MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 8027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017066	AATA	2	8	581895	581902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017066	TA	3	6	581910	581915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017066	GAT	2	6	581922	581927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017066	ATT	2	6	581928	581933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017066	TTG	2	6	581957	581962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4008	NC_017066	ATT	2	6	582035	582040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017066	T	6	6	582039	582044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4011	NC_017066	ATG	2	6	582142	582147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017066	T	6	6	582219	582224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017066	ATA	2	6	582317	582322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017066	TAA	2	6	582355	582360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4017	NC_017066	A	6	6	582489	582494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017066	ATA	2	6	582513	582518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017066	AT	3	6	582582	582587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017066	TA	3	6	582594	582599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017066	ATTA	2	8	582616	582623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017066	TAA	2	6	582631	582636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017066	TAG	2	6	582670	582675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4025	NC_017066	TAA	2	6	583620	583625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4031	NC_017066	ATAA	2	8	583870	583877	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017066	GATT	2	8	583883	583890	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017066	AAT	2	6	583893	583898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017066	TAA	2	6	583922	583927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017066	AAT	2	6	583938	583943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4044	NC_017066	CTAT	2	8	584288	584295	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4053	NC_017066	A	6	6	584503	584508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4057	NC_017066	TA	3	6	584589	584594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017066	TTA	2	6	584600	584605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017066	TAA	3	9	584614	584622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017066	AT	3	6	584631	584636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017066	ATAA	2	8	584730	584737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017066	TAA	2	6	584752	584757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017066	A	6	6	584756	584761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017066	AAC	2	6	584798	584803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_017066	TAG	2	6	584808	584813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4069	NC_017066	TA	3	6	586055	586060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017066	ATT	2	6	586061	586066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4073	NC_017066	TA	3	6	586810	586815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017066	TAT	2	6	586824	586829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4079	NC_017066	TG	3	6	587470	587475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017066	GCAT	2	8	587518	587525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4082	NC_017066	TGA	2	6	587567	587572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4089	NC_017066	TG	3	6	588462	588467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017066	ATC	2	6	588482	588487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4092	NC_017066	AATG	2	8	588514	588521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017066	TAT	2	6	591002	591007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4096	NC_017066	AAT	2	6	591201	591206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017066	TGTTT	2	10	591213	591222	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017066	TGA	2	6	591225	591230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017066	TA	3	6	592623	592628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017066	ATA	2	6	592658	592663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017066	ATA	2	6	592706	592711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017066	T	6	6	592735	592740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017066	TTA	2	6	592752	592757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017066	T	6	6	592782	592787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017066	TTG	2	6	592791	592796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017066	A	6	6	592853	592858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4109	NC_017066	GTT	3	9	592976	592984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017066	AAT	2	6	592996	593001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017066	AT	3	6	593009	593014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017066	TTTTTA	2	12	593101	593112	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017066	TAC	2	6	596307	596312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_017066	GATT	2	8	596332	596339	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017066	T	6	6	596355	596360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017066	A	6	6	596377	596382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017066	TTAA	2	8	596396	596403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017066	TA	3	6	598094	598099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017066	A	6	6	598146	598151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017066	TAT	2	6	599267	599272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017066	GGA	2	6	599314	599319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017066	ATAGAA	2	12	599387	599398	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017066	AATA	2	8	599407	599414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017066	TAA	2	6	599431	599436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017066	ACT	2	6	601217	601222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_017066	ACA	2	6	601227	601232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_017066	TA	3	6	601245	601250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017066	A	7	7	601250	601256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017066	AAAT	2	8	602606	602613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017066	AAT	2	6	602616	602621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_017066	ATTA	2	8	602647	602654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017066	ATAA	2	8	602672	602679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_017066	TAT	2	6	602686	602691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017066	ATA	2	6	602696	602701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_017066	ACA	2	6	602716	602721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_017066	ATT	2	6	602749	602754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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