MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 10210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017559	CG	3	6	164882	164887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_017559	GAG	2	6	164974	164979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017559	ATGC	2	8	164981	164988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
504	NC_017559	GC	3	6	165010	165015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_017559	GC	4	8	166604	166611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
506	NC_017559	CGC	2	6	166616	166621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_017559	GC	3	6	166620	166625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
508	NC_017559	CTC	2	6	166650	166655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_017559	GCG	2	6	167902	167907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017559	GCGCG	2	10	167914	167923	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
511	NC_017559	ATC	2	6	167969	167974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017559	GCCAGG	2	12	169065	169076	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017559	CGG	2	6	169105	169110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017559	CGG	2	6	169120	169125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017559	TG	3	6	169255	169260	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017559	CCG	2	6	169275	169280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_017559	GCC	2	6	169338	169343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_017559	CGG	2	6	170036	170041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017559	GAAA	2	8	170097	170104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017559	GCGG	2	8	170993	171000	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
521	NC_017559	CGC	2	6	171015	171020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_017559	CTG	2	6	171034	171039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017559	AAC	2	6	171062	171067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017559	GGCCA	2	10	171072	171081	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
525	NC_017559	GTG	2	6	171098	171103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017559	ATC	2	6	171118	171123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017559	CCGCT	2	10	171133	171142	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
528	NC_017559	GTC	3	9	171195	171203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_017559	CCCAC	2	10	171227	171236	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
530	NC_017559	CG	3	6	173436	173441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_017559	CGG	2	6	173448	173453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017559	GCGCC	2	10	173853	173862	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
533	NC_017559	GCC	2	6	173883	173888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_017559	GGC	2	6	173967	173972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017559	GGA	2	6	173989	173994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017559	GGCC	2	8	175722	175729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
537	NC_017559	GC	3	6	175812	175817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
538	NC_017559	GACTT	2	10	175882	175891	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
539	NC_017559	GCA	2	6	175928	175933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_017559	TG	3	6	175987	175992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017559	CAA	2	6	176061	176066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_017559	TG	3	6	176081	176086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017559	A	6	6	176096	176101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017559	CGGC	2	8	176189	176196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_017559	CGC	2	6	176222	176227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_017559	CAA	2	6	176235	176240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_017559	CCGC	2	8	176298	176305	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
548	NC_017559	GC	4	8	176319	176326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_017559	AGGCA	2	10	178709	178718	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
550	NC_017559	GCC	2	6	182742	182747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_017559	GGGGC	2	10	182760	182769	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
552	NC_017559	GAG	2	6	182779	182784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017559	GGC	3	9	182785	182793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_017559	CGC	2	6	182799	182804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_017559	GCCG	2	8	183978	183985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
556	NC_017559	GCTT	2	8	184038	184045	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
557	NC_017559	GC	3	6	184093	184098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
558	NC_017559	AGA	2	6	184541	184546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017559	TC	3	6	184814	184819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
560	NC_017559	CAA	2	6	184912	184917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_017559	CCT	2	6	184961	184966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_017559	CTT	2	6	184997	185002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017559	ACC	2	6	185009	185014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_017559	GGC	2	6	185043	185048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_017559	GC	3	6	187470	187475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
566	NC_017559	GCT	2	6	187507	187512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_017559	GCGCC	2	10	187548	187557	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
568	NC_017559	TCGATG	2	12	187565	187576	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
569	NC_017559	ATC	2	6	187583	187588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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571	NC_017559	GCATCC	2	12	187611	187622	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
572	NC_017559	CTT	2	6	189689	189694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_017559	TGG	2	6	189752	189757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017559	TGG	2	6	189794	189799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017559	GC	3	6	189877	189882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
576	NC_017559	CCT	2	6	189898	189903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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579	NC_017559	TCC	2	6	189968	189973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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582	NC_017559	A	6	6	190161	190166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017559	AGCGA	2	10	190183	190192	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
584	NC_017559	CT	3	6	190201	190206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_017559	GC	3	6	190249	190254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
586	NC_017559	CTTT	2	8	190255	190262	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
587	NC_017559	CTTT	2	8	190268	190275	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
588	NC_017559	AAAG	2	8	190284	190291	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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595	NC_017559	GCC	2	6	191885	191890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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598	NC_017559	GC	3	6	194938	194943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
