MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. RpGvF24 chromosome

Total Repeats: 1057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017057	TATT	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017057	ATTT	2	8	1300	1307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017057	GGCT	2	8	6127	6134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017057	TTTA	2	8	6200	6207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017057	TAAA	2	8	6219	6226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017057	ATTT	2	8	8916	8923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017057	TTTA	2	8	8964	8971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017057	TATT	2	8	9212	9219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017057	TAAT	2	8	9258	9265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017057	TAAG	2	8	14761	14768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017057	ATTA	2	8	14782	14789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017057	AAAG	2	8	14851	14858	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017057	TTAT	2	8	15023	15030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017057	TAAG	2	8	15217	15224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017057	AATA	2	8	15646	15653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017057	GTAA	2	8	15794	15801	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017057	AGCA	2	8	16074	16081	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017057	AATT	2	8	16687	16694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017057	AAAG	2	8	17157	17164	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017057	ATTC	2	8	17250	17257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017057	TTCA	2	8	18304	18311	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017057	TAAA	2	8	18944	18951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017057	TATT	2	8	19388	19395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017057	GTAA	2	8	19562	19569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017057	TTAT	2	8	19640	19647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017057	TCAA	2	8	19672	19679	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017057	GTAA	2	8	19841	19848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017057	ATAG	2	8	20076	20083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017057	ATTA	2	8	20180	20187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017057	ATCA	2	8	20742	20749	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017057	AACA	2	8	21103	21110	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017057	GTAT	2	8	21142	21149	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017057	TAAT	2	8	22415	22422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017057	TCTT	2	8	25030	25037	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017057	TAAA	2	8	26850	26857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017057	ATTT	3	12	28764	28775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017057	TACA	2	8	28906	28913	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017057	ATAA	2	8	29081	29088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017057	AATA	2	8	29711	29718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017057	TTTG	2	8	31032	31039	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017057	ATTA	2	8	31242	31249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017057	ATAG	2	8	31381	31388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017057	TTTG	2	8	31471	31478	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017057	ATTT	2	8	31797	31804	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017057	TTCT	2	8	31839	31846	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017057	AAAT	2	8	32600	32607	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017057	TATT	2	8	32701	32708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017057	TCGT	2	8	36082	36089	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017057	AATC	2	8	36393	36400	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017057	TGAT	2	8	36465	36472	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017057	TCAA	2	8	37981	37988	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017057	ATGT	2	8	38041	38048	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017057	TTAA	2	8	38307	38314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017057	TTAT	2	8	38373	38380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017057	AATA	2	8	41061	41068	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017057	AAAT	2	8	41127	41134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017057	TAAG	2	8	44386	44393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017057	GTTT	2	8	44778	44785	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017057	TAAT	2	8	49485	49492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017057	TAAT	2	8	52800	52807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017057	TAAT	2	8	54281	54288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017057	GTTG	2	8	57757	57764	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017057	TTCT	2	8	58046	58053	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017057	ATTA	2	8	58458	58465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017057	TAGT	2	8	59129	59136	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017057	TTCT	2	8	59219	59226	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017057	TTTG	2	8	59239	59246	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017057	AAAT	2	8	59283	59290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017057	TAAT	2	8	70106	70113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017057	AAAT	2	8	70638	70645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017057	TCTA	2	8	70915	70922	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017057	TCAA	2	8	75596	75603	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017057	TAAA	2	8	78001	78008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017057	AAAT	2	8	78009	78016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017057	TTAA	2	8	79609	79616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017057	ATTA	2	8	79791	79798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017057	ATTT	2	8	84819	84826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017057	GAAC	2	8	88033	88040	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017057	TTTC	2	8	88060	88067	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017057	ATAA	2	8	89041	89048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017057	TGTT	2	8	89249	89256	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017057	TGAT	2	8	89402	89409	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017057	TTGT	2	8	89861	89868	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017057	ATCT	2	8	90125	90132	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017057	CTTG	2	8	90630	90637	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017057	TATT	2	8	90687	90694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017057	ATAA	2	8	90976	90983	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017057	TCAT	2	8	90996	91003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017057	TTTA	2	8	91491	91498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017057	TTTA	2	8	91638	91645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017057	AAGA	2	8	91773	91780	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017057	TTTA	2	8	92283	92290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017057	TTTG	2	8	92475	92482	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017057	ATTA	2	8	92494	92501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017057	ATTT	2	8	92670	92677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017057	TTAT	2	8	93024	93031	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017057	CTTT	2	8	93034	93041	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017057	AAAT	2	8	93100	93107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017057	CTTA	2	8	93201	93208	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017057	ATTA	2	8	93535	93542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017057	GTTT	2	8	93654	93661	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017057	TTAA	2	8	93813	93820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017057	CTTG	2	8	94469	94476	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017057	TACT	2	8	94639	94646	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017057	CAAA	2	8	94836	94843	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017057	CTTT	2	8	96314	96321	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017057	GTAA	2	8	96486	96493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017057	ATGT	2	8	96509	96516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017057	TAAA	2	8	97697	97704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017057	CTAA	2	8	99161	99168	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017057	TTAT	2	8	99393	99400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017057	ATTA	2	8	99453	99460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017057	AAGT	2	8	106067	106074	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017057	ATAA	2	8	106166	106173	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017057	ATCA	2	8	106308	106315	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017057	ATCA	2	8	106340	106347	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017057	TAAC	2	8	109802	109809	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017057	AGTA	2	8	109898	109905	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017057	ATTT	2	8	111387	111394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017057	CATA	2	8	112384	112391	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017057	TAAA	2	8	113360	113367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017057	TATT	2	8	116571	116578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017057	GTAA	2	8	116669	116676	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017057	GTCA	2	8	125116	125123	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017057	GTAA	2	8	125154	125161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017057	CTTA	2	8	131538	131545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017057	TACT	2	8	131575	131582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017057	TTAC	2	8	131836	131843	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017057	TAAC	2	8	131882	131889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017057	ACAA	2	8	134189	134196	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017057	ATAA	2	8	134237	134244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017057	TAGA	2	8	135815	135822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017057	TTTA	2	8	141786	141793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017057	AATA	2	8	142437	142444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017057	ATTA	2	8	142539	142546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017057	ACTT	2	8	142627	142634	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017057	ACTT	2	8	148652	148659	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017057	TTTA	2	8	152473	152480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017057	TAAG	2	8	153365	153372	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017057	ATTT	2	8	153782	153789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017057	TAAT	2	8	156433	156440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017057	AATA	2	8	156456	156463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017057	TAAA	2	8	157586	157593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017057	TAAT	2	8	159581	159588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017057	CTTT	2	8	160163	160170	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017057	TATT	2	8	160570	160577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017057	TATC	2	8	160608	160615	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017057	TTAT	2	8	160800	160807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017057	AATG	2	8	165064	165071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017057	ATTA	2	8	169367	169374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017057	TAAA	2	8	169613	169620	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017057	ATAA	2	8	169671	169678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017057	AGAA	2	8	169758	169765	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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