MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rubrivivax gelatinosus IL144

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017075	ACGAAA	2	12	5519	5530	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017075	CCGGCC	2	12	19190	19201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017075	CCCGGC	2	12	39676	39687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017075	TCGGCG	2	12	99794	99805	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017075	GCCTGC	2	12	133182	133193	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017075	TCGGCT	2	12	143379	143390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017075	CGCGCT	2	12	194113	194124	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017075	GCCGGC	2	12	244752	244763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017075	GCGCCC	2	12	244847	244858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017075	CAGTAC	2	12	249150	249161	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017075	GCGGCC	2	12	320103	320114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017075	CGGTTG	2	12	373780	373791	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017075	GGCGGG	2	12	386970	386981	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017075	GCTGCG	2	12	405290	405301	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017075	GGCCGC	2	12	463636	463647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017075	TCGCCG	2	12	487113	487124	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017075	GCGCTC	2	12	503213	503224	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017075	GCTGCA	2	12	508543	508554	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017075	TCCCCC	2	12	531170	531181	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
20	NC_017075	GGGCGC	2	12	591464	591475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017075	GGCATG	2	12	597429	597440	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017075	CGACGC	2	12	663529	663540	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017075	GACCGT	2	12	705374	705385	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017075	AACGCC	2	12	720717	720728	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017075	TCGCTG	2	12	741039	741050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017075	CATCGG	2	12	741808	741819	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017075	GCGGCC	2	12	785152	785163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017075	CGTCGC	2	12	788931	788942	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017075	GCCGCA	2	12	851294	851305	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017075	GCCGGC	2	12	981874	981885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017075	CCGCGT	2	12	1051172	1051183	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017075	CTCGGT	2	12	1119261	1119272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017075	CGGCCG	2	12	1200812	1200823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017075	CCGCGT	2	12	1246720	1246731	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017075	CATCCG	2	12	1344332	1344343	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017075	GCCGGC	2	12	1350217	1350228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017075	GCGCCG	2	12	1405630	1405641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017075	GTCGCC	2	12	1406616	1406627	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017075	CTCAAA	2	12	1431985	1431996	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017075	TCTTTG	2	12	1432112	1432123	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017075	CGGCGC	2	12	1507083	1507094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017075	CGCGGG	2	12	1522026	1522037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017075	AGTTTC	2	12	1572102	1572113	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017075	GGGGAG	2	12	1574711	1574722	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017075	GAGAAC	2	12	1630051	1630062	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017075	GTCCGC	2	12	1744635	1744646	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017075	CCGCGG	2	12	1751077	1751088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017075	CGCGGG	2	12	1786335	1786346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017075	GTCCGG	2	12	1826538	1826549	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017075	TGTATT	2	12	1828299	1828310	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017075	CCCGGC	2	12	1830395	1830406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017075	CGGAAA	2	12	1848932	1848943	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017075	TCCTGA	2	12	1849298	1849309	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017075	GCCAGC	2	12	1893026	1893037	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017075	CGTGCC	2	12	1918459	1918470	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017075	GGCTGC	2	12	1956418	1956429	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017075	GCCCCC	2	12	1964323	1964334	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
58	NC_017075	CGACAC	2	12	2008481	2008492	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017075	CGGCCG	2	12	2033828	2033839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017075	CGGGCG	2	12	2115590	2115601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017075	GGGCTG	2	12	2128740	2128751	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017075	GCGGGC	2	12	2142835	2142846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017075	CGCGGG	2	12	2173490	2173501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017075	GCCGGG	2	12	2232033	2232044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017075	GGCCGG	2	12	2233790	2233801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017075	GATGGG	2	12	2297394	2297405	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017075	CGCGGC	2	12	2306563	2306574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017075	CCGGGG	2	12	2358856	2358867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017075	CGGGCC	2	12	2396991	2397002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017075	CGGGCA	2	12	2404453	2404464	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017075	TCGTCC	2	12	2404551	2404562	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017075	CGACGC	2	12	2441340	2441351	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017075	GTTGCG	2	12	2470036	2470047	