MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 10210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017559	GCC	2	6	1359711	1359716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_017559	CGG	2	6	1359761	1359766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_017559	ATC	2	6	1359829	1359834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_017559	CCAT	2	8	1359885	1359892	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_017559	AG	3	6	1359932	1359937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017559	T	6	6	1359949	1359954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017559	AGCC	2	8	1363321	1363328	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4008	NC_017559	T	7	7	1363340	1363346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017559	GCC	2	6	1363388	1363393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_017559	GT	3	6	1363394	1363399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017559	TCT	2	6	1365018	1365023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_017559	GC	3	6	1365025	1365030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4013	NC_017559	GTC	2	6	1365058	1365063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_017559	TGA	2	6	1365111	1365116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017559	CTA	2	6	1365118	1365123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_017559	GTC	2	6	1365125	1365130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_017559	A	7	7	1365258	1365264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017559	GCC	2	6	1365266	1365271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_017559	CAC	2	6	1365278	1365283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_017559	GCC	2	6	1365318	1365323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_017559	GC	3	6	1366933	1366938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_017559	GCC	2	6	1367010	1367015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_017559	GCCAG	2	10	1367068	1367077	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4024	NC_017559	GCG	2	6	1367102	1367107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_017559	CCT	2	6	1367640	1367645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4026	NC_017559	GTC	2	6	1369007	1369012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_017559	CGG	2	6	1369013	1369018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_017559	G	7	7	1369017	1369023	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017559	ATC	2	6	1369080	1369085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_017559	CGG	3	9	1369101	1369109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_017559	T	6	6	1369488	1369493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017559	GGC	2	6	1369567	1369572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_017559	AC	3	6	1369640	1369645	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_017559	GCAA	2	8	1369687	1369694	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4035	NC_017559	GC	3	6	1369699	1369704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_017559	T	7	7	1371928	1371934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017559	CCA	2	6	1371956	1371961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_017559	CGAC	2	8	1371965	1371972	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4039	NC_017559	GCC	2	6	1373993	1373998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_017559	AAC	3	9	1374039	1374047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_017559	CCGT	2	8	1374811	1374818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4042	NC_017559	ATT	2	6	1374842	1374847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017559	GA	3	6	1374848	1374853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017559	GC	3	6	1375226	1375231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4045	NC_017559	CG	3	6	1375232	1375237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4046	NC_017559	T	6	6	1375265	1375270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017559	GAA	2	6	1375366	1375371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017559	T	6	6	1375375	1375380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017559	GTG	2	6	1375393	1375398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017559	GTT	2	6	1375498	1375503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017559	ACG	2	6	1375526	1375531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_017559	CGT	2	6	1375544	1375549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_017559	GCC	2	6	1375589	1375594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4056	NC_017559	AAC	2	6	1378369	1378374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_017559	ACGC	2	8	1378412	1378419	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4058	NC_017559	GCG	2	6	1384243	1384248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_017559	CTC	2	6	1384275	1384280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4061	NC_017559	GCG	2	6	1384296	1384301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_017559	GCC	2	6	1384309	1384314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_017559	CGC	2	6	1385318	1385323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4064	NC_017559	CA	3	6	1385327	1385332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4065	NC_017559	AAG	2	6	1385334	1385339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017559	CGG	2	6	1390379	1390384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4070	NC_017559	CG	3	6	1391445	1391450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4071	NC_017559	CG	3	6	1391983	1391988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4072	NC_017559	CCG	2	6	1392020	1392025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4073	NC_017559	CGG	2	6	1392033	1392038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4076	NC_017559	CCGCGC	2	12	1394462	1394473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4079	NC_017559	T	8	8	1395545	1395552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017559	CCTG	2	8	1395590	1395597	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4081	NC_017559	CCA	2	6	1395727	1395732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_017559	GCGG	2	8	1397012	1397019	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4083	NC_017559	GCCG	2	8	1397033	1397040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4084	NC_017559	CGGC	2	8	1401516	1401523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4085	NC_017559	ATG	2	6	1401532	1401537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4088	NC_017559	CG	3	6	1401647	1401652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_017559	GGGC	2	8	1401656	1401663	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4090	NC_017559	GCCC	2	8	1402465	1402472	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4091	NC_017559	AG	3	6	1402488	1402493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017559	ACCA	2	8	1402811	1402818	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4093	NC_017559	GC	3	6	1403454	1403459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_017559	CGG	2	6	1407465	1407470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_017559	CGGGG	2	10	1407510	1407519	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4096	NC_017559	TCG	2	6	1407530	1407535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_017559	CGAC	2	8	1407547	1407554	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4098	NC_017559	CG	3	6	1407561	1407566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4099	NC_017559	G	6	6	1407575	1407580	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017559	TGC	2	6	1407585	1407590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_017559	CTTTT	2	10	1407613	1407622	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4102	NC_017559	TTC	2	6	1407623	1407628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_017559	GACTT	2	10	1407669	1407678	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4104	NC_017559	GTTT	2	8	1407724	1407731	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017559	GA	3	6	1407767	1407772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017559	CT	4	8	1407951	1407958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4107	NC_017559	ATG	2	6	1408048	1408053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017559	CAT	2	6	1408071	1408076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_017559	GCC	2	6	1408094	1408099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4110	NC_017559	GT	3	6	1408101	1408106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017559	GCAA	2	8	1408114	1408121	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4112	NC_017559	CATC	2	8	1408189	1408196	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4113	NC_017559	GGC	2	6	1408251	1408256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_017559	TCG	3	9	1408278	1408286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_017559	GAT	2	6	1408296	1408301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017559	GGC	2	6	1408310	1408315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_017559	CGGCG	2	10	1408334	1408343	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4118	NC_017559	A	8	8	1408419	1408426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017559	G	6	6	1408436	1408441	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017559	GAC	2	6	1408447	1408452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_017559	GTG	2	6	1408472	1408477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017559	CG	3	6	1408495	1408500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_017559	A	6	6	1408541	1408546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017559	GCA	2	6	1409500	1409505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_017559	GCC	2	6	1410103	1410108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_017559	CGG	2	6	1410153	1410158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_017559	GGC	2	6	1410175	1410180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_017559	CG	3	6	1410425	1410430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4129	NC_017559	GATG	2	8	1410548	1410555	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017559	CG	3	6	1410575	1410580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4131	NC_017559	GCCGC	2	10	1411248	1411257	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4132	NC_017559	ATGGG	2	10	1411265	1411274	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_017559	GGC	2	6	1411290	1411295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_017559	GCGG	2	8	1411296	1411303	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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4432	NC_017559	CGG	2	6	1512224	1512229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4454	NC_017559	C	6	6	1517195	1517200	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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