MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 8029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017062	TAA	2	6	315863	315868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_017062	A	6	6	315867	315872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_017062	TTA	2	6	315873	315878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_017062	ATC	2	6	315894	315899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_017062	T	7	7	315928	315934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_017062	TATT	2	8	315942	315949	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_017062	AT	5	10	315951	315960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_017062	T	6	6	315966	315971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_017062	TA	3	6	315995	316000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_017062	TA	3	6	316002	316007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_017062	GGT	2	6	316118	316123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_017062	T	6	6	316149	316154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_017062	TAT	2	6	316208	316213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_017062	ATAG	2	8	316218	316225	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_017062	ATT	2	6	316240	316245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_017062	TAA	2	6	316310	316315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_017062	TTTG	2	8	316328	316335	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_017062	TAT	2	6	316368	316373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_017062	GT	3	6	316387	316392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_017062	ATAC	2	8	316410	316417	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2023	NC_017062	ATC	2	6	317406	317411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2024	NC_017062	TAT	2	6	317455	317460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_017062	GTTAT	2	10	319489	319498	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_017062	TGA	2	6	319551	319556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2027	NC_017062	TTAT	2	8	320572	320579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2034	NC_017062	T	6	6	321858	321863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_017062	AT	3	6	321870	321875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2041	NC_017062	ATTTT	2	10	322052	322061	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_017062	ATT	2	6	322070	322075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_017062	TAAT	2	8	322105	322112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_017062	TA	3	6	322117	322122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_017062	TAA	2	6	322163	322168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2046	NC_017062	TAA	2	6	324034	324039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_017062	A	6	6	324088	324093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_017062	AACG	2	8	324159	324166	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2049	NC_017062	TACT	2	8	324201	324208	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2050	NC_017062	TATAA	2	10	324229	324238	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_017062	ATA	2	6	324241	324246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_017062	ATT	2	6	324308	324313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_017062	ATG	2	6	324317	324322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_017062	TACT	2	8	324335	324342	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2055	NC_017062	ATA	2	6	324417	324422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2057	NC_017062	TTA	2	6	324449	324454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2061	NC_017062	AAG	2	6	324533	324538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_017062	TTAT	2	8	324633	324640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_017062	ATT	2	6	324646	324651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_017062	ATA	2	6	324698	324703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2065	NC_017062	A	6	6	324703	324708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_017062	T	8	8	324748	324755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2073	NC_017062	A	6	6	325404	325409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2108	NC_017062	TATT	2	8	332776	332783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2109	NC_017062	TTAC	2	8	332785	332792	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2110	NC_017062	AT	3	6	332809	332814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2120	NC_017062	ATTTT	2	10	333714	333723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2121	NC_017062	T	6	6	333720	333725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2122	NC_017062	AT	3	6	333853	333858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2137	NC_017062	T	6	6	335135	335140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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