MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 8027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017066	GTA	2	6	169973	169978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017066	ATT	2	6	170072	170077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017066	AAT	2	6	170106	170111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017066	TTA	2	6	170134	170139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017066	ATA	2	6	170144	170149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017066	TAAAG	2	10	170150	170159	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017066	TAA	2	6	170177	170182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017066	TAA	2	6	170185	170190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017066	TC	3	6	170193	170198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_017066	AGT	3	9	170209	170217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017066	AGAA	2	8	170258	170265	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017066	TAT	2	6	170299	170304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017066	AGT	2	6	170331	170336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017066	TA	3	6	170369	170374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017066	ATGT	2	8	170376	170383	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017066	ATA	2	6	170389	170394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017066	TCTA	2	8	170406	170413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_017066	TCT	2	6	170463	170468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_017066	ATC	2	6	170523	170528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_017066	AT	3	6	170540	170545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017066	ATA	2	6	170547	170552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017066	TTA	2	6	170578	170583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017066	AT	3	6	170608	170613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017066	TACTT	2	10	170643	170652	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1025	NC_017066	ATT	2	6	170705	170710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017066	ATAA	2	8	170772	170779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017066	TG	3	6	172328	172333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017066	TAA	2	6	172355	172360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017066	TTA	2	6	173221	173226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017066	A	6	6	173242	173247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017066	TA	4	8	173256	173263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017066	TAA	2	6	173770	173775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017066	TATGTA	2	12	173779	173790	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017066	GAAA	2	8	173796	173803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017066	TTG	2	6	175661	175666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017066	GCATT	2	10	175675	175684	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1040	NC_017066	TTA	2	6	175768	175773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017066	AT	3	6	175796	175801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017066	GTTTC	2	10	175805	175814	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1043	NC_017066	TTA	2	6	178024	178029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017066	TA	3	6	178038	178043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017066	TAA	2	6	178077	178082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017066	ATA	2	6	178848	178853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1051	NC_017066	T	6	6	179005	179010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017066	TATAG	2	10	179752	179761	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017066	TAT	2	6	179792	179797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017066	TAG	2	6	179799	179804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017066	GTA	2	6	179821	179826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017066	ACT	2	6	179863	179868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017066	TA	3	6	179944	179949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017066	ATTT	2	8	179966	179973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017066	TCT	2	6	179975	179980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_017066	TTAC	2	8	179981	179988	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_017066	AAT	2	6	181202	181207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017066	TTC	2	6	181268	181273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_017066	CTT	2	6	181293	181298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_017066	A	6	6	181303	181308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017066	T	6	6	181343	181348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017066	A	6	6	182829	182834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017066	T	6	6	182903	182908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017066	TAT	2	6	184761	184766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017066	ATA	3	9	184801	184809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1071	NC_017066	T	6	6	184852	184857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1073	NC_017066	T	6	6	184934	184939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017066	AT	3	6	184946	184951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1083	NC_017066	TA	3	6	185193	185198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017066	TAA	2	6	185239	185244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1096	NC_017066	TATTTA	2	12	188737	188748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_017066	TAT	3	9	189036	189044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_017066	A	6	6	189110	189115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017066	TCT	2	6	189133	189138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1105	NC_017066	CTTT	2	8	189275	189282	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_017066	T	6	6	189280	189285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017066	AT	3	6	189288	189293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017066	CTT	2	6	189299	189304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_017066	TAT	2	6	189488	189493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017066	ATA	2	6	189494	189499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1114	NC_017066	TAA	2	6	189677	189682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017066	ATTAT	2	10	189683	189692	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017066	TTA	2	6	189738	189743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017066	T	7	7	189756	189762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017066	TAAT	2	8	189794	189801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017066	TA	3	6	189842	189847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017066	TTA	2	6	189963	189968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017066	TA	3	6	189978	189983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017066	GTT	2	6	190027	190032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017066	TGA	2	6	190074	190079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1126	NC_017066	TTTAAT	2	12	192419	192430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1128	NC_017066	TAG	2	6	192589	192594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017066	ATA	2	6	192595	192600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1131	NC_017066	TAA	2	6	193720	193725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017066	ATT	2	6	193726	193731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017066	TGAT	2	8	193775	193782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017066	ATT	2	6	193795	193800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1136	NC_017066	TTC	2	6	195097	195102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1138	NC_017066	AAG	2	6	195221	195226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1407	NC_017066	TAT	2	6	234098	234103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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