MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 8027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017066	TATCG	2	10	249477	249486	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1502	NC_017066	ATTG	2	8	249513	249520	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017066	TTA	2	6	249531	249536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017066	AAT	2	6	249547	249552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017066	TAA	2	6	249599	249604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017066	CAA	2	6	249633	249638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_017066	GA	3	6	249692	249697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017066	ATT	2	6	249712	249717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017066	GA	3	6	249964	249969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017066	AAT	2	6	249983	249988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017066	GAAA	2	8	250016	250023	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017066	TAT	2	6	250026	250031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017066	ATTC	2	8	250051	250058	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_017066	TA	3	6	250072	250077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017066	ATA	2	6	252880	252885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017066	ATA	2	6	252898	252903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017066	TTA	2	6	252946	252951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017066	TAA	2	6	252955	252960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017066	TTATA	2	10	252968	252977	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017066	TTA	2	6	252981	252986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017066	GAT	2	6	253006	253011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017066	TCA	2	6	253027	253032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_017066	TTAA	2	8	253038	253045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017066	ATT	2	6	253094	253099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017066	T	7	7	253112	253118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017066	TGAAAT	2	12	253121	253132	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017066	TAC	2	6	253154	253159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_017066	TAAAT	2	10	253239	253248	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017066	ATT	2	6	253262	253267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017066	T	6	6	253266	253271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017066	ATTA	2	8	253304	253311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017066	GTA	2	6	253351	253356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017066	ATG	2	6	253382	253387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017066	TTA	2	6	253391	253396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017066	TTA	3	9	253425	253433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017066	AT	3	6	253450	253455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017066	GT	3	6	253503	253508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017066	AT	3	6	253524	253529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017066	TTA	2	6	253532	253537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017066	T	6	6	253544	253549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017066	T	6	6	253594	253599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017066	CCT	2	6	253616	253621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_017066	A	6	6	253638	253643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017066	TA	3	6	253658	253663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017066	ACT	2	6	253697	253702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_017066	ATTT	2	8	253705	253712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017066	ATC	2	6	253715	253720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_017066	T	6	6	253732	253737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017066	TAA	2	6	253760	253765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017066	CTT	2	6	253766	253771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_017066	ATA	2	6	253839	253844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017066	ATT	2	6	253895	253900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017066	TTAT	2	8	253909	253916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017066	TTA	2	6	253922	253927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017066	TAT	2	6	253928	253933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017066	AAAT	2	8	253961	253968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017066	TAT	2	6	253988	253993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017066	CTTT	2	8	254008	254015	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_017066	TAT	2	6	255508	255513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017066	GCTAAA	2	12	255518	255529	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1561	NC_017066	A	6	6	255527	255532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017066	AAGTT	2	10	255534	255543	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017066	T	6	6	255591	255596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017066	GAT	2	6	255619	255624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017066	T	7	7	255646	255652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017066	AGC	2	6	255703	255708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_017066	TTG	2	6	255709	255714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017066	AAC	2	6	255965	255970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_017066	ATAAAA	2	12	256016	256027	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017066	ATT	2	6	256033	256038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017066	TCA	2	6	256082	256087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_017066	CA	3	6	256086	256091	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_017066	ATA	3	9	256158	256166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017066	AAT	2	6	256187	256192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017066	AATT	2	8	256198	256205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017066	TAA	2	6	256249	256254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017066	TGG	2	6	256262	256267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017066	TAT	2	6	256385	256390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017066	GGA	2	6	256448	256453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017066	TAG	2	6	256477	256482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017066	A	7	7	256516	256522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017066	ACC	2	6	256637	256642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1583	NC_017066	CT	3	6	256658	256663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_017066	GCAT	2	8	256764	256771	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1585	NC_017066	TAT	2	6	256775	256780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1587	NC_017066	ACT	2	6	256973	256978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1589	NC_017066	CAGA	2	8	257174	257181	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1590	NC_017066	AGA	2	6	257271	257276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017066	AAC	2	6	257281	257286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_017066	AGC	2	6	257304	257309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1595	NC_017066	CAA	2	6	257363	257368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_017066	GATT	2	8	257686	257693	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017066	TAT	2	6	257727	257732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017066	GA	3	6	257786	257791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017066	GAA	2	6	257833	257838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_017066	TG	4	8	257847	257854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_017066	TTA	2	6	257898	257903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017066	GAC	2	6	257931	257936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_017066	AGG	2	6	257976	257981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017066	CGG	2	6	258013	258018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_017066	ACC	2	6	258284	258289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NC_017066	TGG	2	6	258345	258350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_017066	GC	3	6	258392	258397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_017066	GGT	2	6	258509	258514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017066	TGA	2	6	258570	258575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017066	CGA	2	6	258593	258598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_017066	TCA	2	6	258624	258629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_017066	CGT	2	6	258704	258709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_017066	TGG	2	6	258797	258802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017066	CTG	2	6	258855	258860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_017066	ACCT	2	8	258879	258886	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_017066	TG	3	6	258958	258963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017066	GATT	2	8	258987	258994	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017066	ATT	2	6	259062	259067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017066	AATA	2	8	259089	259096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017066	ATT	2	6	259153	259158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017066	AAT	2	6	259169	259174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017066	TAT	2	6	259193	259198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017066	TGG	2	6	259231	259236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017066	AC	3	6	259253	259258	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_017066	ATCCC	2	10	259260	259269	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1626	NC_017066	TGCAA	2	10	259345	259354	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1627	NC_017066	AAT	2	6	259394	259399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017066	AT	4	8	259418	259425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017066	ACAGTA	2	12	259430	259441	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1630	NC_017066	TAA	2	6	259445	259450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017066	CAA	2	6	259480	259485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_017066	TAT	2	6	260614	260619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017066	GGTA	2	8	260637	260644	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017066	TTAT	2	8	260683	260690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_017066	TAC	2	6	260705	260710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1637	NC_017066	ATC	2	6	260741	260746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1959	NC_017066	ATA	2	6	310588	310593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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