MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 8029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017062	AAT	2	6	92478	92483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017062	TAT	2	6	92484	92489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017062	TTA	2	6	92493	92498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017062	TAA	2	6	92513	92518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017062	TTA	2	6	92525	92530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017062	TA	3	6	92529	92534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017062	TTTA	2	8	92549	92556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017062	TA	3	6	92555	92560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017062	ATG	2	6	92562	92567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017062	AT	3	6	92587	92592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017062	TTC	2	6	92606	92611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017062	ATA	2	6	92673	92678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017062	AAT	2	6	92706	92711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017062	ATT	2	6	93558	93563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017062	TTA	2	6	95575	95580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017062	AT	3	6	95611	95616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017062	TTA	2	6	95617	95622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017062	T	6	6	95639	95644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017062	AT	3	6	95651	95656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017062	TA	3	6	95725	95730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017062	AAGT	2	8	101649	101656	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017062	T	6	6	101663	101668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017062	T	7	7	101674	101680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017062	AAT	2	6	101681	101686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017062	TATT	2	8	103204	103211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017062	CAAA	2	8	103249	103256	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
527	NC_017062	T	6	6	103261	103266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017062	TAAA	2	8	103278	103285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017062	TA	3	6	103343	103348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017062	TAA	2	6	103357	103362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017062	T	6	6	103411	103416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017062	ATCT	2	8	103495	103502	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
533	NC_017062	CAG	2	6	103515	103520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_017062	TAA	2	6	103527	103532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017062	ATT	2	6	103543	103548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017062	T	6	6	103762	103767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017062	TTA	2	6	103800	103805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017062	TAC	2	6	103815	103820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017062	AAT	2	6	103844	103849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017062	AT	3	6	103916	103921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017062	GGA	2	6	103947	103952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017062	ATA	2	6	103959	103964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017062	AGA	2	6	103982	103987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017062	ATT	2	6	104010	104015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017062	TACAAG	2	12	104018	104029	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
546	NC_017062	GATT	2	8	104030	104037	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017062	TAA	3	9	104092	104100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017062	TAA	2	6	104120	104125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017062	ATT	2	6	104127	104132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017062	GAT	2	6	104145	104150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017062	ATTA	2	8	104159	104166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017062	ATA	2	6	104176	104181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017062	TAT	2	6	104194	104199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017062	TCA	2	6	104208	104213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_017062	GCA	2	6	104238	104243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_017062	TAAT	2	8	104256	104263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017062	T	6	6	104268	104273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017062	ATG	2	6	104295	104300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017062	AT	3	6	104307	104312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017062	A	6	6	104375	104380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017062	TCA	2	6	104439	104444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_017062	TAAT	2	8	104480	104487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017062	ATT	2	6	104521	104526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017062	AATA	2	8	104529	104536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017062	TAG	2	6	104581	104586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017062	TTA	2	6	104614	104619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017062	AAT	2	6	104731	104736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017062	GTA	2	6	104766	104771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017062	CT	3	6	104780	104785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
570	NC_017062	TAA	2	6	104796	104801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017062	CAA	2	6	104802	104807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017062	A	7	7	104865	104871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017062	TTAT	2	8	104881	104888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017062	TATAA	2	10	104889	104898	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017062	AT	3	6	104905	104910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017062	TATT	2	8	104987	104994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017062	T	6	6	104993	104998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017062	TAT	2	6	105093	105098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017062	TAT	3	9	105111	105119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017062	AT	4	8	105121	105128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017062	ATT	2	6	105135	105140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017062	AGT	2	6	105185	105190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017062	TCA	2	6	105230	105235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_017062	A	6	6	105709	105714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017062	TAA	2	6	105717	105722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017062	TCA	2	6	105750	105755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_017062	CTA	2	6	105763	105768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_017062	TCT	2	6	105992	105997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_017062	TTG	2	6	106006	106011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017062	TAG	2	6	106068	106073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017062	CTG	2	6	106107	106112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_017062	TCTT	2	8	106116	106123	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
593	NC_017062	ATT	2	6	106139	106144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017062	ATA	2	6	106173	106178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017062	TA	3	6	106217	106222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017062	AT	4	8	108504	108511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017062	AGT	2	6	108525	108530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017062	AAT	2	6	108548	108553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017062	A	7	7	108583	108589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017062	ATT	3	9	109792	109800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017062	TTA	3	9	109820	109828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017062	ATTTT	2	10	109835	109844	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017062	AAT	2	6	109849	109854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017062	AAC	2	6	109909	109914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017062	A	6	6	109936	109941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017062	ATTA	2	8	109946	109953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017062	TTAT	2	8	110005	110012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017062	T	6	6	111874	111879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017062	ATTA	2	8	111936	111943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017062	TA	3	6	111950	111955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017062	TGA	2	6	111977	111982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017062	TTC	2	6	112007	112012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017062	T	7	7	112034	112040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017062	T	7	7	112053	112059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017062	ATT	2	6	112080	112085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017062	AT	3	6	112088	112093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017062	T	6	6	112170	112175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017062	AAT	2	6	112240	112245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017062	ATT	2	6	112268	112273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017062	CT	3	6	113096	113101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_017062	ATTT	2	8	113106	113113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017062	TATT	2	8	113138	113145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017062	ATAG	2	8	113163	113170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017062	ATT	2	6	113194	113199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017062	ATT	2	6	113208	113213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017062	T	6	6	113220	113225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017062	ATT	2	6	113242	113247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017062	ATT	2	6	113264	113269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017062	TAA	2	6	115253	115258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017062	TTG	2	6	116665	116670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017062	TA	3	6	116680	116685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017062	A	6	6	116732	116737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017062	ATAA	2	8	116742	116749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017062	TAT	2	6	117273	117278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017062	ATA	2	6	117962	117967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017062	AAAC	2	8	117980	117987	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
637	NC_017062	TAT	2	6	118033	118038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017062	TAG	2	6	118102	118107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017062	ATT	2	6	118108	118113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017062	ATT	2	6	118126	118131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_017062	TAAAAG	2	12	118133	118144	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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643	NC_017062	TAA	2	6	118183	118188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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668	NC_017062	ATT	2	6	121689	121694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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