MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 8027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017066	A	6	6	831629	831634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_017066	TATTAA	2	12	833064	833075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_017066	ATA	2	6	833125	833130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_017066	TAA	2	6	833148	833153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_017066	TA	3	6	833196	833201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_017066	T	7	7	833239	833245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_017066	T	6	6	833290	833295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_017066	ATA	2	6	833300	833305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_017066	TA	3	6	833308	833313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_017066	TTAA	2	8	833314	833321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_017066	CA	3	6	833331	833336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6012	NC_017066	ATTA	2	8	833363	833370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_017066	TA	3	6	833369	833374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_017066	ATA	2	6	834756	834761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_017066	TAT	2	6	834782	834787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_017066	ATG	2	6	834805	834810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_017066	TCAA	2	8	834954	834961	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6018	NC_017066	AC	3	6	834989	834994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6019	NC_017066	T	8	8	835024	835031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_017066	AT	3	6	835052	835057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_017066	TAAT	2	8	835060	835067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_017066	AT	3	6	835080	835085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_017066	TAA	2	6	835090	835095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_017066	T	6	6	835105	835110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_017066	AAT	2	6	835126	835131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_017066	ATA	2	6	835186	835191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_017066	T	6	6	835212	835217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_017066	TAA	3	9	835252	835260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_017066	ATA	2	6	835291	835296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_017066	TAT	2	6	835342	835347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_017066	T	7	7	835360	835366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_017066	AAT	2	6	835380	835385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_017066	AAT	2	6	835978	835983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_017066	TAA	2	6	835992	835997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_017066	A	7	7	836871	836877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6038	NC_017066	TGA	2	6	836973	836978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_017066	T	6	6	837024	837029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_017066	AT	3	6	837057	837062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_017066	AAAG	2	8	837128	837135	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_017066	AGTA	2	8	837145	837152	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_017066	ACC	2	6	837163	837168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_017066	ATT	2	6	837179	837184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_017066	ATAA	2	8	837188	837195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_017066	AC	3	6	837221	837226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6047	NC_017066	TCC	2	6	837245	837250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_017066	TA	3	6	837252	837257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_017066	AAAAT	2	10	837279	837288	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_017066	TA	3	6	838542	838547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_017066	ATT	2	6	838579	838584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_017066	TAC	2	6	838601	838606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_017066	ATG	2	6	838660	838665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_017066	ATTT	2	8	838676	838683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_017066	A	6	6	838688	838693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_017066	TTA	2	6	838698	838703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_017066	A	8	8	838735	838742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_017066	AT	3	6	838778	838783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_017066	AT	3	6	838822	838827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_017066	TAA	2	6	838856	838861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_017066	TTA	2	6	838862	838867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_017066	TTA	2	6	838870	838875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_017066	AC	3	6	839207	839212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6064	NC_017066	TAA	2	6	839216	839221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_017066	TAATA	2	10	839248	839257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_017066	TACCT	2	10	839282	839291	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6067	NC_017066	AATCT	2	10	839348	839357	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6068	NC_017066	ATT	2	6	839363	839368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_017066	TTAA	2	8	839390	839397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_017066	TAA	2	6	839399	839404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_017066	T	6	6	839445	839450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_017066	TAA	2	6	839460	839465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_017066	T	6	6	839486	839491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_017066	T	10	10	839493	839502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6081	NC_017066	TCT	2	6	839833	839838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_017066	AT	3	6	839883	839888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6085	NC_017066	CTA	2	6	840032	840037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6094	NC_017066	ATT	2	6	840536	840541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6098	NC_017066	TTGT	2	8	840681	840688	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6101	NC_017066	GT	3	6	840785	840790	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6104	NC_017066	ATA	2	6	840844	840849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_017066	TTTA	2	8	840879	840886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_017066	ATA	2	6	840943	840948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_017066	TA	3	6	840956	840961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_017066	TAA	2	6	840992	840997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_017066	ATT	2	6	841054	841059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_017066	TAT	2	6	841093	841098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_017066	TAA	2	6	841121	841126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6114	NC_017066	CTGTA	2	10	841186	841195	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6115	NC_017066	TCT	2	6	841264	841269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6122	NC_017066	GAAA	2	8	841420	841427	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_017066	A	7	7	841460	841466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_017066	ACA	2	6	841478	841483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_017066	A	6	6	841483	841488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_017066	ATT	2	6	841496	841501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6128	NC_017066	TAA	2	6	841538	841543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_017066	TA	3	6	841568	841573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_017066	ATA	3	9	841918	841926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_017066	ATT	2	6	841927	841932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_017066	CTTA	2	8	841958	841965	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6133	NC_017066	ATA	2	6	841967	841972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6135	NC_017066	AAT	2	6	842070	842075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6137	NC_017066	TTG	2	6	842118	842123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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