MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 7521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017065	ACA	2	6	167782	167787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_017065	TCTA	2	8	168668	168675	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_017065	TTTA	2	8	168679	168686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017065	AGA	2	6	169975	169980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017065	A	6	6	169997	170002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017065	TTGA	2	8	170027	170034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017065	AGT	2	6	170042	170047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017065	AAT	2	6	170115	170120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017065	TAA	2	6	170149	170154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017065	T	6	6	170175	170180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017065	ATA	2	6	170231	170236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017065	GTA	2	6	171016	171021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017065	A	7	7	171050	171056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017065	TTTTAA	2	12	171063	171074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017065	T	6	6	171093	171098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017065	TTTA	2	8	171142	171149	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017065	GAG	2	6	171554	171559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017065	ATA	2	6	171590	171595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017065	A	6	6	172179	172184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017065	TCAT	2	8	173998	174005	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_017065	T	6	6	174074	174079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017065	A	7	7	174111	174117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017065	TA	4	8	174118	174125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017065	TA	4	8	174914	174921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017065	T	7	7	174924	174930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017065	T	8	8	174937	174944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017065	ATT	2	6	175336	175341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017065	AG	3	6	175346	175351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017065	A	6	6	175352	175357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017065	AAAT	2	8	177984	177991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017065	GTT	2	6	177992	177997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017065	TAT	2	6	178032	178037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017065	T	6	6	178043	178048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017065	AAT	2	6	178049	178054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017065	TAA	2	6	178067	178072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017065	T	6	6	178083	178088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017065	T	6	6	178194	178199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017065	AG	3	6	178236	178241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017065	AAG	2	6	178347	178352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017065	TAA	2	6	178355	178360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017065	TTG	2	6	179235	179240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017065	CGT	2	6	179251	179256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1045	NC_017065	TG	3	6	179277	179282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017065	ATA	2	6	179297	179302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017065	A	6	6	179302	179307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017065	T	7	7	179324	179330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017065	ATG	2	6	179369	179374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017065	GTA	2	6	180624	180629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017065	TAA	3	9	180633	180641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017065	A	6	6	180640	180645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017065	AT	3	6	180679	180684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017065	TAT	2	6	180692	180697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017065	TAA	2	6	181285	181290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017065	T	6	6	181293	181298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017065	ATT	2	6	181306	181311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017065	A	6	6	181320	181325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017065	TTAA	2	8	181353	181360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017065	GTA	2	6	181377	181382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017065	TC	3	6	181384	181389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_017065	A	6	6	181395	181400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017065	A	6	6	181410	181415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017065	ATT	2	6	181831	181836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017065	TAA	2	6	181865	181870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017065	TTG	2	6	181876	181881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017065	GTT	2	6	181887	181892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017065	TCAA	2	8	181920	181927	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_017065	AAC	2	6	181929	181934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_017065	T	7	7	181949	181955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1073	NC_017065	AAG	2	6	182070	182075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017065	T	7	7	182100	182106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017065	AAT	2	6	182149	182154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017065	ATT	2	6	182187	182192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017065	A	8	8	182276	182283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017065	TAT	2	6	182284	182289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017065	CAA	2	6	182299	182304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1082	NC_017065	TATTT	2	10	182422	182431	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017065	ATAA	2	8	182499	182506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017065	TA	3	6	182516	182521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017065	ATT	2	6	182555	182560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017065	TAA	2	6	182588	182593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017065	TTA	2	6	182613	182618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017065	A	7	7	182626	182632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017065	TCAG	2	8	182725	182732	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1093	NC_017065	TA	3	6	187088	187093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017065	CGCTC	2	10	191312	191321	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1095	NC_017065	GTAT	2	8	191363	191370	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_017065	CAA	2	6	191511	191516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_017065	CTAG	2	8	191524	191531	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_017065	TAC	2	6	191557	191562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017065	ATT	2	6	191565	191570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017065	A	8	8	191574	191581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017065	A	7	7	191588	191594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017065	T	6	6	191599	191604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017065	ATT	2	6	192801	192806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017065	A	6	6	192839	192844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017065	ATA	2	6	192946	192951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017065	GTC	2	6	194505	194510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_017065	AGC	2	6	194517	194522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_017065	TTAC	2	8	194572	194579	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_017065	A	6	6	194601	194606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017065	AT	5	10	195514	195523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017065	AAGAG	2	10	195552	195561	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017065	TA	3	6	196057	196062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017065	TAA	2	6	196077	196082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017065	GTT	2	6	197911	197916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017065	TTA	2	6	197922	197927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017065	A	7	7	198026	198032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017065	A	6	6	198036	198041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017065	CAA	2	6	198170	198175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_017065	GTT	2	6	200333	200338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1124	NC_017065	GCA	2	6	200376	200381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_017065	T	7	7	200421	200427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017065	ATT	2	6	200428	200433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017065	T	6	6	200432	200437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017065	AAT	2	6	200469	200474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017065	CA	3	6	200486	200491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_017065	CAA	2	6	200537	200542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_017065	A	6	6	200626	200631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017065	ATA	2	6	201414	201419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017065	T	6	6	201441	201446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017065	TAA	2	6	202198	202203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017065	AGTA	2	8	202210	202217	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017065	TTA	2	6	202301	202306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_017065	ACG	2	6	202308	202313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1139	NC_017065	T	6	6	202376	202381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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