MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. RpGvF24 chromosome

Total Repeats: 8269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017057	AT	4	8	54212	54219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017057	ATT	2	6	54222	54227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017057	TAAT	2	8	54281	54288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017057	AT	4	8	56545	56552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017057	AT	3	6	56556	56561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017057	TAT	2	6	56574	56579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017057	GCT	2	6	56602	56607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017057	ATA	2	6	56609	56614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017057	AAG	2	6	56629	56634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017057	AGC	2	6	56646	56651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017057	CTA	2	6	56687	56692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017057	TAA	2	6	56720	56725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017057	TAAAT	2	10	56736	56745	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017057	AGA	2	6	56761	56766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017057	CACTTG	2	12	56799	56810	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017057	AGA	2	6	56845	56850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017057	ATA	2	6	56877	56882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017057	GAAAAA	2	12	56963	56974	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017057	ATA	2	6	57011	57016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017057	T	6	6	57049	57054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017057	GTA	2	6	57071	57076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017057	TGC	2	6	57119	57124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017057	TAC	2	6	57628	57633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017057	TA	3	6	57635	57640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017057	GTTG	2	8	57757	57764	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017057	A	6	6	57775	57780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017057	ATT	2	6	57891	57896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017057	TTA	2	6	57961	57966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017057	T	6	6	58008	58013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017057	TTCT	2	8	58046	58053	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
531	NC_017057	TA	3	6	58119	58124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017057	TA	3	6	58178	58183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017057	ATA	2	6	58209	58214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017057	CTA	2	6	58234	58239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017057	ATT	2	6	58246	58251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017057	GAT	2	6	58252	58257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017057	ATT	2	6	58276	58281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017057	TAA	2	6	58333	58338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017057	TAG	2	6	58361	58366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017057	CAT	2	6	58437	58442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_017057	A	6	6	58448	58453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017057	ATTA	2	8	58458	58465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017057	TCA	2	6	58482	58487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_017057	AAT	2	6	58521	58526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017057	ATC	2	6	58580	58585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017057	AAT	2	6	58589	58594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017057	AT	3	6	58604	58609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017057	TAT	2	6	58622	58627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017057	AAT	2	6	58981	58986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017057	TAGT	2	8	59129	59136	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017057	AT	3	6	59146	59151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017057	TAA	2	6	59200	59205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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554	NC_017057	A	6	6	59229	59234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017057	TTTG	2	8	59239	59246	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017057	AT	3	6	59256	59261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017057	AAAT	2	8	59283	59290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017057	A	7	7	60808	60814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017057	A	6	6	60818	60823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017057	GAG	2	6	60857	60862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017057	TAA	2	6	62294	62299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017057	TAT	2	6	62302	62307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017057	AT	3	6	62306	62311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017057	AT	3	6	66792	66797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017057	A	6	6	66832	66837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017057	AAT	2	6	66895	66900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017057	TA	3	6	66906	66911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017057	TAG	2	6	66914	66919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017057	ATA	2	6	66938	66943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017057	AAT	2	6	68954	68959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017057	ATT	2	6	69803	69808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017057	ATT	3	9	69837	69845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017057	TAA	2	6	69854	69859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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580	NC_017057	TA	3	6	69970	69975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017057	ATT	2	6	69998	70003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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611	NC_017057	TAC	2	6	71052	71057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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620	NC_017057	AT	3	6	71710	71715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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626	NC_017057	TA	3	6	75630	75635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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635	NC_017057	TAT	2	6	78124	78129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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641	NC_017057	ATA	2	6	79571	79576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_017057	TTAA	2	8	79609	79616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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