MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 7521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017065	TAT	2	6	874491	874496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017065	TATG	2	8	874539	874546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017065	TTA	2	6	874549	874554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017065	T	6	6	874562	874567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017065	TGT	2	6	874581	874586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017065	TAA	2	6	874597	874602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017065	CTTT	2	8	874605	874612	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5009	NC_017065	TAG	2	6	875049	875054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017065	CAT	2	6	875399	875404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_017065	TA	3	6	875420	875425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017065	ATTA	2	8	875440	875447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017065	ATTT	2	8	875471	875478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017065	CT	3	6	875555	875560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_017065	T	7	7	875566	875572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017065	A	6	6	877099	877104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017065	CGAT	2	8	877135	877142	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5018	NC_017065	TTC	2	6	877195	877200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_017065	ACA	2	6	877208	877213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_017065	ACA	2	6	877235	877240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_017065	T	6	6	877644	877649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017065	T	7	7	877665	877671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017065	ATAA	2	8	878035	878042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017065	T	8	8	878468	878475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017065	CAAA	2	8	878512	878519	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5026	NC_017065	T	6	6	878520	878525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017065	TC	3	6	878551	878556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5028	NC_017065	CT	3	6	878575	878580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5029	NC_017065	TAA	2	6	878762	878767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017065	CAAT	2	8	878850	878857	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5031	NC_017065	A	7	7	878858	878864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017065	TCT	2	6	878895	878900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_017065	GCT	2	6	878950	878955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_017065	A	6	6	879079	879084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017065	TGTT	2	8	879104	879111	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017065	T	6	6	879118	879123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017065	TGC	2	6	879314	879319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_017065	TA	3	6	879322	879327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017065	CTT	2	6	880922	880927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_017065	GAG	2	6	880964	880969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017065	AGT	2	6	881000	881005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017065	ATC	2	6	881067	881072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_017065	CA	3	6	881073	881078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_017065	TAA	2	6	881686	881691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017065	GAA	2	6	881711	881716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017065	AAG	2	6	881729	881734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017065	AAT	2	6	881740	881745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5049	NC_017065	A	8	8	881824	881831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017065	CTAG	2	8	881898	881905	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5051	NC_017065	ACA	2	6	881927	881932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_017065	TAA	2	6	882629	882634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017065	AATT	2	8	882676	882683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017065	AT	3	6	882705	882710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_017065	ATT	2	6	882770	882775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017065	GAA	2	6	882837	882842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017065	ATA	2	6	882858	882863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017065	TAT	2	6	882883	882888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017065	TCTGAC	2	12	882896	882907	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_017065	TTTAG	2	10	883002	883011	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017065	CAAA	2	8	883031	883038	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5062	NC_017065	GTA	2	6	883104	883109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_017065	CAA	2	6	883116	883121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_017065	AAC	2	6	883210	883215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_017065	ATT	2	6	883308	883313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_017065	TGA	2	6	883317	883322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017065	ATT	2	6	884032	884037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017065	GATT	2	8	884041	884048	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017065	A	7	7	884073	884079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017065	TAA	2	6	884092	884097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017065	A	8	8	884096	884103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017065	TAT	2	6	884105	884110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017065	TAA	2	6	884817	884822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5081	NC_017065	T	6	6	885632	885637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5101	NC_017065	TA	3	6	887986	887991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5105	NC_017065	A	6	6	888098	888103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017065	T	6	6	888107	888112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5110	NC_017065	ATC	2	6	888170	888175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5112	NC_017065	TGA	2	6	888626	888631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5114	NC_017065	T	6	6	888697	888702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017065	T	7	7	888764	888770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5117	NC_017065	TCAAT	2	10	889182	889191	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5122	NC_017065	GAAA	2	8	890426	890433	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5126	NC_017065	A	7	7	890728	890734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5129	NC_017065	T	6	6	890838	890843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_017065	AT	3	6	890857	890862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_017065	TA	3	6	890887	890892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_017065	ATT	2	6	890896	890901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_017065	T	7	7	890900	890906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_017065	AAATT	2	10	891422	891431	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_017065	ATA	2	6	891566	891571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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