MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 8027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017066	TAA	2	6	650585	650590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_017066	A	6	6	650601	650606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_017066	TGT	2	6	650610	650615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_017066	GTT	2	6	650618	650623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_017066	CTT	2	6	650632	650637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_017066	ATA	2	6	650663	650668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_017066	ATA	2	6	650682	650687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_017066	GTA	2	6	650700	650705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_017066	GC	3	6	650708	650713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4510	NC_017066	ATA	2	6	650765	650770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_017066	CTA	2	6	650773	650778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_017066	ACA	2	6	650806	650811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_017066	AATT	2	8	650812	650819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_017066	ATT	2	6	650837	650842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_017066	ATAA	2	8	650851	650858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_017066	GAT	2	6	650886	650891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_017066	TTA	2	6	650895	650900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_017066	TTA	2	6	650922	650927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_017066	TTC	2	6	650955	650960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_017066	TTAAA	2	10	650990	650999	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_017066	AAT	4	12	651026	651037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_017066	AAATT	2	10	651043	651052	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_017066	ATG	2	6	651081	651086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_017066	TTC	2	6	651093	651098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_017066	ATT	2	6	651109	651114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_017066	CTT	2	6	651127	651132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_017066	TA	3	6	651170	651175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_017066	TAA	2	6	651199	651204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_017066	TAC	2	6	651256	651261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_017066	TAT	2	6	652446	652451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_017066	TAA	2	6	652457	652462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_017066	CA	3	6	652469	652474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4533	NC_017066	ATT	2	6	652475	652480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_017066	AAC	2	6	652484	652489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_017066	A	6	6	652510	652515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_017066	ATT	2	6	652523	652528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_017066	A	6	6	652544	652549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_017066	TTAATA	2	12	653958	653969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_017066	GTAA	2	8	654010	654017	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_017066	TA	3	6	654088	654093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_017066	TTA	2	6	654094	654099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_017066	TATG	2	8	654116	654123	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_017066	AAC	2	6	654136	654141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_017066	ATC	2	6	654165	654170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_017066	TAT	2	6	654182	654187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_017066	TGTATT	2	12	654188	654199	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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4548	NC_017066	TTAT	2	8	655594	655601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_017066	TTTATT	2	12	657380	657391	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_017066	TGT	2	6	658561	658566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_017066	ATT	2	6	658568	658573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_017066	AGT	2	6	658581	658586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_017066	TTGA	2	8	658587	658594	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_017066	AGCA	2	8	658596	658603	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4555	NC_017066	AAC	2	6	658612	658617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_017066	TAATAT	2	12	658627	658638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_017066	TTA	2	6	659963	659968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_017066	T	6	6	659969	659974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_017066	ATTAC	2	10	660051	660060	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4560	NC_017066	CT	3	6	660537	660542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4561	NC_017066	ATT	2	6	660573	660578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_017066	AAAT	2	8	660612	660619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_017066	AT	3	6	660618	660623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_017066	TTATT	2	10	660634	660643	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_017066	ATA	2	6	660659	660664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_017066	TAT	2	6	661200	661205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_017066	ATT	2	6	661229	661234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_017066	TAA	2	6	661259	661264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_017066	AGA	2	6	661286	661291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_017066	GATAT	2	10	661296	661305	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_017066	A	6	6	661310	661315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_017066	T	6	6	661316	661321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_017066	ATCTAA	2	12	661382	661393	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4574	NC_017066	T	6	6	661396	661401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_017066	A	6	6	661430	661435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4578	NC_017066	CTA	2	6	661474	661479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_017066	TA	3	6	661573	661578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_017066	AAT	3	9	661586	661594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_017066	TA	3	6	662445	662450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_017066	AAG	2	6	662465	662470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_017066	TAA	2	6	662529	662534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_017066	TA	3	6	662570	662575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_017066	TTA	2	6	664402	664407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_017066	T	6	6	665044	665049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_017066	TAA	3	9	665114	665122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_017066	T	6	6	666444	666449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_017066	TAT	2	6	666453	666458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4591	NC_017066	GTT	2	6	666487	666492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_017066	AAT	2	6	666518	666523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_017066	TTGAT	2	10	666545	666554	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_017066	TAA	2	6	666580	666585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_017066	AT	3	6	666595	666600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_017066	TTTAA	2	10	666610	666619	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_017066	C	6	6	666668	666673	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4598	NC_017066	T	6	6	666714	666719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_017066	ATA	2	6	666729	666734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_017066	TAA	2	6	666778	666783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_017066	AATA	2	8	666797	666804	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_017066	ATTA	2	8	666818	666825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_017066	ATG	2	6	666848	666853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_017066	GTG	2	6	666906	666911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_017066	TA	3	6	666914	666919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_017066	AAT	2	6	666927	666932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_017066	AT	3	6	666940	666945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_017066	AT	4	8	666950	666957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_017066	AATT	2	8	666979	666986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_017066	ATT	2	6	667007	667012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_017066	ATT	2	6	667019	667024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_017066	TAT	2	6	667030	667035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_017066	TACT	2	8	667046	667053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4614	NC_017066	A	7	7	667169	667175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_017066	GAATA	2	10	667206	667215	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_017066	ATA	2	6	667276	667281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_017066	TGTA	2	8	667305	667312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_017066	AT	3	6	667323	667328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_017066	ATG	2	6	667390	667395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_017066	AT	3	6	667398	667403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_017066	T	7	7	667435	667441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_017066	ACC	2	6	667451	667456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_017066	ATAA	2	8	667470	667477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_017066	A	7	7	667476	667482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_017066	ATC	2	6	667509	667514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_017066	T	7	7	667515	667521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_017066	ATT	2	6	667554	667559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_017066	TAG	2	6	667598	667603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_017066	CTT	2	6	667637	667642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_017066	ATTTT	2	10	667660	667669	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_017066	GATTTT	2	12	667673	667684	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_017066	TAT	2	6	667685	667690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_017066	TCT	2	6	667692	667697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4634	NC_017066	TTA	2	6	667701	667706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4635	NC_017066	ATCTT	2	10	667789	667798	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4636	NC_017066	AT	3	6	667802	667807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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