MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 8027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017066	GTT	2	6	452415	452420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017066	AAC	2	6	452442	452447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_017066	A	6	6	452484	452489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017066	TTTTTA	2	12	453009	453020	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017066	AAG	2	6	453072	453077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017066	A	6	6	453107	453112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017066	T	6	6	453139	453144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017066	ATT	2	6	453163	453168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017066	AAAT	3	12	453213	453224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017066	ATT	2	6	453242	453247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017066	A	6	6	454865	454870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_017066	TGAA	2	8	454877	454884	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017066	AACA	2	8	454910	454917	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3014	NC_017066	ATA	2	6	455908	455913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017066	GTCA	2	8	455916	455923	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_017066	TA	3	6	455924	455929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_017066	ACA	2	6	455932	455937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_017066	A	6	6	455937	455942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017066	ATT	2	6	458267	458272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017066	A	7	7	458325	458331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017066	TAA	3	9	458333	458341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017066	ATT	2	6	458384	458389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017066	TAAT	2	8	458507	458514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017066	TAA	2	6	459913	459918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017066	TTA	2	6	459919	459924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017066	A	8	8	459986	459993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_017066	AAT	2	6	460029	460034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017066	ATT	2	6	460039	460044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_017066	T	6	6	460116	460121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017066	TAT	2	6	460157	460162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017066	GAA	2	6	460165	460170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017066	ATTT	2	8	460203	460210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017066	AT	3	6	460221	460226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017066	TAAC	2	8	460228	460235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3035	NC_017066	AT	3	6	460254	460259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017066	AT	3	6	460289	460294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_017066	AATT	2	8	460297	460304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_017066	ATG	2	6	460337	460342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017066	CAATA	2	10	461645	461654	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3040	NC_017066	CAA	2	6	461685	461690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_017066	CATG	2	8	461735	461742	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3042	NC_017066	AATC	2	8	461766	461773	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3043	NC_017066	T	6	6	461813	461818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_017066	TCT	2	6	461854	461859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_017066	CTT	2	6	461879	461884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_017066	T	7	7	461914	461920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_017066	TTA	2	6	462233	462238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3051	NC_017066	ATGGT	2	10	462340	462349	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_017066	TTC	2	6	462367	462372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3054	NC_017066	ATGT	2	8	462444	462451	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017066	TTA	2	6	462458	462463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_017066	TTA	2	6	462479	462484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_017066	ATA	2	6	462540	462545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_017066	AAT	2	6	462612	462617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_017066	AT	3	6	462629	462634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_017066	TTA	2	6	462640	462645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017066	TAT	2	6	462674	462679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017066	ATA	2	6	462695	462700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017066	TAT	2	6	462738	462743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017066	ATTG	2	8	462757	462764	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017066	TTA	2	6	462821	462826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_017066	TAT	2	6	462860	462865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017066	ATTT	2	8	462878	462885	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017066	TAT	2	6	462917	462922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017066	TTTA	2	8	462933	462940	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017066	T	6	6	462981	462986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3099	NC_017066	TAA	2	6	464891	464896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3121	NC_017066	A	7	7	469661	469667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017066	TCTA	2	8	469681	469688	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3132	NC_017066	ATT	2	6	470050	470055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_017066	A	7	7	470092	470098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_017066	TAT	2	6	470120	470125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3137	NC_017066	CA	3	6	470171	470176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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