MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 8029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017062	AATTG	2	10	700006	700015	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017062	ATAA	2	8	700019	700026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017062	TAACA	2	10	705729	705738	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5004	NC_017062	GAA	2	6	705750	705755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017062	ATG	2	6	705766	705771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017062	AT	3	6	705834	705839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017062	ATA	2	6	705943	705948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017062	TA	3	6	705963	705968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017062	CTA	2	6	706032	706037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_017062	TAAA	2	8	706042	706049	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017062	GGAT	2	8	706097	706104	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017062	TAAT	2	8	706147	706154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017062	TCTAT	2	10	706182	706191	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5014	NC_017062	TCT	2	6	706209	706214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_017062	ATT	2	6	706285	706290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017062	ATC	2	6	706300	706305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_017062	A	6	6	706322	706327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017062	TA	3	6	706328	706333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017062	ATA	2	6	706347	706352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017062	ACT	2	6	706359	706364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_017062	AAT	2	6	706367	706372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017062	T	7	7	706374	706380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017062	ATGAAA	2	12	706385	706396	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017062	ATA	2	6	706422	706427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017062	TAA	3	9	708622	708630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017062	AATA	2	8	708656	708663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017062	GAT	2	6	708709	708714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017062	ATT	2	6	708722	708727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017062	ATT	2	6	708739	708744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017062	ACT	2	6	708783	708788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_017062	ATC	2	6	708829	708834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_017062	TAA	2	6	708838	708843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017062	T	7	7	708846	708852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017062	TTATAA	2	12	708855	708866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017062	TG	3	6	708870	708875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017062	TAC	2	6	708886	708891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_017062	TTTA	2	8	708921	708928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017062	ATC	2	6	708994	708999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_017062	GAT	2	6	709067	709072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017062	TAA	2	6	709082	709087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017062	AT	3	6	709139	709144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017062	AAT	2	6	709150	709155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017062	AAG	2	6	709210	709215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017062	TAC	2	6	709216	709221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_017062	TGC	2	6	709259	709264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_017062	ATA	2	6	709293	709298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017062	ATTC	2	8	709304	709311	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_017062	GAA	2	6	709317	709322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017062	T	6	6	709325	709330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017062	AACT	2	8	709354	709361	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5051	NC_017062	TAT	2	6	709386	709391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017062	TAA	2	6	709405	709410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017062	AAC	3	9	709442	709450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_017062	CAA	2	6	709507	709512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_017062	AAT	2	6	709513	709518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017062	TTA	2	6	709530	709535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017062	TA	3	6	709546	709551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017062	T	6	6	709558	709563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017062	GTAA	2	8	709564	709571	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017062	ATTA	2	8	709630	709637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017062	TAAT	2	8	709641	709648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017062	TATT	2	8	709691	709698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_017062	AAAT	2	8	709718	709725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017062	TCTTA	2	10	709729	709738	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5065	NC_017062	TGCA	2	8	709788	709795	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5066	NC_017062	TAT	2	6	709863	709868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017062	A	6	6	709989	709994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017062	ACTA	2	8	710042	710049	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5069	NC_017062	TAGT	2	8	710062	710069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017062	CAA	2	6	710074	710079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_017062	A	6	6	711481	711486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017062	TCA	2	6	711547	711552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_017062	ATT	2	6	711588	711593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017062	ATT	2	6	711603	711608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017062	AC	3	6	711629	711634	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5076	NC_017062	ACT	2	6	711648	711653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_017062	TATCCA	2	12	711658	711669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5079	NC_017062	TA	3	6	711765	711770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017062	TAA	2	6	711786	711791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017062	A	6	6	711801	711806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017062	A	7	7	711827	711833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017062	CTTT	2	8	711839	711846	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5084	NC_017062	TTGTT	2	10	715109	715118	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017062	AT	3	6	715173	715178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_017062	AAT	2	6	715216	715221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_017062	ATT	2	6	716221	716226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_017062	TAA	2	6	716239	716244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_017062	T	6	6	716258	716263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017062	ATA	2	6	716279	716284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_017062	ATA	2	6	716297	716302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_017062	AAT	2	6	716423	716428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_017062	T	6	6	718753	718758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017062	TTAC	2	8	718801	718808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5095	NC_017062	CATTA	2	10	718886	718895	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5096	NC_017062	AATT	2	8	718905	718912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_017062	AT	3	6	718929	718934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017062	TTC	2	6	718965	718970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_017062	TTTTA	2	10	719001	719010	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_017062	ATT	2	6	719018	719023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017062	TAAGA	2	10	719058	719067	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017062	ATA	2	6	719134	719139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017062	AAT	2	6	719143	719148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017062	TTTA	2	8	719170	719177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017062	TTA	2	6	719182	719187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_017062	AAT	2	6	719195	719200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_017062	TTTA	2	8	720939	720946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017062	ACTA	2	8	721044	721051	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5110	NC_017062	ATA	2	6	721419	721424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017062	ATA	3	9	721461	721469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017062	CTT	2	6	721470	721475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_017062	T	8	8	721482	721489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017062	CAT	2	6	721521	721526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_017062	ACAGC	2	10	721531	721540	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5116	NC_017062	ATA	2	6	721565	721570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_017062	CAA	2	6	721631	721636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_017062	ATAG	2	8	723090	723097	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017062	ATT	2	6	723105	723110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017062	GT	3	6	723114	723119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_017062	TTA	2	6	723122	723127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017062	AC	3	6	723133	723138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5123	NC_017062	ATT	2	6	723158	723163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_017062	A	6	6	723215	723220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017062	CA	4	8	723247	723254	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5126	NC_017062	AT	3	6	723269	723274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017062	ATTAA	2	10	723276	723285	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017062	AAAC	2	8	723363	723370	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5129	NC_017062	TGACA	2	10	723418	723427	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5130	NC_017062	GCA	2	6	723471	723476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_017062	AAT	2	6	723481	723486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_017062	TAC	2	6	723495	723500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_017062	ATA	2	6	723539	723544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_017062	AAT	2	6	723611	723616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_017062	AT	3	6	723619	723624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_017062	TAC	2	6	723628	723633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5138	NC_017062	TAA	2	6	723684	723689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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