599	NC_017559	GAA	2	6	195357	195362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_017559	GCC	2	6	196537	196542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_017559	GC	3	6	196554	196559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
603	NC_017559	TGC	2	6	196638	196643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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609	NC_017559	G	6	6	196896	196901	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017559	GGGGC	3	15	196916	196930	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
611	NC_017559	ACG	2	6	196974	196979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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613	NC_017559	TCA	2	6	197173	197178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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616	NC_017559	TAC	2	6	197285	197290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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621	NC_017559	CG	3	6	200886	200891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
622	NC_017559	GCCG	2	8	200914	200921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_017559	CGG	2	6	200942	200947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017559	GCCCCG	2	12	201407	201418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_017559	TTCG	2	8	201440	201447	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
626	NC_017559	TGCC	2	8	201469	201476	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
627	NC_017559	CCGG	2	8	201479	201486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
628	NC_017559	GCG	2	6	201525	201530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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631	NC_017559	ATCG	2	8	202379	202386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
632	NC_017559	GGA	2	6	202389	202394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017559	GAT	2	6	202401	202406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017559	GCC	2	6	202428	202433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_017559	GGC	2	6	202438	202443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_017559	TCT	2	6	202481	202486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_017559	A	6	6	202684	202689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017559	GAG	2	6	202692	202697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017559	GTT	2	6	204466	204471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017559	TTG	2	6	204473	204478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_017559	GCC	2	6	204479	204484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
642	NC_017559	GCGG	2	8	204487	204494	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
643	NC_017559	CG	3	6	204580	204585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
644	NC_017559	ATCG	2	8	204592	204599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
645	NC_017559	CG	3	6	206168	206173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
646	NC_017559	GTTGG	2	10	207117	207126	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
647	NC_017559	GCT	2	6	207127	207132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_017559	GTT	2	6	207140	207145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
649	NC_017559	GTG	2	6	207151	207156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
650	NC_017559	CTTT	2	8	207192	207199	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
651	NC_017559	AAAG	2	8	207208	207215	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
652	NC_017559	AAAG	2	8	207221	207228	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
653	NC_017559	GC	3	6	207229	207234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
654	NC_017559	GAG	2	6	207273	207278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
655	NC_017559	AG	3	6	207277	207282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
656	NC_017559	CT	3	6	207312	207317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
657	NC_017559	TCC	2	6	207321	207326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
658	NC_017559	TGTT	2	8	207400	207407	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
659	NC_017559	TTG	2	6	207418	207423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
660	NC_017559	TCTTGC	3	18	207440	207457	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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662	NC_017559	GCG	2	6	207505	207510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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664	NC_017559	AGCGA	2	10	207556	207565	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
665	NC_017559	CCTCC	2	10	207571	207580	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
666	NC_017559	AGG	2	6	207601	207606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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669	NC_017559	CTTT	2	8	207628	207635	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
670	NC_017559	CTTT	2	8	207641	207648	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
671	NC_017559	AAAG	2	8	207657	207664	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
672	NC_017559	CAC	2	6	207700	207705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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674	NC_017559	GTG	2	6	208573	208578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
675	NC_017559	GT	3	6	210363	210368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
676	NC_017559	TGGG	2	8	210383	210390	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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679	NC_017559	GCT	2	6	210547	210552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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681	NC_017559	GC	3	6	210580	210585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
682	NC_017559	CCG	2	6	210622	210627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
683	NC_017559	GC	3	6	211640	211645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
684	NC_017559	AAC	2	6	211673	211678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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687	NC_017559	CCG	2	6	213656	213661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
688	NC_017559	TCC	2	6	215020	215025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
689	NC_017559	GCC	2	6	215054	215059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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694	NC_017559	GCCC	2	8	215281	215288	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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766	NC_017559	ATT	2	6	234217	234222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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770	NC_017559	CTT	2	6	234654	234659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
771	NC_017559	A	6	6	234672	234677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
772	NC_017559	CGA	2	6	234678	234683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
773	NC_017559	AGGT	2	8	234684	234691	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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776	NC_017559	TCC	2	6	235186	235191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
777	NC_017559	TGATG	2	10	235202	235211	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
778	NC_017559	AGGTG	2	10	235373	235382	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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