MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 7647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017560	TAA	2	6	220958	220963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017560	TTC	2	6	221029	221034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_017560	GATT	2	8	221133	221140	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017560	ATA	2	6	221141	221146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017560	CTT	2	6	221218	221223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_017560	ATT	2	6	221271	221276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017560	TAT	2	6	221312	221317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017560	AT	4	8	221348	221355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017560	ATA	3	9	221369	221377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017560	GGA	2	6	221381	221386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017560	GTT	2	6	222554	222559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017560	ACG	2	6	222564	222569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_017560	A	6	6	222603	222608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017560	AAC	2	6	222641	222646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_017560	ACA	2	6	222653	222658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_017560	TGT	2	6	224751	224756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017560	CAA	2	6	224774	224779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_017560	ATT	2	6	224788	224793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017560	TAT	2	6	224795	224800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017560	TGC	2	6	224820	224825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_017560	A	6	6	224854	224859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017560	TATT	2	8	224882	224889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017560	AAT	2	6	224908	224913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017560	TCT	2	6	224926	224931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_017560	A	6	6	224962	224967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017560	ATG	2	6	225008	225013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017560	AGT	2	6	225019	225024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017560	TTA	2	6	225041	225046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017560	TA	3	6	225064	225069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017560	TGT	2	6	225084	225089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017560	TGG	2	6	225090	225095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017560	AG	3	6	225198	225203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017560	TTTC	2	8	225305	225312	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1534	NC_017560	TTAT	2	8	225321	225328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017560	TTA	2	6	225374	225379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017560	TAC	2	6	225387	225392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_017560	TGG	2	6	225393	225398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017560	TAT	2	6	225446	225451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017560	TGG	2	6	225453	225458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017560	A	6	6	225519	225524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017560	TAA	2	6	225525	225530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017560	AAT	2	6	225555	225560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017560	TAAA	2	8	225578	225585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017560	CAT	2	6	225595	225600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_017560	AT	3	6	225627	225632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017560	AAAT	2	8	225633	225640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017560	TAG	2	6	225648	225653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017560	ATT	2	6	225724	225729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017560	GGC	2	6	225755	225760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_017560	ATT	2	6	225769	225774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017560	A	6	6	225835	225840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017560	ATG	2	6	225864	225869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017560	AAT	2	6	225875	225880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017560	GAT	2	6	225892	225897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017560	TGG	2	6	225904	225909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017560	T	6	6	225917	225922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017560	GAT	2	6	225929	225934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017560	TAA	2	6	225943	225948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017560	AGCGT	2	10	225974	225983	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1560	NC_017560	GTA	2	6	225996	226001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017560	T	6	6	226022	226027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017560	TGAAA	2	10	226066	226075	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017560	TGA	2	6	226096	226101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017560	TTA	2	6	226122	226127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017560	TTA	2	6	226171	226176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017560	ATGAT	2	10	226215	226224	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017560	TTAT	2	8	226261	226268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017560	AAT	2	6	226324	226329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017560	ATA	2	6	226338	226343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017560	A	6	6	226350	226355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017560	CAT	2	6	226390	226395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_017560	AGA	2	6	226424	226429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017560	ATT	2	6	226433	226438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017560	AATCTT	2	12	226442	226453	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1575	NC_017560	ATTT	2	8	226504	226511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017560	TGA	2	6	226534	226539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017560	TGA	2	6	226549	226554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1579	NC_017560	TTA	2	6	226611	226616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017560	ATGTG	2	10	226618	226627	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017560	AAT	2	6	226682	226687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017560	TAA	2	6	226691	226696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017560	TTA	2	6	226715	226720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017560	TGA	2	6	226766	226771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017560	TAT	2	6	226784	226789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017560	AT	3	6	226825	226830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_017560	GTA	2	6	226833	226838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017560	TAAT	2	8	226858	226865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017560	ATA	2	6	226889	226894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017560	A	7	7	226916	226922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1592	NC_017560	TAAT	2	8	226951	226958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_017560	ATG	2	6	226963	226968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1596	NC_017560	ATA	2	6	227014	227019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_017560	T	6	6	227077	227082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017560	TAA	2	6	227118	227123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_017560	TTTC	2	8	227174	227181	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1602	NC_017560	TTA	2	6	227201	227206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017560	A	6	6	227211	227216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017560	ATA	2	6	227229	227234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017560	AG	3	6	228693	228698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017560	AGTA	2	8	228722	228729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_017560	ATT	2	6	229419	229424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017560	T	7	7	229447	229453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017560	GATT	2	8	229456	229463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1611	NC_017560	GCT	2	6	229509	229514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_017560	ACA	2	6	229520	229525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1614	NC_017560	CAA	2	6	229608	229613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_017560	ATT	2	6	229628	229633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017560	ATA	2	6	229656	229661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017560	TAA	3	9	229691	229699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017560	ATTA	2	8	229896	229903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017560	ATAAA	2	10	229911	229920	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017560	ATTA	2	8	230822	230829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017560	TA	3	6	230857	230862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017560	ATT	2	6	230875	230880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017560	T	6	6	230879	230884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017560	TATCA	2	10	231288	231297	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1625	NC_017560	GCTA	2	8	231367	231374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1626	NC_017560	TAT	2	6	231430	231435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017560	AT	3	6	231460	231465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017560	ATTA	2	8	232160	232167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017560	ATT	2	6	232170	232175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017560	A	6	6	232179	232184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017560	ATA	2	6	232199	232204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017560	ATT	2	6	232214	232219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017560	CTG	2	6	233078	233083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_017560	ATA	2	6	233116	233121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_017560	TA	4	8	233120	233127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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