MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 7521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017065	TAT	2	6	718363	718368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017065	AAGA	2	8	718388	718395	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017065	ATTAC	2	10	718419	718428	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4005	NC_017065	AGA	2	6	718444	718449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017065	AT	3	6	718496	718501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017065	TGT	2	6	718528	718533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4011	NC_017065	AT	4	8	719918	719925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017065	TTC	2	6	719960	719965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_017065	A	6	6	720018	720023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017065	TTG	2	6	720040	720045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017065	TCT	2	6	720097	720102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4017	NC_017065	T	6	6	720134	720139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017065	ATTT	2	8	720149	720156	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4020	NC_017065	AATC	2	8	720186	720193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4022	NC_017065	AGTTT	2	10	720243	720252	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017065	AT	3	6	720289	720294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017065	TA	3	6	720353	720358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017065	TTG	2	6	723563	723568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4042	NC_017065	GCG	2	6	724854	724859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_017065	ATA	2	6	724953	724958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017065	TAA	2	6	724972	724977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4050	NC_017065	ATT	2	6	725674	725679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4052	NC_017065	ATTA	2	8	726438	726445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017065	TAAAA	2	10	726478	726487	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017065	AT	3	6	727494	727499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017065	AT	3	6	727518	727523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017065	ATT	2	6	727527	727532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4061	NC_017065	AT	3	6	728153	728158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017065	T	7	7	728209	728215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017065	AGA	2	6	728220	728225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017065	CAT	2	6	728246	728251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4071	NC_017065	TAA	2	6	729077	729082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017065	TA	4	8	729086	729093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017065	GTT	2	6	729104	729109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4089	NC_017065	CTA	2	6	732414	732419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4092	NC_017065	TTA	2	6	734700	734705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4099	NC_017065	TTG	2	6	735269	735274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017065	TGT	2	6	735313	735318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017065	TAA	2	6	735371	735376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017065	T	6	6	735417	735422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017065	A	6	6	735425	735430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017065	TATAAT	2	12	735467	735478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017065	ATT	2	6	735509	735514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017065	A	6	6	735515	735520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017065	TAT	2	6	735526	735531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4109	NC_017065	ACT	2	6	736572	736577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4111	NC_017065	TAA	2	6	736605	736610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017065	CTT	2	6	736635	736640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4114	NC_017065	TAT	2	6	738331	738336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017065	A	7	7	738343	738349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017065	T	7	7	738580	738586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017065	A	7	7	738623	738629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017065	GCGA	2	8	739207	739214	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4119	NC_017065	TAA	2	6	739289	739294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017065	CAA	2	6	739372	739377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4122	NC_017065	TTTG	2	8	740858	740865	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4129	NC_017065	ATAA	2	8	741727	741734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017065	TAAAT	2	10	742244	742253	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_017065	AT	3	6	742255	742260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017065	AAAT	2	8	742274	742281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_017065	TA	3	6	742291	742296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017065	TTCT	2	8	742965	742972	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4135	NC_017065	TAA	2	6	742983	742988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_017065	ATA	2	6	743086	743091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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