MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 7521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017065	TAG	2	6	264624	264629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017065	AAT	2	6	264944	264949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017065	ATTAG	2	10	264979	264988	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017065	AGA	2	6	265035	265040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017065	ATT	2	6	265068	265073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017065	AAG	2	6	265310	265315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017065	AAATAA	2	12	265321	265332	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017065	AAAATG	2	12	265387	265398	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017065	AAT	2	6	265419	265424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017065	TAA	2	6	265466	265471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017065	ATA	2	6	265486	265491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017065	AAAT	2	8	265528	265535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017065	TAA	2	6	265544	265549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017065	ATAG	2	8	265581	265588	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017065	AAT	2	6	265760	265765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017065	TGA	2	6	265843	265848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017065	GCT	2	6	265879	265884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_017065	A	6	6	266085	266090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017065	GTT	2	6	266100	266105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017065	AGC	2	6	266114	266119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_017065	AG	3	6	266142	266147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017065	AAGGA	2	10	266164	266173	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017065	AGA	2	6	266195	266200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017065	AAG	2	6	266275	266280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017065	ATA	2	6	267528	267533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017065	TTA	2	6	267551	267556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017065	ATC	2	6	267564	267569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_017065	ATA	2	6	267807	267812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017065	A	6	6	267815	267820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017065	A	6	6	268044	268049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017065	A	6	6	268077	268082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017065	T	9	9	268098	268106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017065	T	6	6	268108	268113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017065	GCT	2	6	268136	268141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_017065	ATA	2	6	268193	268198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017065	T	6	6	270676	270681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1538	NC_017065	TA	4	8	271075	271082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017065	T	6	6	273375	273380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017065	AT	3	6	273402	273407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017065	A	7	7	273416	273422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017065	AGC	2	6	274048	274053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_017065	ATA	2	6	274080	274085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017065	ATGACG	2	12	274128	274139	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1545	NC_017065	ATA	2	6	276185	276190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017065	A	7	7	276205	276211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017065	T	6	6	276966	276971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1549	NC_017065	AAT	2	6	277312	277317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017065	GAA	2	6	277369	277374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017065	CTA	2	6	277424	277429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_017065	ACT	2	6	277432	277437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_017065	AAAAT	2	10	277529	277538	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017065	TAA	2	6	277553	277558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017065	TAGT	2	8	277637	277644	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017065	GCT	2	6	277662	277667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1558	NC_017065	ATA	2	6	277791	277796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017065	AGT	2	6	277831	277836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017065	GTA	2	6	277839	277844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017065	CGA	2	6	277860	277865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_017065	GCTT	2	8	277872	277879	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_017065	CAA	2	6	277946	277951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_017065	AT	3	6	278011	278016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017065	ACA	2	6	278018	278023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_017065	TAA	2	6	278034	278039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017065	GCA	2	6	278041	278046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1569	NC_017065	A	6	6	278073	278078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017065	TTA	2	6	278096	278101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017065	GA	3	6	278137	278142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017065	ATTGCA	2	12	278176	278187	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1574	NC_017065	AT	3	6	278212	278217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017065	TGA	2	6	278223	278228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1577	NC_017065	TAC	2	6	278301	278306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1580	NC_017065	TGC	2	6	278622	278627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_017065	A	7	7	278661	278667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017065	A	6	6	278710	278715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1584	NC_017065	TAT	2	6	278882	278887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1591	NC_017065	TA	3	6	279335	279340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017065	A	6	6	279349	279354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1597	NC_017065	TAT	2	6	279487	279492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017065	GTT	2	6	282256	282261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017065	GTC	2	6	282329	282334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1601	NC_017065	TTG	2	6	282349	282354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017065	CAA	2	6	282427	282432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_017065	AGC	2	6	282442	282447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_017065	ATA	2	6	282474	282479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017065	TTA	2	6	282507	282512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1608	NC_017065	TAA	2	6	283720	283725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1611	NC_017065	GAA	2	6	283930	283935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017065	T	6	6	283944	283949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017065	TA	3	6	283967	283972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017065	TG	3	6	284005	284010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_017065	AT	3	6	284018	284023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017065	TAA	2	6	284027	284032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017065	CCT	2	6	284471	284476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_017065	TTAT	2	8	284493	284500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017065	TAT	2	6	284523	284528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017065	T	6	6	284528	284533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017065	ATT	2	6	284541	284546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017065	ATT	2	6	284557	284562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017065	TAT	2	6	284578	284583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017065	CTTT	2	8	284613	284620	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1625	NC_017065	TAT	3	9	286110	286118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017065	A	6	6	286129	286134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017065	TAAT	2	8	286223	286230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017065	TAG	2	6	286232	286237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1630	NC_017065	TAAAAT	2	12	286732	286743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017065	ATC	2	6	286789	286794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1634	NC_017065	AATT	2	8	286921	286928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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