MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 plasmid pRSC35

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017558	GC	3	6	5	10	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017558	ACG	2	6	53	58	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017558	A	6	6	122	127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017558	GCCCG	2	10	136	145	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5	NC_017558	GCG	2	6	186	191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017558	GAACGC	2	12	227	238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017558	GCG	2	6	253	258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017558	AAC	2	6	323	328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017558	ACT	2	6	342	347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017558	CGG	2	6	2255	2260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017558	CCCGG	2	10	2965	2974	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_017558	TCAA	2	8	3201	3208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017558	GGCCG	2	10	4066	4075	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017558	GCC	2	6	4430	4435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017558	GGC	2	6	4442	4447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017558	GCC	2	6	4673	4678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017558	CGG	2	6	4684	4689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017558	T	6	6	4693	4698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017558	ATA	2	6	4707	4712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017558	AGA	2	6	4713	4718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017558	AAT	2	6	4724	4729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017558	ATT	2	6	4730	4735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017558	TTC	2	6	4740	4745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017558	GCAA	2	8	5778	5785	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017558	GCC	2	6	5856	5861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017558	CGGGC	2	10	5904	5913	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017558	CCGG	2	8	5942	5949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017558	GCGTTC	2	12	6010	6021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017558	GCC	2	6	6055	6060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017558	CGGGC	2	10	6103	6112	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017558	GC	4	8	6126	6133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017558	CGGT	2	8	6151	6158	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017558	AGG	2	6	7014	7019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017558	A	7	7	7027	7033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017558	ACA	2	6	8804	8809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017558	CGC	2	6	8864	8869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017558	TCTA	2	8	8930	8937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017558	GAA	2	6	8957	8962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017558	GCG	2	6	8993	8998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017558	ATC	2	6	14187	14192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017558	AGC	2	6	14844	14849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017558	AAC	2	6	14862	14867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017558	G	7	7	14889	14895	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017558	CGA	2	6	14900	14905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017558	GAA	2	6	17695	17700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017558	GCAGC	2	10	17724	17733	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_017558	GGC	2	6	17742	17747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017558	GCG	2	6	17828	17833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017558	A	6	6	17837	17842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017558	CCT	2	6	18118	18123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017558	CTT	2	6	20117	20122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017558	A	6	6	20152	20157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017558	TC	3	6	26291	26296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017558	GCAA	2	8	30760	30767	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017558	GAA	2	6	30800	30805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017558	T	6	6	30849	30854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017558	ATC	2	6	30858	30863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017558	GAT	2	6	30913	30918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017558	GTT	2	6	31652	31657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017558	TCT	2	6	31673	31678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017558	GGA	2	6	31695	31700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017558	GCG	2	6	33159	33164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017558	GCC	2	6	33176	33181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017558	A	6	6	33315	33320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017558	CCGA	2	8	33323	33330	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017558	TCA	2	6	33361	33366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017558	AG	3	6	33367	33372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017558	AGC	2	6	33392	33397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017558	GGC	2	6	34636	34641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017558	GCA	2	6	34652	34657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017558	C	7	7	34682	34688	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_017558	C	7	7	34742	34748	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_017558	C	6	6	34766	34771	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
74	NC_017558	C	7	7	34822	34828	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75	NC_017558	CCCG	2	8	34923	34930	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.