MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 9023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017058	CTA	2	6	65142	65147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017058	AAT	2	6	65183	65188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017058	GCT	2	6	65255	65260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_017058	GAAA	2	8	65280	65287	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017058	CAAA	2	8	65296	65303	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
506	NC_017058	AGA	2	6	65316	65321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017058	ATG	2	6	65337	65342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017058	GAA	2	6	65351	65356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017058	AGC	2	6	66116	66121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017058	GAA	2	6	66142	66147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017058	AGA	2	6	66154	66159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017058	CAA	2	6	66163	66168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017058	AAG	2	6	66173	66178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017058	AAATGA	2	12	66179	66190	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017058	CAA	2	6	66201	66206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017058	CAA	2	6	66223	66228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_017058	GAA	2	6	66231	66236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017058	AAT	2	6	66237	66242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017058	AGA	2	6	66251	66256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017058	CAAT	2	8	66354	66361	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
521	NC_017058	GTT	2	6	66371	66376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017058	AAG	2	6	66411	66416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017058	TAA	2	6	66486	66491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017058	ATA	2	6	66492	66497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017058	ATG	2	6	66531	66536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017058	TAT	2	6	66576	66581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017058	CAA	2	6	66618	66623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017058	AGT	2	6	66626	66631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017058	GTTA	2	8	66663	66670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017058	AGC	2	6	66688	66693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017058	TAA	2	6	66706	66711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017058	GCA	2	6	66743	66748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017058	TGA	2	6	66751	66756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017058	A	6	6	66776	66781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017058	TA	3	6	66825	66830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017058	CGG	2	6	66862	66867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017058	TTG	2	6	66906	66911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017058	AGA	2	6	66979	66984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017058	ATT	2	6	66992	66997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017058	CAA	3	9	67010	67018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_017058	TAT	2	6	67035	67040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017058	CAA	2	6	67075	67080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_017058	ATA	2	6	67227	67232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017058	AAT	2	6	67274	67279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017058	AT	5	10	67278	67287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017058	TAACT	2	10	67303	67312	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
547	NC_017058	CTA	2	6	67344	67349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017058	ATTT	2	8	67438	67445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017058	TTAC	2	8	67516	67523	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
550	NC_017058	TTAAAG	2	12	67600	67611	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017058	TTG	2	6	67657	67662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017058	TAA	2	6	67733	67738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017058	CAA	2	6	67804	67809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_017058	TGG	2	6	67810	67815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017058	A	6	6	67834	67839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017058	T	6	6	67844	67849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017058	TTTAT	2	10	67855	67864	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017058	CAA	2	6	67951	67956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_017058	TTG	2	6	67958	67963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017058	A	6	6	67993	67998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017058	GATA	2	8	68018	68025	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017058	TGC	2	6	68074	68079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017058	TTA	2	6	68173	68178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017058	GCT	2	6	68231	68236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_017058	AGG	2	6	68259	68264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017058	ATT	2	6	68296	68301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017058	ATTT	2	8	68325	68332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017058	AATA	2	8	68354	68361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017058	ATA	2	6	68667	68672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017058	AT	3	6	68692	68697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017058	CTA	2	6	68819	68824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017058	TTC	2	6	68825	68830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_017058	AAAT	2	8	70176	70183	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017058	A	6	6	70361	70366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017058	T	6	6	70403	70408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017058	CATT	2	8	70434	70441	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
577	NC_017058	A	6	6	70453	70458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017058	TTATCA	2	12	70505	70516	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
579	NC_017058	AAG	2	6	70574	70579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017058	CAG	2	6	70580	70585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_017058	A	8	8	70629	70636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017058	ATC	2	6	70669	70674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_017058	TTA	2	6	70754	70759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017058	AGT	2	6	70818	70823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017058	ATC	2	6	70833	70838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_017058	CT	3	6	70855	70860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
587	NC_017058	TAG	2	6	70865	70870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017058	AT	3	6	70907	70912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017058	ATGC	2	8	70916	70923	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
590	NC_017058	ATAA	2	8	70932	70939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017058	TAT	2	6	71000	71005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017058	A	6	6	71019	71024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017058	ATT	2	6	71076	71081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017058	T	6	6	71080	71085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017058	A	6	6	71112	71117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017058	TTA	2	6	71169	71174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017058	ATT	2	6	71175	71180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017058	AGTA	2	8	71192	71199	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017058	CTA	2	6	71203	71208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_017058	TTA	2	6	71263	71268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017058	CAG	2	6	71311	71316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017058	TAA	2	6	71381	71386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017058	GCC	2	6	71387	71392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_017058	AGC	2	6	71405	71410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017058	AATA	2	8	71411	71418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017058	TTC	2	6	71453	71458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017058	GTT	2	6	71495	71500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017058	CTA	2	6	71530	71535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_017058	T	7	7	71539	71545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017058	CAT	2	6	71577	71582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017058	TTC	2	6	71632	71637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_017058	TAT	2	6	71640	71645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017058	ATTA	2	8	71653	71660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017058	ATT	2	6	71663	71668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017058	ACT	2	6	71671	71676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_017058	AAC	2	6	71685	71690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_017058	ATT	2	6	71722	71727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017058	TTG	2	6	71734	71739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017058	TCA	2	6	71747	71752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017058	AGTAC	2	10	71804	71813	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
621	NC_017058	TAA	2	6	71854	71859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017058	GAT	2	6	71881	71886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017058	TA	3	6	71888	71893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017058	GCT	2	6	71896	71901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017058	TAT	2	6	71951	71956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017058	TAAG	2	8	71976	71983	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017058	ATA	3	9	71994	72002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017058	TTAA	2	8	72028	72035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017058	CTT	2	6	72053	72058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_017058	CT	3	6	72081	72086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
631	NC_017058	CTA	2	6	72107	72112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_017058	TTAG	2	8	72136	72143	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017058	TTTCT	2	10	73107	73116	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
634	NC_017058	T	6	6	73144	73149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017058	AAC	2	6	73158	73163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_017058	TTG	2	6	73167	73172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017058	TAC	2	6	73188	73193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_017058	TGCT	2	8	73195	73202	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
639	NC_017058	T	7	7	73228	73234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017058	ACG	2	6	73461	73466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_017058	CT	3	6	73820	73825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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