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017075	GGCCGG	2	12	2477045	2477056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017075	CCGGCT	2	12	2579133	2579144	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017075	CCATTC	2	12	2698275	2698286	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017075	CCGGGC	2	12	2785360	2785371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017075	CCGGCA	2	12	2793727	2793738	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017075	GGCCGT	2	12	2803060	2803071	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017075	CCGCGC	2	12	2855836	2855847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017075	GTTGAC	2	12	2946138	2946149	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017075	GCTAGC	2	12	2976153	2976164	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017075	CGGCCG	2	12	2984276	2984287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017075	CGCCGG	2	12	2990651	2990662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017075	GCAGAA	2	12	2993150	2993161	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017075	CTCGTC	2	12	3008051	3008062	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017075	GTCACC	2	12	3067369	3067380	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017075	CCGTCA	2	12	3081975	3081986	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017075	TTCGTG	2	12	3087827	3087838	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017075	GCCGGC	2	12	3108935	3108946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017075	TCGCCA	2	12	3192826	3192837	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017075	CCTCAT	2	12	3236442	3236453	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017075	GCAATT	2	12	3252891	3252902	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017075	CGCCCG	2	12	3268419	3268430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017075	GGGCGC	2	12	3287515	3287526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017075	GGGCGC	2	12	3380533	3380544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017075	CCCGCA	2	12	3380570	3380581	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017075	GGGCCC	2	12	3442790	3442801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017075	TTTTCG	2	12	3452962	3452973	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017075	TTCGAG	2	12	3469439	3469450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017075	GCAGGT	2	12	3501639	3501650	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017075	CGCCCC	2	12	3532203	3532214	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
103	NC_017075	GGCCGC	2	12	3590927	3590938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017075	CCGGCG	2	12	3646206	3646217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017075	TGCCGT	2	12	3721288	3721299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017075	CGGCCG	2	12	3730690	3730701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017075	GGCCGG	2	12	3759377	3759388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017075	TCGGCG	2	12	3767679	3767690	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017075	GCCGGG	2	12	3771248	3771259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017075	CGCCGT	2	12	3807170	3807181	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017075	GGGAAC	2	12	3839402	3839413	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017075	CACTTG	2	12	3871826	3871837	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017075	CACTTG	2	12	3877211	3877222	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017075	TCAGCC	3	18	3881014	3881031	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017075	GCCCCC	2	12	3888788	3888799	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
116	NC_017075	TCAAGA	2	12	3903920	3903931	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017075	CCGGGA	2	12	3925596	3925607	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017075	GCCGGG	2	12	3951867	3951878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017075	CCGGCG	2	12	4021344	4021355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017075	CGACGC	2	12	4063018	4063029	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017075	TCGGGG	2	12	4142986	4142997	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017075	CCGGGC	2	12	4204268	4204279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017075	TCGCCC	2	12	4209716	4209727	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_017075	CGGCGA	2	12	4231975	4231986	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017075	TGGGCG	2	12	4306336	4306347	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017075	GCTTCG	2	12	4360209	4360220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017075	GCCGCG	2	12	4409321	4409332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017075	GGGCGG	2	12	4420050	4420061	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017075	GCCAGC	2	12	4489312	4489323	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017075	CCGGGC	2	12	4521746	4521757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017075	CGAAGG	2	12	4583449	4583460	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017075	TCCCCC	2	12	4615979	4615990	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
133	NC_017075	TGACGT	2	12	4663842	4663853	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017075	GCGGCC	2	12	4681533	4681544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017075	CGAGCC	2	12	4683497	4683508	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017075	TTGACG	2	12	4684592	4684603	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_017075	GCGCGG	2	12	4709037	4709048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017075	CAAAAA	2	12	4712921	4712932	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_017075	CACTTG	2	12	4714904	4714915	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017075	CCGGAC	2	12	4763777	4763788	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017075	GGAGGG	2	12	4772945	4772956	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017075	GGTGAA	2	12	4794845	4794856	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017075	CAAGCT	2	12	4942411	4942422	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017075	CGGCGC	2	12	4969560	4969571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017075	GCCGCG	2	12	4972585	4972596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017075	TGTCGT	2	12	5029201	5029212	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.