MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017060	CG	3	6	119	124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017060	TC	3	6	6192	6197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017060	TA	3	6	6618	6623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017060	GC	3	6	6929	6934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017060	TG	3	6	7185	7190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017060	TG	3	6	7247	7252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017060	AC	3	6	7335	7340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017060	TA	3	6	8402	8407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017060	GT	3	6	20819	20824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017060	AC	3	6	21202	21207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017060	TA	3	6	22263	22268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017060	AG	3	6	26129	26134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017060	TA	3	6	26182	26187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017060	TC	3	6	28575	28580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017060	CA	3	6	31341	31346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017060	CA	3	6	33967	33972	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017060	GT	3	6	35524	35529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017060	CG	3	6	38187	38192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017060	GC	3	6	38808	38813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017060	CA	3	6	45646	45651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017060	TA	3	6	47571	47576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017060	TA	3	6	48429	48434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017060	GA	3	6	58879	58884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017060	AC	3	6	66025	66030	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017060	GA	3	6	68694	68699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017060	AG	3	6	69442	69447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017060	TA	3	6	69857	69862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017060	AT	3	6	70144	70149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017060	TC	3	6	79070	79075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017060	GA	3	6	84606	84611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017060	GC	3	6	87531	87536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017060	AG	3	6	87969	87974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017060	CG	4	8	88028	88035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017060	TA	4	8	91222	91229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017060	TA	3	6	91647	91652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017060	GA	3	6	94791	94796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017060	TG	3	6	103862	103867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017060	AC	3	6	104091	104096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017060	TC	3	6	104154	104159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017060	CT	3	6	104364	104369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017060	TG	4	8	104635	104642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017060	TG	4	8	104914	104921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017060	AT	5	10	107446	107455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017060	TA	3	6	107621	107626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017060	GA	4	8	107823	107830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017060	AG	3	6	107854	107859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017060	TC	3	6	107959	107964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017060	CT	3	6	108788	108793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017060	GC	3	6	108958	108963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017060	TA	3	6	111059	111064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017060	TA	3	6	112846	112851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017060	TC	3	6	112867	112872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017060	TA	3	6	113035	113040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017060	AT	3	6	113378	113383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017060	CA	3	6	117047	117052	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017060	TG	3	6	117111	117116	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017060	TA	3	6	121063	121068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017060	GT	3	6	121086	121091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017060	AC	3	6	121209	121214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017060	GA	3	6	132849	132854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017060	CT	3	6	138582	138587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017060	GT	3	6	143540	143545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017060	GC	3	6	147812	147817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017060	CG	3	6	148276	148281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017060	GC	3	6	148810	148815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017060	GC	3	6	148891	148896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017060	GC	3	6	150042	150047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017060	CG	3	6	150356	150361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017060	GA	3	6	150615	150620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017060	TA	3	6	156563	156568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017060	CA	3	6	159558	159563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017060	CG	3	6	159775	159780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017060	AC	3	6	159903	159908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017060	CA	3	6	174792	174797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017060	GT	3	6	188173	188178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017060	TA	4	8	192440	192447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017060	GT	3	6	192581	192586	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017060	TG	3	6	199829	199834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017060	GC	3	6	200008	200013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017060	TC	3	6	200081	200086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017060	GC	3	6	200335	200340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017060	CT	3	6	204194	204199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017060	TC	3	6	214869	214874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017060	TC	3	6	216597	216602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017060	TC	3	6	216909	216914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017060	CA	3	6	225997	226002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017060	CA	3	6	226016	226021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017060	AT	3	6	226446	226451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017060	AT	3	6	227091	227096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017060	GC	3	6	235356	235361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017060	GT	3	6	262585	262590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017060	GT	3	6	262759	262764	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017060	TG	3	6	267405	267410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017060	AG	3	6	267412	267417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017060	CG	3	6	267439	267444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017060	AT	3	6	267535	267540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017060	TC	4	8	274211	274218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017060	AC	3	6	297141	297146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017060	GA	3	6	297175	297180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017060	GA	3	6	298983	298988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017060	TG	3	6	312668	312673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017060	CA	3	6	312682	312687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017060	GC	3	6	312903	312908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017060	CG	3	6	319633	319638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017060	TA	3	6	320520	320525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017060	CA	3	6	324491	324496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017060	TG	3	6	324547	324552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017060	AG	3	6	324752	324757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017060	AC	3	6	334528	334533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017060	AC	3	6	337179	337184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017060	GT	3	6	342722	342727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017060	GA	3	6	343412	343417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017060	CT	3	6	355048	355053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017060	TC	3	6	356602	356607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017060	CT	3	6	358571	358576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017060	GC	3	6	371438	371443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017060	GC	3	6	371576	371581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017060	TG	3	6	387929	387934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017060	TC	3	6	388040	388045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017060	CG	3	6	389570	389575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017060	CG	3	6	390137	390142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017060	TC	3	6	393689	393694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017060	AT	3	6	394839	394844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017060	AT	3	6	404335	404340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017060	AT	3	6	412338	412343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017060	AG	3	6	412367	412372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017060	AT	3	6	414806	414811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017060	TA	3	6	414816	414821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017060	TC	3	6	428185	428190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017060	AT	3	6	428476	428481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017060	AT	4	8	428818	428825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017060	TC	3	6	428873	428878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017060	TC	3	6	429904	429909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017060	AC	3	6	441620	441625	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017060	GC	3	6	451350	451355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017060	TA	3	6	451712	451717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017060	AT	3	6	451777	451782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017060	AT	3	6	452152	452157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017060	GA	3	6	452237	452242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017060	CA	3	6	461761	461766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017060	CT	3	6	462932	462937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017060	AT	3	6	465610	465615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017060	AG	3	6	471551	471556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017060	AC	3	6	471575	471580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017060	GC	3	6	471613	471618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017060	TA	3	6	475164	475169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017060	TG	3	6	475251	475256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017060	AT	3	6	482021	482026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017060	TG	3	6	482197	482202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017060	TA	3	6	493221	493226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017060	TG	3	6	495331	495336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017060	TG	3	6	496212	496217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017060	TA	4	8	498921	498928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017060	TG	3	6	499117	499122	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017060	TC	3	6	501458	501463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_017060	GA	3	6	524700	524705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017060	AC	3	6	531176	531181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
158	NC_017060	GA	3	6	531275	531280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017060	AC	3	6	534797	534802	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_017060	CG	3	6	536517	536522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_017060	AC	3	6	536782	536787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_017060	AG	3	6	536820	536825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017060	TA	3	6	537119	537124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017060	AT	3	6	537238	537243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017060	TA	3	6	540125	540130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017060	GC	3	6	545216	545221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
167	NC_017060	AT	3	6	545383	545388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017060	TA	3	6	553096	553101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017060	GC	3	6	553610	553615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
170	NC_017060	GA	3	6	559762	559767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017060	TG	3	6	561714	561719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017060	AT	3	6	570862	570867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.