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017560	TCA	2	6	608932	608937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_017560	TATT	2	8	608961	608968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017560	T	7	7	608976	608982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_017560	TGG	2	6	609000	609005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017560	ATTTTG	2	12	609029	609040	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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4134	NC_017560	ACT	2	6	609073	609078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4135	NC_017560	TTTG	2	8	609121	609128	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_017560	ATT	2	6	609140	609145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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