MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 8027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017066	AAT	2	6	92061	92066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017066	TAT	2	6	92067	92072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017066	TTA	2	6	92076	92081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017066	TAA	2	6	92096	92101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017066	TTA	2	6	92108	92113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017066	TA	3	6	92112	92117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017066	TTTA	2	8	92132	92139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017066	TA	3	6	92138	92143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017066	ATG	2	6	92145	92150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017066	AT	3	6	92170	92175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017066	TTC	2	6	92189	92194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017066	ATA	2	6	92256	92261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017066	AAT	2	6	92289	92294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017066	ATT	2	6	93141	93146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017066	TTA	2	6	95158	95163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017066	AT	3	6	95194	95199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017066	TTA	2	6	95200	95205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017066	T	6	6	95222	95227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017066	AT	3	6	95234	95239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017066	TA	3	6	95308	95313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017066	AAGT	2	8	101232	101239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017066	T	6	6	101246	101251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017066	T	7	7	101257	101263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017066	AAT	2	6	101264	101269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017066	TATT	2	8	102787	102794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017066	CAAA	2	8	102832	102839	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
527	NC_017066	T	6	6	102844	102849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017066	TAAA	2	8	102861	102868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017066	TA	3	6	102926	102931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017066	TAA	2	6	102940	102945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017066	T	6	6	102994	102999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017066	ATCT	2	8	103078	103085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
533	NC_017066	CAG	2	6	103098	103103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_017066	TAA	2	6	103110	103115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017066	ATT	2	6	103126	103131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017066	T	6	6	103345	103350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017066	TTA	2	6	103383	103388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017066	TAC	2	6	103398	103403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017066	AAT	2	6	103427	103432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017066	AT	3	6	103499	103504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017066	GGA	2	6	103530	103535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017066	ATA	2	6	103542	103547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017066	AGA	2	6	103565	103570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017066	ATT	2	6	103593	103598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017066	TACAAG	2	12	103601	103612	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
546	NC_017066	GATT	2	8	103613	103620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017066	TAA	3	9	103675	103683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017066	TAA	2	6	103703	103708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017066	ATT	2	6	103710	103715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017066	GAT	2	6	103728	103733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017066	ATTA	2	8	103742	103749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017066	ATA	2	6	103759	103764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017066	TAT	2	6	103777	103782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017066	TCA	2	6	103791	103796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_017066	GCA	2	6	103821	103826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_017066	TAAT	2	8	103839	103846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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558	NC_017066	ATG	2	6	103878	103883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017066	AT	3	6	103890	103895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017066	A	6	6	103958	103963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017066	TCA	2	6	104022	104027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_017066	TAAT	2	8	104063	104070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017066	ATT	2	6	104104	104109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017066	AATA	2	8	104112	104119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017066	TAG	2	6	104164	104169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017066	TTA	2	6	104197	104202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017066	AAT	2	6	104314	104319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017066	GTA	2	6	104349	104354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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570	NC_017066	TAA	2	6	104379	104384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017066	CAA	2	6	104385	104390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017066	A	7	7	104448	104454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017066	TTAT	2	8	104464	104471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017066	TATAA	2	10	104472	104481	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017066	AT	3	6	104488	104493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017066	TATT	2	8	104570	104577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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578	NC_017066	TAT	2	6	104676	104681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017066	TAT	3	9	104694	104702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017066	AT	4	8	104704	104711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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586	NC_017066	TCA	2	6	105333	105338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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593	NC_017066	ATT	2	6	105722	105727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_017066	A	7	7	108166	108172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_017066	TTA	3	9	109403	109411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017066	ATTTT	2	10	109418	109427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017066	AAT	2	6	109432	109437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017066	AAC	2	6	109492	109497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017066	A	6	6	109519	109524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017066	ATTA	2	8	109529	109536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017066	TTAT	2	8	109588	109595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017066	T	6	6	111457	111462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017066	ATTA	2	8	111519	111526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017066	TA	3	6	111533	111538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017066	TGA	2	6	111560	111565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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614	NC_017066	T	7	7	111636	111642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017066	ATT	2	6	111663	111668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017066	AT	3	6	111671	111676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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618	NC_017066	AAT	2	6	111823	111828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017066	ATT	2	6	111851	111856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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621	NC_017066	ATTT	2	8	112689	112696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017066	TATT	2	8	112721	112728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017066	ATAG	2	8	112746	112753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017066	ATT	2	6	112777	112782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017066	ATT	2	6	112791	112796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017066	T	6	6	112803	112808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017066	ATT	2	6	112825	112830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017066	ATT	2	6	112847	112852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017066	TAA	2	6	114836	114841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017066	TTG	2	6	116248	116253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017066	TA	3	6	116263	116268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017066	A	6	6	116315	116320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017066	ATAA	2	8	116325	116332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017066	TAT	2	6	116856	116861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017066	ATA	2	6	117545	117550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017066	AAAC	2	8	117563	117570	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
637	NC_017066	TAT	2	6	117616	117621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017066	TAG	2	6	117685	117690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017066	ATT	2	6	117691	117696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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641	NC_017066	TAAAAG	2	12	117716	117727	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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