MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 8029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017062	TA	3	6	582477	582482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017062	GAT	2	6	582489	582494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017062	ATT	2	6	582495	582500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017062	TTG	2	6	582524	582529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017062	AT	3	6	582530	582535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017062	ATT	2	6	582602	582607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017062	T	6	6	582606	582611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017062	AAT	2	6	582683	582688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017062	ATG	2	6	582709	582714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017062	T	6	6	582786	582791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017062	ATA	2	6	582884	582889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017062	TAA	2	6	582922	582927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017062	A	6	6	582940	582945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017062	A	6	6	583020	583025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017062	A	6	6	583056	583061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017062	ATA	2	6	583080	583085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017062	AT	3	6	583149	583154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017062	TA	3	6	583161	583166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017062	ATTA	2	8	583183	583190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017062	TAA	2	6	583198	583203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017062	TAG	2	6	583237	583242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017062	TA	3	6	584162	584167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017062	TAA	2	6	584187	584192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017062	ATAA	2	8	584232	584239	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017062	TG	4	8	584243	584250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017062	GTT	2	6	584337	584342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017062	ATG	2	6	584355	584360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017062	ATAA	2	8	584437	584444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017062	GATT	2	8	584450	584457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017062	AAT	2	6	584460	584465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017062	TAA	2	6	584489	584494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017062	AAT	2	6	584505	584510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017062	CTG	2	6	584515	584520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_017062	GTT	2	6	584525	584530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017062	TAC	2	6	584547	584552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_017062	AGT	2	6	584585	584590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017062	TGTCAT	2	12	584623	584634	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4038	NC_017062	TATT	2	8	584668	584675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017062	ATC	3	9	584775	584783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_017062	ATT	2	6	584821	584826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017062	CTAT	2	8	584855	584862	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_017062	ATT	2	6	584869	584874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017062	ATCT	2	8	584903	584910	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4044	NC_017062	AT	4	8	584913	584920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017062	A	6	6	584937	584942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017062	ATC	2	6	584948	584953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_017062	TTA	2	6	584963	584968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017062	ATA	3	9	584996	585004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017062	TAA	2	6	585028	585033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017062	A	6	6	585070	585075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017062	TTA	2	6	585093	585098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017062	TA	3	6	585114	585119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017062	TG	4	8	585130	585137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017062	TA	3	6	585156	585161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017062	TTA	2	6	585167	585172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017062	TAA	3	9	585181	585189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017062	AT	3	6	585198	585203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017062	ATAA	2	8	585297	585304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017062	TAA	2	6	585319	585324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017062	A	6	6	585323	585328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017062	AAC	2	6	585365	585370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_017062	TAG	2	6	585375	585380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017062	TTTC	2	8	585386	585393	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4064	NC_017062	AAT	2	6	585535	585540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017062	TTTTA	2	10	586579	586588	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017062	TA	3	6	586622	586627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017062	ATT	2	6	586628	586633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017062	TAA	2	6	586635	586640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017062	TGTT	2	8	587369	587376	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017062	TA	3	6	587377	587382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017062	TAT	2	6	587391	587396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017062	ATT	3	9	587410	587418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017062	ATGT	2	8	587908	587915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017062	TAG	2	6	587985	587990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017062	TCT	2	6	588030	588035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_017062	TG	3	6	588037	588042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017062	GCAT	2	8	588085	588092	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4078	NC_017062	AT	3	6	588120	588125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017062	TGA	2	6	588134	588139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017062	TAT	2	6	588158	588163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017062	TAA	2	6	588210	588215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017062	TA	3	6	588234	588239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017062	AAT	2	6	588254	588259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017062	TGT	2	6	588986	588991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017062	TA	3	6	588997	589002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017062	TG	3	6	589029	589034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_017062	ATC	2	6	589049	589054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_017062	AAT	2	6	589073	589078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_017062	AATG	2	8	589081	589088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017062	TAT	2	6	591569	591574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017062	ATA	3	9	591592	591600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017062	TTTA	2	8	591639	591646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017062	AAT	2	6	591768	591773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017062	TGTTT	2	10	591780	591789	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_017062	TGA	2	6	591792	591797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017062	TA	3	6	593190	593195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017062	ATA	2	6	593225	593230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017062	ATA	2	6	593273	593278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017062	T	6	6	593302	593307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017062	TTA	2	6	593319	593324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017062	T	6	6	593349	593354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017062	TTG	2	6	593358	593363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017062	A	6	6	593420	593425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017062	AGCCTC	2	12	593505	593516	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_017062	TAA	2	6	593525	593530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017062	GTT	3	9	593543	593551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017062	AAT	2	6	593563	593568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017062	AT	3	6	593576	593581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017062	TTTTTA	2	12	593668	593679	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017062	TAC	2	6	596874	596879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_017062	GATT	2	8	596899	596906	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017062	T	6	6	596922	596927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017062	A	6	6	596944	596949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017062	TTAA	2	8	596963	596970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017062	TA	3	6	598661	598666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017062	A	6	6	598713	598718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017062	TAT	2	6	599834	599839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017062	GGA	2	6	599881	599886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017062	ATAGAA	2	12	599954	599965	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017062	AATA	2	8	599974	599981	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017062	TAA	2	6	599998	600003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017062	ACT	2	6	601784	601789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_017062	ACA	2	6	601794	601799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_017062	TA	3	6	601812	601817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017062	A	7	7	601817	601823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017062	AAAT	2	8	603173	603180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017062	AAT	2	6	603183	603188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017062	ATTA	2	8	603214	603221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017062	ATAA	2	8	603239	603246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017062	TAT	2	6	603253	603258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_017062	ATA	2	6	603263	603268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017062	ACA	2	6	603283	603288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_017062	ATT	2	6	603316	603321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017062	TTATA	2	10	604094	604103	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_017062	TTA	2	6	606494	606499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_017062	TA	3	6	606498	606503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4138	NC_017062	AT	3	6	606549	606554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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