MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 10210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017559	CCCA	2	8	279072	279079	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1002	NC_017559	GCATT	2	10	279105	279114	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1003	NC_017559	AG	3	6	279150	279155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017559	T	6	6	282199	282204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017559	GAT	2	6	282207	282212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017559	GTT	2	6	282215	282220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017559	ACG	2	6	282228	282233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017559	TCA	2	6	282235	282240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_017559	TCC	2	6	285121	285126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_017559	GA	3	6	285154	285159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017559	GCT	2	6	285178	285183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017559	ATGAGA	2	12	285187	285198	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017559	CCG	2	6	285248	285253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_017559	CCG	2	6	285258	285263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_017559	GCG	2	6	285269	285274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_017559	GC	3	6	286548	286553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_017559	CGCGG	2	10	286554	286563	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1018	NC_017559	CGTGGC	2	12	286575	286586	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_017559	GC	3	6	286599	286604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_017559	CG	3	6	286612	286617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_017559	GGC	2	6	286633	286638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_017559	CCG	2	6	286651	286656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_017559	TGC	2	6	286664	286669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017559	CGC	2	6	286708	286713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_017559	GCG	2	6	286722	286727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_017559	ATTGGC	2	12	287292	287303	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1027	NC_017559	CGGAA	2	10	287325	287334	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1028	NC_017559	GC	3	6	287350	287355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_017559	CGT	2	6	287358	287363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_017559	GCG	2	6	287878	287883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_017559	CG	3	6	287903	287908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_017559	CCGC	2	8	287909	287916	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1033	NC_017559	GCGA	2	8	287931	287938	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_017559	TGCG	2	8	288071	288078	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_017559	GTGTGC	2	12	288093	288104	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1036	NC_017559	GGTG	2	8	289107	289114	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017559	GC	3	6	289159	289164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_017559	GGCCG	2	10	290239	290248	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1039	NC_017559	CGCC	2	8	292187	292194	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1040	NC_017559	CGG	2	6	292200	292205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_017559	GT	3	6	292209	292214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017559	CGG	3	9	292323	292331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_017559	ACG	2	6	292382	292387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_017559	GCC	2	6	292393	292398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_017559	GCCG	2	8	293963	293970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_017559	CGC	2	6	293976	293981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_017559	CGGC	2	8	296248	296255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_017559	GGTTG	2	10	297749	297758	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017559	ATG	2	6	297769	297774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017559	CAA	2	6	297879	297884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_017559	A	6	6	297883	297888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017559	TG	3	6	301514	301519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017559	ACA	2	6	301532	301537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_017559	GCC	2	6	301551	301556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_017559	CTT	2	6	301564	301569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_017559	GCCG	2	8	301576	301583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_017559	ATT	2	6	302033	302038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017559	CCG	3	9	302040	302048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_017559	CG	3	6	302075	302080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_017559	AGC	2	6	302090	302095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_017559	CGG	2	6	302100	302105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_017559	CG	3	6	302106	302111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_017559	GGC	2	6	302128	302133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_017559	CTC	2	6	302839	302844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_017559	CGA	2	6	302865	302870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_017559	CA	3	6	302900	302905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_017559	CGC	2	6	304401	304406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_017559	CAGG	2	8	304408	304415	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_017559	TCAA	2	8	307429	307436	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_017559	GTCG	2	8	307443	307450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_017559	GCC	2	6	307451	307456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_017559	CGC	2	6	307477	307482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_017559	CTC	2	6	314420	314425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_017559	GCC	2	6	314549	314554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_017559	GA	3	6	317732	317737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017559	G	6	6	317749	317754	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017559	GCCG	2	8	317804	317811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_017559	GGC	2	6	317858	317863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_017559	TCCG	2	8	318580	318587	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_017559	GCG	2	6	318598	318603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_017559	CG	4	8	318602	318609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_017559	GTCAT	2	10	318618	318627	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1083	NC_017559	CG	4	8	318655	318662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_017559	CGGC	2	8	319294	319301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_017559	CAA	2	6	319307	319312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_017559	A	6	6	319311	319316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017559	CCT	2	6	320486	320491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_017559	GCG	2	6	320499	320504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_017559	CACG	2	8	320554	320561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_017559	CCT	2	6	320582	320587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_017559	CAA	2	6	320632	320637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_017559	GCC	2	6	321155	321160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_017559	CGGA	2	8	321218	321225	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_017559	CTG	2	6	321243	321248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_017559	GGC	2	6	321318	321323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_017559	A	6	6	321367	321372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017559	CT	3	6	321457	321462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_017559	ATT	2	6	321525	321530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017559	CAGC	2	8	321554	321561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_017559	GTC	2	6	323565	323570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_017559	CCG	2	6	323589	323594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_017559	CCGGC	2	10	323601	323610	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1103	NC_017559	GC	3	6	323609	323614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_017559	GGT	2	6	324029	324034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017559	TAC	2	6	324056	324061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_017559	GCC	2	6	324062	324067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_017559	CGGC	2	8	324102	324109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_017559	CTT	3	9	324643	324651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_017559	GCC	2	6	324684	324689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_017559	TCA	2	6	324713	324718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_017559	GC	3	6	324749	324754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_017559	AGGC	2	8	324764	324771	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_017559	CG	3	6	324779	324784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_017559	A	8	8	324789	324796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017559	CTTG	2	8	324817	324824	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_017559	GCG	3	9	324825	324833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017559	GC	3	6	324838	324843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_017559	GCG	2	6	325579	325584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_017559	CAT	2	6	325654	325659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_017559	GTG	2	6	325694	325699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017559	TGC	2	6	325789	325794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_017559	CGA	2	6	325833	325838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_017559	CAC	2	6	325847	325852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_017559	CGCGC	2	10	325875	325884	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1125	NC_017559	CCT	2	6	325924	325929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_017559	CTT	2	6	326509	326514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_017559	CG	3	6	328443	328448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_017559	CA	3	6	329303	329308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_017559	GAG	2	6	329311	329316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017559	GAA	2	6	329324	329329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017559	AGG	2	6	329333	329338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017559	GCG	2	6	329347	329352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_017559	CGG	2	6	329356	329361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_017559	CTTC	2	8	329371	329378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_017559	CGGC	2	8	329387	329394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_017559	GGC	2	6	330210	330215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1138	NC_017559	CCG	2	6	330325	330330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1269	NC_017559	CGG	2	6	364510	364515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1270	NC_017559	G	6	6	364527	364532	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1271	NC_017559	TGC	2	6	364543	364548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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