MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 8027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017066	TAACA	2	10	705161	705170	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5002	NC_017066	GAA	2	6	705182	705187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017066	ATG	2	6	705198	705203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017066	AT	3	6	705266	705271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017066	ATA	2	6	705375	705380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017066	TA	3	6	705395	705400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017066	CTA	2	6	705464	705469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_017066	TAAA	2	8	705474	705481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017066	GGAT	2	8	705529	705536	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017066	TAAT	2	8	705579	705586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017066	TCTAT	2	10	705614	705623	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5012	NC_017066	TCT	2	6	705641	705646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_017066	ATT	2	6	705717	705722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017066	ATC	2	6	705732	705737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_017066	A	6	6	705754	705759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017066	TA	3	6	705760	705765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017066	ATA	2	6	705779	705784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017066	ACT	2	6	705791	705796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_017066	AAT	2	6	705799	705804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017066	T	7	7	705806	705812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017066	ATGAAA	2	12	705817	705828	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017066	ATA	2	6	705854	705859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017066	TAA	3	9	708054	708062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017066	AATA	2	8	708088	708095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017066	GAT	2	6	708141	708146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017066	ATT	2	6	708154	708159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017066	ATT	2	6	708171	708176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017066	ACT	2	6	708215	708220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_017066	ATC	2	6	708261	708266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_017066	TAA	2	6	708270	708275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017066	T	7	7	708278	708284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017066	TTATAA	2	12	708287	708298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017066	TG	3	6	708302	708307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017066	TAC	2	6	708318	708323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_017066	TTTA	2	8	708353	708360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017066	ATC	2	6	708426	708431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_017066	GAT	2	6	708499	708504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017066	TAA	2	6	708514	708519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017066	AT	3	6	708571	708576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017066	AAT	2	6	708582	708587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017066	AAG	2	6	708642	708647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017066	TAC	2	6	708648	708653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_017066	TGC	2	6	708691	708696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_017066	ATA	2	6	708725	708730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017066	ATTC	2	8	708736	708743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5046	NC_017066	GAA	2	6	708749	708754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017066	T	6	6	708757	708762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017066	AACT	2	8	708786	708793	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_017066	TAT	2	6	708818	708823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017066	TAA	2	6	708837	708842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_017066	AAC	3	9	708874	708882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_017066	CAA	2	6	708939	708944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_017066	AAT	2	6	708945	708950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017066	TTA	2	6	708962	708967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_017066	TA	3	6	708978	708983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017066	T	6	6	708990	708995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017066	GTAA	2	8	708996	709003	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017066	ATTA	2	8	709062	709069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017066	TAAT	2	8	709073	709080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017066	TATT	2	8	709123	709130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017066	AAAT	2	8	709150	709157	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017066	TCTTA	2	10	709161	709170	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5063	NC_017066	TGCA	2	8	709220	709227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5064	NC_017066	TAT	2	6	709295	709300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017066	A	6	6	709421	709426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_017066	ACTA	2	8	709474	709481	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5067	NC_017066	TAGT	2	8	709494	709501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017066	CAA	2	6	709506	709511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_017066	A	6	6	710913	710918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017066	TCA	2	6	710979	710984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_017066	ATT	2	6	711020	711025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017066	ATT	2	6	711035	711040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017066	AC	3	6	711061	711066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5074	NC_017066	ACT	2	6	711080	711085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_017066	TATCCA	2	12	711090	711101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5077	NC_017066	TA	3	6	711197	711202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017066	TAA	2	6	711218	711223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_017066	A	6	6	711233	711238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017066	A	7	7	711259	711265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017066	CTTT	2	8	711271	711278	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5082	NC_017066	TTGTT	2	10	714541	714550	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017066	AT	3	6	714605	714610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_017066	AAT	2	6	714648	714653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017066	AT	3	6	715628	715633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_017066	ATT	2	6	715653	715658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_017066	TAA	2	6	715671	715676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_017066	T	6	6	715690	715695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_017066	ATA	2	6	715711	715716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017066	ATA	2	6	715729	715734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_017066	AAT	2	6	715855	715860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_017066	T	6	6	718185	718190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_017066	TTAC	2	8	718233	718240	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5094	NC_017066	CTC	2	6	718292	718297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5095	NC_017066	CATTA	2	10	718318	718327	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5096	NC_017066	AATT	2	8	718337	718344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017066	AAT	2	6	718357	718362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017066	AT	3	6	718361	718366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017066	TTC	2	6	718397	718402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_017066	TTTTA	2	10	718433	718442	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_017066	ATT	2	6	718450	718455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017066	TAAGA	2	10	718490	718499	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017066	ATA	2	6	718566	718571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017066	AAT	2	6	718575	718580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017066	TTTA	2	8	718602	718609	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017066	TTA	2	6	718614	718619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_017066	AAT	2	6	718627	718632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_017066	TTTA	2	8	720371	720378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017066	ACTA	2	8	720476	720483	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5110	NC_017066	ATA	2	6	720851	720856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017066	ATA	3	9	720893	720901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017066	CTT	2	6	720902	720907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_017066	T	8	8	720914	720921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017066	CAT	2	6	720953	720958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_017066	ACAGC	2	10	720963	720972	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5116	NC_017066	ATA	2	6	720997	721002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_017066	CAA	2	6	721063	721068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_017066	ATAG	2	8	722522	722529	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017066	ATT	2	6	722537	722542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017066	GT	3	6	722546	722551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_017066	TTA	2	6	722554	722559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017066	AC	3	6	722565	722570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5123	NC_017066	ATT	2	6	722590	722595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_017066	A	6	6	722647	722652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017066	CA	4	8	722679	722686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5126	NC_017066	AT	3	6	722701	722706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017066	ATTAA	2	10	722708	722717	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017066	AAAC	2	8	722795	722802	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5129	NC_017066	TGACA	2	10	722850	722859	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5130	NC_017066	GCA	2	6	722903	722908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_017066	AAT	2	6	722913	722918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_017066	TAC	2	6	722927	722932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_017066	ATA	2	6	722971	722976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_017066	AAT	2	6	723043	723048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_017066	AT	3	6	723051	723056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_017066	TAC	2	6	723060	723065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5138	NC_017066	TAA	2	6	723116	723121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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