MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. RpGvF24 chromosome

Total Repeats: 8269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017057	GAC	2	6	212862	212867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_017057	TGA	2	6	212940	212945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017057	ATTT	2	8	214201	214208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017057	TTG	2	6	217036	217041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017057	T	7	7	217055	217061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017057	CAA	2	6	217115	217120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_017057	CTA	2	6	218647	218652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_017057	TAC	2	6	218674	218679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_017057	TAA	2	6	221199	221204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017057	TTC	2	6	221270	221275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_017057	GATT	2	8	221374	221381	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017057	ATA	2	6	221382	221387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017057	CTT	2	6	221459	221464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_017057	ATT	2	6	221512	221517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017057	TAT	2	6	221553	221558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017057	AT	4	8	221589	221596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017057	ATA	3	9	221610	221618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017057	GGA	2	6	221622	221627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017057	GTT	2	6	222795	222800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017057	ACG	2	6	222805	222810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_017057	A	6	6	222844	222849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017057	AAC	2	6	222882	222887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_017057	ACA	2	6	222894	222899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_017057	TGT	2	6	224992	224997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017057	CAA	2	6	225015	225020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_017057	ATT	2	6	225029	225034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017057	TGC	2	6	225061	225066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_017057	A	6	6	225095	225100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017057	TATT	2	8	225123	225130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017057	AAT	2	6	225149	225154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017057	TCT	2	6	225167	225172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_017057	A	6	6	225203	225208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017057	ATG	2	6	225249	225254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017057	AGT	2	6	225260	225265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017057	TTA	2	6	225282	225287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017057	TA	3	6	225305	225310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017057	TGT	2	6	225325	225330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017057	TGG	2	6	225331	225336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017057	AG	3	6	225439	225444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017057	TTTC	2	8	225546	225553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_017057	TTAT	2	8	225562	225569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017057	TTA	2	6	225615	225620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017057	TAC	2	6	225628	225633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_017057	TGG	2	6	225634	225639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017057	TAT	2	6	225687	225692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017057	TGG	2	6	225694	225699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017057	A	6	6	225759	225764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017057	TAA	2	6	225765	225770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017057	AAT	2	6	225795	225800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017057	TAAA	2	8	225818	225825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017057	CAT	2	6	225835	225840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_017057	AT	3	6	225867	225872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017057	AAAT	2	8	225873	225880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017057	TAG	2	6	225888	225893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017057	ATT	2	6	225964	225969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017057	GGC	2	6	225994	225999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_017057	ATT	2	6	226008	226013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017057	A	6	6	226074	226079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017057	ATG	2	6	226103	226108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017057	AAT	2	6	226114	226119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017057	GAT	2	6	226131	226136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017057	TGG	2	6	226143	226148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017057	T	6	6	226156	226161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017057	GAT	2	6	226168	226173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017057	TAA	2	6	226182	226187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017057	AGCGT	2	10	226213	226222	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1567	NC_017057	GTA	2	6	226235	226240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017057	T	6	6	226261	226266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017057	TGAAA	2	10	226305	226314	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017057	TGA	2	6	226335	226340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017057	TTA	2	6	226361	226366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017057	TTA	2	6	226410	226415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017057	ATGAT	2	10	226454	226463	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017057	TTAT	2	8	226500	226507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017057	AAT	2	6	226563	226568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017057	ATA	2	6	226577	226582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017057	A	6	6	226589	226594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017057	CAT	2	6	226629	226634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1580	NC_017057	ATT	2	6	226672	226677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017057	AATCTT	2	12	226681	226692	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1582	NC_017057	ATTT	2	8	226743	226750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017057	TGA	2	6	226773	226778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017057	TGA	2	6	226788	226793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017057	TAT	2	6	226832	226837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017057	TTA	2	6	226850	226855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_017057	ATGTG	2	10	226857	226866	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017057	AAT	2	6	226921	226926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017057	TAA	2	6	226930	226935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017057	TTA	2	6	226954	226959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017057	TGA	2	6	227005	227010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017057	TAT	2	6	227023	227028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_017057	AT	3	6	227064	227069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017057	GTA	2	6	227072	227077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1596	NC_017057	ATA	2	6	227128	227133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017057	A	7	7	227155	227161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_017057	TAAT	2	8	227190	227197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_017057	ATG	2	6	227202	227207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1602	NC_017057	T	6	6	227245	227250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017057	ATA	2	6	227253	227258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017057	ATT	2	6	227287	227292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017057	T	6	6	227316	227321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017057	TAA	2	6	227357	227362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1608	NC_017057	TTTC	2	8	227413	227420	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_017057	TTA	2	6	227440	227445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017057	A	6	6	227450	227455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017057	AG	3	6	228931	228936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017057	AGTA	2	8	228960	228967	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017057	ATT	2	6	229657	229662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017057	T	7	7	229685	229691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_017057	GATT	2	8	229694	229701	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017057	ATT	2	6	229703	229708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017057	GCT	2	6	229747	229752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_017057	ACA	2	6	229758	229763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_017057	TAA	2	6	229797	229802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017057	CAA	2	6	229845	229850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_017057	ATT	2	6	229865	229870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017057	ATA	2	6	229893	229898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017057	TAA	3	9	229927	229935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017057	TGC	2	6	229967	229972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_017057	TCA	2	6	229986	229991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_017057	ATA	2	6	229992	229997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017057	ATTA	2	8	230132	230139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017057	ATAAA	2	10	230147	230156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017057	ATTT	2	8	230194	230201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017057	CTT	2	6	230250	230255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_017057	ATTA	2	8	231058	231065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017057	TA	3	6	231093	231098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017057	ATT	2	6	231111	231116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017057	T	6	6	231115	231120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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