MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 8029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017062	AAAT	3	12	453780	453791	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017062	ATT	2	6	453809	453814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017062	A	6	6	455432	455437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017062	TGAA	2	8	455444	455451	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017062	AACA	2	8	455477	455484	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3006	NC_017062	ATA	2	6	456475	456480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017062	GTCA	2	8	456483	456490	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3008	NC_017062	TA	3	6	456491	456496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017062	ACA	2	6	456499	456504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_017062	A	6	6	456504	456509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017062	ATT	2	6	458834	458839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_017062	A	7	7	458892	458898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017062	TAA	3	9	458900	458908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_017062	ATT	2	6	458951	458956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017062	TAAT	2	8	459074	459081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_017062	TAA	2	6	460480	460485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_017062	TTA	2	6	460486	460491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_017062	A	8	8	460553	460560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017062	AAT	2	6	460596	460601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017062	ATT	2	6	460606	460611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017062	T	6	6	460683	460688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017062	TAT	2	6	460724	460729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017062	GAA	2	6	460732	460737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017062	ATTT	2	8	460770	460777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017062	AT	3	6	460788	460793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017062	TAAC	2	8	460795	460802	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_017062	AT	3	6	460821	460826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017062	AT	3	6	460856	460861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_017062	AATT	2	8	460864	460871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017062	ATG	2	6	460904	460909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017062	CAATA	2	10	462212	462221	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3032	NC_017062	CAA	2	6	462252	462257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_017062	CATG	2	8	462302	462309	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_017062	AATC	2	8	462333	462340	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3035	NC_017062	T	6	6	462380	462385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017062	TCT	2	6	462421	462426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_017062	CTT	2	6	462446	462451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_017062	T	7	7	462481	462487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017062	TTA	2	6	462800	462805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017062	TAA	2	6	462827	462832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017062	TC	3	6	462873	462878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_017062	TAATA	2	10	462895	462904	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017062	ATGGT	2	10	462907	462916	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_017062	TTC	2	6	462934	462939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_017062	AT	3	6	462960	462965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_017062	ATGT	2	8	463011	463018	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_017062	TTA	2	6	463025	463030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_017062	TTA	2	6	463046	463051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_017062	ATA	2	6	463107	463112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_017062	AAT	2	6	463179	463184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_017062	AT	3	6	463196	463201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_017062	TTA	2	6	463207	463212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017062	TAT	2	6	463241	463246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017062	ATA	2	6	463262	463267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017062	TAT	2	6	463305	463310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_017062	ATTG	2	8	463324	463331	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_017062	TTA	2	6	463388	463393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_017062	TAT	2	6	463427	463432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_017062	ATTT	2	8	463445	463452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_017062	TAT	2	6	463484	463489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017062	TTTA	2	8	463500	463507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017062	T	6	6	463548	463553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017062	TA	3	6	463563	463568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017062	AAT	2	6	463672	463677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017062	ATT	2	6	463682	463687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_017062	TTA	2	6	463729	463734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017062	ATT	2	6	463742	463747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017062	TTGCT	2	10	463766	463775	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3069	NC_017062	TTTA	2	8	463785	463792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017062	T	6	6	463813	463818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_017062	TTTAA	2	10	463875	463884	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_017062	AT	4	8	464852	464859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_017062	A	6	6	464897	464902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_017062	AT	3	6	465019	465024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_017062	ATT	2	6	465067	465072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_017062	ATT	2	6	465114	465119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3078	NC_017062	AAGAT	2	10	465166	465175	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_017062	ATT	2	6	465187	465192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_017062	ATA	2	6	465230	465235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_017062	TAG	2	6	465244	465249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3083	NC_017062	A	7	7	465323	465329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3091	NC_017062	TAA	2	6	465458	465463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_017062	CAA	2	6	465494	465499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3101	NC_017062	ATT	2	6	467272	467277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017062	A	6	6	469803	469808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3105	NC_017062	TGT	2	6	469897	469902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3109	NC_017062	TCT	2	6	470151	470156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3113	NC_017062	A	7	7	470228	470234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_017062	TCTA	2	8	470248	470255	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3115	NC_017062	ATC	2	6	470302	470307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3119	NC_017062	AAT	2	6	470507	470512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3121	NC_017062	A	6	6	470556	470561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017062	A	6	6	470577	470582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_017062	T	7	7	470596	470602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017062	ATT	2	6	470617	470622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3129	NC_017062	CA	3	6	470738	470743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3130	NC_017062	ATA	2	6	470744	470749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3133	NC_017062	T	6	6	470885	470890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_017062	ATTT	2	8	470897	470904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_017062	TAT	2	6	470925	470930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_017062	CAT	2	6	470954	470959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3137	NC_017062	CTT	2	6	471001	471006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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