MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 7647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017560	TAT	2	6	912333	912338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_017560	ATA	2	6	912360	912365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_017560	ATT	2	6	912400	912405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_017560	CAT	2	6	912433	912438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_017560	ATATC	2	10	912499	912508	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6506	NC_017560	GTT	2	6	912510	912515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_017560	TGATT	2	10	912538	912547	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_017560	CAA	2	6	912553	912558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_017560	T	6	6	912587	912592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_017560	TTA	2	6	913102	913107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_017560	A	6	6	914359	914364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_017560	TTAAG	2	10	914379	914388	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_017560	ACT	2	6	914446	914451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_017560	ACC	2	6	914658	914663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6515	NC_017560	T	6	6	914691	914696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_017560	A	8	8	914726	914733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_017560	TAC	2	6	914734	914739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_017560	T	6	6	914745	914750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_017560	AT	3	6	914791	914796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_017560	CAA	2	6	914857	914862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_017560	CAG	2	6	914875	914880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_017560	TAA	2	6	914909	914914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_017560	GAC	2	6	914915	914920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_017560	GCA	2	6	914921	914926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_017560	TGG	2	6	914950	914955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_017560	TTA	2	6	915005	915010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_017560	TTAA	2	8	915047	915054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_017560	TAA	2	6	915104	915109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_017560	TAA	2	6	917298	917303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_017560	TAAT	2	8	918062	918069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_017560	A	6	6	918091	918096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_017560	ATA	2	6	920592	920597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_017560	TAT	2	6	920663	920668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_017560	ACAA	2	8	920685	920692	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6535	NC_017560	ACT	2	6	920707	920712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_017560	ATT	2	6	920723	920728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_017560	TAC	2	6	920729	920734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6539	NC_017560	TAA	2	6	920801	920806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_017560	CAGT	2	8	920920	920927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6541	NC_017560	TTTTA	2	10	920945	920954	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_017560	T	7	7	920971	920977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_017560	TAAA	2	8	920981	920988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_017560	TA	3	6	920991	920996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_017560	CTTT	2	8	921012	921019	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6546	NC_017560	T	6	6	921030	921035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_017560	AT	3	6	921073	921078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_017560	TAG	2	6	921098	921103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_017560	AT	3	6	921162	921167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_017560	TAT	2	6	921181	921186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_017560	AT	3	6	921189	921194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_017560	ATAA	2	8	921199	921206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_017560	T	7	7	921220	921226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_017560	TCTTTT	2	12	921250	921261	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6555	NC_017560	TAA	2	6	921265	921270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_017560	AAGC	2	8	921281	921288	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6557	NC_017560	ATT	2	6	921310	921315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_017560	TA	3	6	921332	921337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_017560	AT	3	6	921357	921362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_017560	T	6	6	921383	921388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_017560	GTT	2	6	921421	921426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_017560	TAG	3	9	921485	921493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_017560	A	6	6	921536	921541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_017560	A	6	6	921562	921567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_017560	TAA	2	6	921597	921602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_017560	ATA	2	6	921612	921617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_017560	TAA	2	6	922667	922672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_017560	AAT	2	6	922676	922681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_017560	T	6	6	922686	922691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_017560	AAT	2	6	922698	922703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6572	NC_017560	TAG	2	6	922786	922791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6575	NC_017560	TGA	2	6	922946	922951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6580	NC_017560	TA	3	6	923095	923100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_017560	TTA	2	6	923125	923130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6583	NC_017560	TAA	2	6	923146	923151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_017560	ATA	2	6	923192	923197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6586	NC_017560	AGT	2	6	923205	923210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6589	NC_017560	ATT	2	6	923275	923280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6602	NC_017560	ATC	2	6	923601	923606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6605	NC_017560	TAT	2	6	923691	923696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6610	NC_017560	CAAT	2	8	923811	923818	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6615	NC_017560	ATT	2	6	923955	923960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6627	NC_017560	ATA	2	6	926541	926546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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