MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 8029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017062	AT	3	6	510982	510987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_017062	TA	3	6	511023	511028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_017062	TGT	2	6	511099	511104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_017062	AAGTA	2	10	511145	511154	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_017062	TAT	2	6	511164	511169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_017062	TA	3	6	511179	511184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_017062	TCT	2	6	511205	511210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_017062	TAC	2	6	511233	511238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_017062	T	6	6	511251	511256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_017062	TTA	2	6	511272	511277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_017062	TCA	2	6	511283	511288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_017062	AAT	2	6	511324	511329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_017062	T	8	8	511340	511347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_017062	AAG	2	6	511386	511391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_017062	ATA	2	6	511404	511409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_017062	GAAA	2	8	511445	511452	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_017062	TACA	2	8	513547	513554	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3518	NC_017062	TGT	2	6	513618	513623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_017062	TAAAAA	2	12	513644	513655	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_017062	A	7	7	518345	518351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_017062	TAT	2	6	518399	518404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_017062	T	6	6	518418	518423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_017062	AAGAAC	2	12	518456	518467	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3524	NC_017062	TTAA	2	8	518488	518495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_017062	T	6	6	518556	518561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_017062	CGTG	2	8	518567	518574	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3527	NC_017062	AAT	2	6	518591	518596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_017062	TAA	2	6	518604	518609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_017062	ATG	2	6	519194	519199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3531	NC_017062	ACA	2	6	519213	519218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_017062	TCT	2	6	521727	521732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_017062	ATTTTT	2	12	521743	521754	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_017062	ATT	2	6	521775	521780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_017062	TAA	2	6	521784	521789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3537	NC_017062	ATT	2	6	521853	521858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_017062	TCT	2	6	521864	521869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_017062	T	7	7	521892	521898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3542	NC_017062	AAT	2	6	522599	522604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_017062	TTA	3	9	522606	522614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_017062	T	6	6	522624	522629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_017062	ATTA	2	8	522630	522637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3553	NC_017062	T	6	6	524467	524472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3557	NC_017062	ATT	2	6	526510	526515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3562	NC_017062	TGT	2	6	527506	527511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017062	ATATT	2	10	527542	527551	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_017062	T	6	6	527606	527611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_017062	TAA	2	6	527620	527625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_017062	TAT	3	9	527636	527644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3568	NC_017062	GTA	2	6	529071	529076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3604	NC_017062	T	6	6	534562	534567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_017062	ATT	2	6	534576	534581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3609	NC_017062	TA	3	6	534672	534677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_017062	A	7	7	535254	535260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3620	NC_017062	A	6	6	537326	537331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_017062	TATT	2	8	537344	537351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_017062	GGTCA	2	10	537358	537367	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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