MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 8029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017062	TAA	2	6	651109	651114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_017062	TAAT	2	8	651139	651146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_017062	TAA	2	6	651152	651157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_017062	A	6	6	651168	651173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_017062	TGT	2	6	651177	651182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_017062	GTT	2	6	651185	651190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_017062	CTT	2	6	651199	651204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_017062	ATA	2	6	651230	651235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_017062	ATA	2	6	651249	651254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_017062	GTA	2	6	651267	651272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_017062	GC	3	6	651275	651280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4512	NC_017062	ATA	2	6	651332	651337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_017062	CTA	2	6	651340	651345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_017062	ACA	2	6	651373	651378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_017062	AATT	2	8	651379	651386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_017062	ATT	2	6	651404	651409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_017062	ATAA	2	8	651418	651425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_017062	GAT	2	6	651453	651458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_017062	TTA	2	6	651462	651467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_017062	TTA	2	6	651489	651494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_017062	TTC	2	6	651522	651527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_017062	TTAAA	2	10	651557	651566	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_017062	AAT	4	12	651593	651604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_017062	AAATT	2	10	651610	651619	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_017062	ATG	2	6	651648	651653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_017062	TTC	2	6	651660	651665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_017062	ATT	2	6	651676	651681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_017062	CTT	2	6	651694	651699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_017062	TA	3	6	651737	651742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_017062	TAA	2	6	651766	651771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_017062	TAC	2	6	651823	651828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_017062	TAT	2	6	653013	653018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_017062	TAA	2	6	653024	653029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_017062	CA	3	6	653036	653041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4535	NC_017062	ATT	2	6	653042	653047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_017062	AAC	2	6	653051	653056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_017062	A	6	6	653077	653082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_017062	ATT	2	6	653090	653095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_017062	A	6	6	653111	653116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_017062	TTAATA	2	12	654525	654536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_017062	GTAA	2	8	654577	654584	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_017062	TA	3	6	654655	654660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_017062	TTA	2	6	654661	654666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_017062	TATG	2	8	654683	654690	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_017062	AAC	2	6	654703	654708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_017062	ATC	2	6	654732	654737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_017062	TAT	2	6	654749	654754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_017062	TGTATT	2	12	654755	654766	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_017062	AAAC	2	8	654775	654782	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4550	NC_017062	TTAT	2	8	656161	656168	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_017062	TTTATT	2	12	657947	657958	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_017062	TGT	2	6	659128	659133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_017062	ATT	2	6	659135	659140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_017062	AGT	2	6	659148	659153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_017062	TTGA	2	8	659154	659161	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_017062	AGCA	2	8	659163	659170	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4557	NC_017062	AAC	2	6	659179	659184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_017062	TAATAT	2	12	659194	659205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_017062	TTA	2	6	660530	660535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_017062	T	6	6	660536	660541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_017062	ATTAC	2	10	660618	660627	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4562	NC_017062	CT	3	6	661104	661109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4563	NC_017062	ATT	2	6	661140	661145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_017062	AAAT	2	8	661179	661186	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_017062	AT	3	6	661185	661190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_017062	TTATT	2	10	661201	661210	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_017062	ATA	2	6	661226	661231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_017062	TAT	2	6	661767	661772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_017062	ATT	2	6	661796	661801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_017062	TAA	2	6	661826	661831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_017062	AGA	2	6	661853	661858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_017062	GATAT	2	10	661863	661872	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_017062	A	6	6	661877	661882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_017062	T	6	6	661883	661888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_017062	ATCTAA	2	12	661949	661960	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4576	NC_017062	T	6	6	661963	661968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_017062	A	6	6	661997	662002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_017062	TA	3	6	662009	662014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_017062	AAT	3	9	662016	662024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_017062	CTA	2	6	662041	662046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_017062	TA	3	6	662140	662145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_017062	AAT	3	9	662153	662161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_017062	TA	3	6	663012	663017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_017062	AAG	2	6	663032	663037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_017062	TAA	2	6	663096	663101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_017062	TA	3	6	663137	663142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_017062	TTA	2	6	664969	664974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_017062	T	6	6	665611	665616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_017062	TAA	3	9	665681	665689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_017062	T	6	6	667011	667016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_017062	TAT	2	6	667020	667025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_017062	A	8	8	667038	667045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_017062	GTT	2	6	667054	667059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_017062	AAT	2	6	667085	667090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_017062	TTGAT	2	10	667112	667121	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_017062	TAA	2	6	667147	667152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_017062	AT	3	6	667162	667167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_017062	TTTAA	2	10	667177	667186	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_017062	C	6	6	667235	667240	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4600	NC_017062	T	6	6	667281	667286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_017062	ATA	2	6	667296	667301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_017062	TAA	2	6	667345	667350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_017062	AATA	2	8	667364	667371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_017062	ATTA	2	8	667385	667392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_017062	ATG	2	6	667415	667420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_017062	GTG	2	6	667473	667478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_017062	TA	3	6	667481	667486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_017062	AAT	2	6	667494	667499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_017062	AT	3	6	667507	667512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_017062	AT	4	8	667517	667524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_017062	AATT	2	8	667546	667553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_017062	ATT	2	6	667574	667579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_017062	ATT	2	6	667586	667591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_017062	TAT	2	6	667597	667602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_017062	TACT	2	8	667613	667620	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4616	NC_017062	A	7	7	667736	667742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_017062	GAATA	2	10	667773	667782	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_017062	ATA	2	6	667843	667848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_017062	TGTA	2	8	667872	667879	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_017062	AT	3	6	667890	667895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_017062	ATG	2	6	667957	667962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_017062	AT	3	6	667965	667970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_017062	T	7	7	668002	668008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_017062	ACC	2	6	668018	668023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_017062	ATAA	2	8	668037	668044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_017062	A	7	7	668043	668049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_017062	ATC	2	6	668076	668081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_017062	T	7	7	668082	668088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_017062	ATT	2	6	668121	668126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_017062	TAG	2	6	668165	668170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_017062	CTT	2	6	668204	668209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_017062	ATTTT	2	10	668227	668236	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_017062	GATTTT	2	12	668240	668251	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_017062	TAT	2	6	668252	668257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4635	NC_017062	TCT	2	6	668259	668264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4636	NC_017062	TTA	2	6	668268	668273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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