MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 9023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_017058	AGC	2	6	1199150	1199155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_017058	ATT	2	6	1199367	1199372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_017058	TAT	2	6	1199373	1199378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_017058	AAAG	2	8	1199421	1199428	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_017058	T	6	6	1199493	1199498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_017058	AAC	2	6	1199547	1199552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8507	NC_017058	CT	3	6	1199907	1199912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8508	NC_017058	T	6	6	1199989	1199994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_017058	CTC	2	6	1200000	1200005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8510	NC_017058	TCG	2	6	1200022	1200027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_017058	TAA	2	6	1200121	1200126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_017058	TAT	2	6	1200155	1200160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_017058	T	6	6	1200192	1200197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_017058	TAT	2	6	1200356	1200361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_017058	GAG	2	6	1200401	1200406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_017058	T	6	6	1200459	1200464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_017058	GCT	2	6	1200475	1200480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8518	NC_017058	TAA	2	6	1200486	1200491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_017058	ATT	2	6	1200501	1200506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_017058	ATTA	2	8	1200725	1200732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_017058	GTG	2	6	1200755	1200760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_017058	ACC	2	6	1200786	1200791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8523	NC_017058	CAT	2	6	1200793	1200798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8524	NC_017058	TA	3	6	1200811	1200816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_017058	GCA	2	6	1200827	1200832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8526	NC_017058	T	6	6	1200843	1200848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_017058	ATT	2	6	1200849	1200854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_017058	GCT	2	6	1200879	1200884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8529	NC_017058	ATG	2	6	1200889	1200894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_017058	TATAG	2	10	1200919	1200928	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_017058	TAA	2	6	1200986	1200991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_017058	CAA	2	6	1200994	1200999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8533	NC_017058	GAATT	2	10	1201003	1201012	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_017058	ATT	3	9	1201014	1201022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_017058	TAAT	2	8	1201023	1201030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_017058	ATT	2	6	1201036	1201041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_017058	TTG	2	6	1202601	1202606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_017058	GTT	2	6	1202657	1202662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_017058	T	6	6	1202661	1202666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_017058	GTT	3	9	1202697	1202705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_017058	ATA	2	6	1202752	1202757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_017058	A	7	7	1202767	1202773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_017058	ATT	2	6	1204676	1204681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_017058	ACA	2	6	1204684	1204689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8545	NC_017058	A	7	7	1204737	1204743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_017058	TAA	2	6	1204744	1204749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_017058	A	6	6	1204748	1204753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_017058	T	6	6	1204769	1204774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_017058	GCT	2	6	1204826	1204831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8550	NC_017058	TAAAT	2	10	1204851	1204860	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_017058	TTTA	2	8	1205980	1205987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_017058	ATT	2	6	1206026	1206031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_017058	CTT	2	6	1206035	1206040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8554	NC_017058	GCA	2	6	1206085	1206090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8555	NC_017058	TA	3	6	1206099	1206104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_017058	AGG	2	6	1206155	1206160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_017058	ATA	2	6	1206182	1206187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_017058	A	7	7	1206335	1206341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_017058	TTA	2	6	1206567	1206572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_017058	AAC	2	6	1207400	1207405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8561	NC_017058	TAA	2	6	1207416	1207421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_017058	AGT	2	6	1207511	1207516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_017058	A	6	6	1209210	1209215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_017058	TTG	2	6	1209248	1209253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_017058	ATT	2	6	1209266	1209271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_017058	GAT	2	6	1209300	1209305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_017058	A	6	6	1209322	1209327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_017058	TAA	2	6	1210826	1210831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_017058	TGA	2	6	1210866	1210871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_017058	TCGC	2	8	1210915	1210922	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8571	NC_017058	ATA	2	6	1210947	1210952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_017058	AAT	2	6	1210958	1210963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8573	NC_017058	T	6	6	1213782	1213787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_017058	AAAT	2	8	1213795	1213802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_017058	A	6	6	1215118	1215123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8576	NC_017058	TA	3	6	1215128	1215133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8577	NC_017058	TAAG	2	8	1215896	1215903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8578	NC_017058	TCA	2	6	1217166	1217171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8579	NC_017058	TTA	2	6	1217216	1217221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8580	NC_017058	TAC	2	6	1217244	1217249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8581	NC_017058	GTG	2	6	1217266	1217271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8582	NC_017058	ATGCA	2	10	1217278	1217287	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8583	NC_017058	AACA	2	8	1217313	1217320	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8584	NC_017058	TTC	2	6	1217366	1217371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8585	NC_017058	TTTAA	2	10	1217376	1217385	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8586	NC_017058	A	6	6	1217597	1217602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8587	NC_017058	TAC	2	6	1217619	1217624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8588	NC_017058	AAC	2	6	1217647	1217652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8589	NC_017058	TC	3	6	1218008	1218013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8590	NC_017058	T	6	6	1218090	1218095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8591	NC_017058	CTC	2	6	1218101	1218106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8592	NC_017058	TCT	2	6	1218148	1218153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8593	NC_017058	TAAA	2	8	1218913	1218920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8594	NC_017058	A	7	7	1218956	1218962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8595	NC_017058	GCT	2	6	1219217	1219222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8596	NC_017058	TTTA	2	8	1219227	1219234	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_017058	AT	4	8	1219277	1219284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_017058	AT	3	6	1219296	1219301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8599	NC_017058	TA	4	8	1219532	1219539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8600	NC_017058	TTG	2	6	1219557	1219562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_017058	AAT	2	6	1219643	1219648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_017058	A	6	6	1221142	1221147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8603	NC_017058	CTT	2	6	1221155	1221160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8604	NC_017058	TGC	2	6	1221193	1221198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8605	NC_017058	A	6	6	1221201	1221206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8606	NC_017058	T	8	8	1221229	1221236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8607	NC_017058	AT	3	6	1221251	1221256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8608	NC_017058	AAT	2	6	1221319	1221324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8609	NC_017058	TTG	2	6	1221352	1221357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8610	NC_017058	AT	3	6	1221382	1221387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_017058	TTG	2	6	1221408	1221413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_017058	CAA	2	6	1221451	1221456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8613	NC_017058	ATA	2	6	1221469	1221474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8614	NC_017058	TAA	3	9	1221496	1221504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_017058	AAAAT	2	10	1221540	1221549	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8616	NC_017058	A	8	8	1221613	1221620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_017058	A	6	6	1221655	1221660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8618	NC_017058	ATC	2	6	1221698	1221703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8619	NC_017058	ATG	2	6	1221738	1221743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8620	NC_017058	CAT	2	6	1221761	1221766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8621	NC_017058	CTTTT	2	10	1221775	1221784	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8622	NC_017058	TTA	2	6	1221826	1221831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8623	NC_017058	AT	4	8	1221837	1221844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_017058	AGA	2	6	1221870	1221875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_017058	AT	3	6	1221888	1221893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8626	NC_017058	AAT	2	6	1221930	1221935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8627	NC_017058	AAC	2	6	1221965	1221970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8628	NC_017058	CT	3	6	1222325	1222330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8629	NC_017058	T	6	6	1222407	1222412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8630	NC_017058	CTC	2	6	1222418	1222423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8631	NC_017058	ATA	2	6	1222542	1222547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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