MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017065	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017065	ATTT	2	8	1401	1408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017065	TAAA	2	8	6655	6662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017065	CCTC	2	8	10215	10222	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_017065	CAAT	2	8	10262	10269	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017065	ATTA	2	8	11261	11268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017065	ATTA	2	8	11475	11482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017065	TTTA	2	8	12094	12101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017065	GATT	2	8	12536	12543	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017065	AAAT	2	8	12544	12551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017065	AATT	2	8	12571	12578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017065	TTAA	2	8	12752	12759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017065	TTAG	2	8	15125	15132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017065	GATA	2	8	19797	19804	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017065	AGCA	2	8	19865	19872	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017065	AGTA	2	8	20130	20137	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017065	AAAC	2	8	20180	20187	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017065	TAAA	2	8	20256	20263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017065	TTAT	2	8	20451	20458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017065	TTAT	2	8	27049	27056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017065	AGCA	2	8	27123	27130	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017065	AAGT	2	8	27575	27582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017065	TAAA	2	8	29074	29081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017065	GATA	2	8	29162	29169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017065	TAAT	2	8	30662	30669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017065	TTGT	2	8	37534	37541	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017065	AATG	2	8	38349	38356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017065	ATAA	2	8	39365	39372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017065	AACA	2	8	39462	39469	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017065	CTGA	2	8	41424	41431	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017065	ATTG	2	8	41594	41601	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017065	ATTA	2	8	42073	42080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017065	TGCT	2	8	42196	42203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017065	ATTA	2	8	42803	42810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017065	ATTA	2	8	43168	43175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017065	TAAA	2	8	43270	43277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017065	TACC	2	8	45351	45358	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017065	AAAC	2	8	45359	45366	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017065	TAAT	2	8	45435	45442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017065	ATTA	2	8	45470	45477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017065	TAAA	2	8	45488	45495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017065	ATGA	2	8	45692	45699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017065	TTAC	2	8	46674	46681	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017065	AGTA	2	8	49366	49373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017065	ATAC	2	8	49584	49591	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017065	CTTG	2	8	50566	50573	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017065	ATCT	2	8	51142	51149	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017065	TGCT	2	8	51306	51313	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017065	TTTA	2	8	51727	51734	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017065	TCAC	2	8	51836	51843	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017065	TAAA	2	8	51876	51883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017065	TTTA	2	8	52608	52615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017065	ATTA	2	8	52991	52998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017065	TGAT	2	8	55654	55661	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017065	TAAA	2	8	56436	56443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017065	ATCT	2	8	57641	57648	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017065	GTTT	2	8	59785	59792	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017065	TAAA	2	8	62942	62949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017065	ATTT	2	8	62963	62970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017065	ATTT	2	8	64965	64972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017065	TTAA	2	8	66627	66634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017065	TAGT	2	8	67118	67125	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017065	ATAA	2	8	69187	69194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017065	GTAA	2	8	69235	69242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017065	AAGT	2	8	73132	73139	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017065	CAAT	2	8	74465	74472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017065	CAAT	2	8	74750	74757	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017065	TAAG	2	8	75477	75484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017065	AGAA	2	8	75837	75844	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017065	CAAT	2	8	75973	75980	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017065	TAGA	2	8	76895	76902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017065	TAAA	2	8	76916	76923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017065	TTTA	2	8	76961	76968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017065	AAAT	2	8	77035	77042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017065	TAAA	2	8	78611	78618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017065	ATTT	2	8	78700	78707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017065	AAAT	2	8	84658	84665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017065	TATC	2	8	88498	88505	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017065	TAGC	2	8	88602	88609	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017065	TAAA	2	8	94101	94108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017065	TTTA	2	8	96749	96756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017065	AATT	2	8	97000	97007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017065	TAAA	2	8	98356	98363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017065	ATTA	2	8	98594	98601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017065	TCCA	2	8	101497	101504	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017065	AAGC	2	8	101592	101599	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017065	ATGT	2	8	103647	103654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017065	AAAG	2	8	108421	108428	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017065	TTTA	2	8	108613	108620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017065	ATTC	2	8	114016	114023	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017065	ATTA	2	8	114097	114104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017065	GAAA	2	8	114218	114225	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017065	ACTC	2	8	118157	118164	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017065	CAAA	2	8	118179	118186	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017065	AAGT	2	8	121516	121523	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017065	AAAT	2	8	122864	122871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017065	CTAC	2	8	123093	123100	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017065	AGTA	2	8	123202	123209	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017065	CGCT	2	8	125803	125810	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017065	TCAC	2	8	125832	125839	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017065	ACGT	2	8	128918	128925	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017065	ATTC	2	8	130310	130317	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017065	TAAT	2	8	130331	130338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017065	TTTA	2	8	130505	130512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017065	GAAA	2	8	131803	131810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017065	TAAT	2	8	132078	132085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017065	TTTG	2	8	132912	132919	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017065	AAAT	2	8	135303	135310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017065	CTGT	2	8	137758	137765	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017065	AAAC	2	8	152665	152672	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017065	GAAG	2	8	152809	152816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017065	TGAT	2	8	152860	152867	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017065	ATTA	2	8	153130	153137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017065	CGAT	2	8	153370	153377	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017065	TAAT	2	8	153501	153508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017065	TAGA	2	8	153900	153907	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017065	ATTT	2	8	154186	154193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017065	ATAA	2	8	154374	154381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017065	TACC	2	8	154816	154823	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017065	TTGC	2	8	155076	155083	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017065	AAAG	2	8	155524	155531	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017065	GGTG	2	8	155898	155905	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017065	ATAA	2	8	155908	155915	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017065	GCGA	2	8	159986	159993	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017065	TAAA	2	8	164196	164203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017065	TCTA	2	8	168668	168675	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017065	TTTA	2	8	168679	168686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017065	TTGA	2	8	170027	170034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017065	TTTA	2	8	171142	171149	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017065	TCAT	2	8	173998	174005	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017065	AAAT	2	8	177984	177991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017065	TTAA	2	8	181353	181360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017065	TCAA	2	8	181920	181927	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017065	ATAA	2	8	182499	182506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017065	TCAG	2	8	182725	182732	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017065	GTAT	2	8	191363	191370	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017065	CTAG	2	8	191524	191531	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017065	TTAC	2	8	194572	194579	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017065	AGTA	2	8	202210	202217	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017065	ATTG	2	8	202354	202361	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017065	ATTT	2	8	207302	207309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017065	CTTT	2	8	207376	207383	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017065	ATGT	2	8	207651	207658	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017065	TTTA	2	8	208508	208515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017065	TATT	2	8	211494	211501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017065	TGAT	2	8	211570	211577	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017065	TTAA	2	8	211602	211609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017065	TATT	2	8	212175	212182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017065	AGGT	2	8	212604	212611	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017065	AACC	2	8	212735	212742	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017065	ATTT	2	8	213016	213023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_017065	CTAA	2	8	216214	216221	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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