MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. RpGvF24 chromosome

Total Repeats: 8269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017057	TAC	2	6	640578	640583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_017057	TCT	2	6	640594	640599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_017057	AAAT	2	8	640600	640607	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_017057	TTA	2	6	640610	640615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_017057	TAA	2	6	640629	640634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_017057	TAAT	2	8	641093	641100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_017057	AATT	2	8	641132	641139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_017057	AAT	2	6	641149	641154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_017057	TTA	2	6	641163	641168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_017057	AATT	2	8	641171	641178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_017057	ATT	2	6	641196	641201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_017057	T	6	6	641249	641254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_017057	T	6	6	641266	641271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_017057	TTC	2	6	641281	641286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_017057	TAA	2	6	641323	641328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_017057	AT	4	8	641412	641419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_017057	GTAT	2	8	641424	641431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_017057	ATTT	2	8	641536	641543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_017057	A	6	6	641547	641552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_017057	TATT	2	8	641646	641653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_017057	ATT	2	6	641692	641697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_017057	ATA	2	6	641731	641736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_017057	GAA	2	6	641849	641854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_017057	ATG	2	6	641890	641895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_017057	AAT	2	6	641908	641913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_017057	TA	3	6	641946	641951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_017057	A	6	6	641968	641973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_017057	TAA	2	6	641975	641980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_017057	ACT	2	6	641984	641989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_017057	GAA	2	6	642009	642014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_017057	AAT	2	6	642029	642034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_017057	AT	3	6	642057	642062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_017057	CTT	2	6	642090	642095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_017057	TGCA	2	8	642104	642111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4535	NC_017057	TAT	2	6	642127	642132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_017057	ACTA	2	8	642172	642179	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4537	NC_017057	AGA	2	6	642228	642233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_017057	TAA	2	6	642270	642275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_017057	ATT	2	6	642285	642290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_017057	GAAATA	2	12	642331	642342	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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4542	NC_017057	ATA	2	6	642425	642430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_017057	TAT	2	6	642440	642445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_017057	AGTA	2	8	642456	642463	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_017057	T	7	7	642475	642481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_017057	A	6	6	642537	642542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_017057	A	6	6	642600	642605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_017057	TAA	2	6	642627	642632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_017057	ATTA	2	8	643288	643295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_017057	CCAT	2	8	643307	643314	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4551	NC_017057	TTA	2	6	643349	643354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_017057	ATA	2	6	643382	643387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_017057	TAGAA	2	10	643397	643406	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_017057	ATT	2	6	645125	645130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_017057	TAA	2	6	645160	645165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_017057	T	6	6	645169	645174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_017057	TAA	2	6	645181	645186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4559	NC_017057	AATAA	2	10	645352	645361	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_017057	ATA	2	6	646063	646068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_017057	ATT	2	6	646069	646074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_017057	TAT	2	6	646098	646103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_017057	ATTA	2	8	646114	646121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_017057	ATG	2	6	646166	646171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_017057	AAC	2	6	646219	646224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_017057	A	6	6	646267	646272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_017057	ATA	2	6	646319	646324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_017057	T	6	6	646327	646332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_017057	T	6	6	646346	646351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_017057	ATT	2	6	646408	646413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_017057	CACC	2	8	646548	646555	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4572	NC_017057	T	6	6	646584	646589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_017057	ATT	2	6	646645	646650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_017057	TATAA	2	10	646657	646666	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_017057	A	7	7	646718	646724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4592	NC_017057	TTA	2	6	647160	647165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4601	NC_017057	TAC	2	6	647512	647517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4603	NC_017057	CA	3	6	648728	648733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4604	NC_017057	AAC	2	6	648743	648748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_017057	GTA	2	6	648759	648764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_017057	A	6	6	648769	648774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_017057	TTA	3	9	650217	650225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_017057	GTAA	2	8	650268	650275	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_017057	TATT	2	8	650320	650327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_017057	TTG	2	6	650329	650334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_017057	TATG	2	8	650378	650385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_017057	AAC	2	6	650398	650403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_017057	ATGT	2	8	650414	650421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_017057	AAC	2	6	650433	650438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_017057	ATC	2	6	650462	650467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_017057	TAT	3	9	650480	650488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4618	NC_017057	TAA	2	6	650523	650528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_017057	AACA	2	8	650541	650548	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4620	NC_017057	TTAT	2	8	651899	651906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_017057	T	6	6	653682	653687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_017057	A	6	6	653708	653713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_017057	AAT	2	6	653724	653729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_017057	ACAT	2	8	653770	653777	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4625	NC_017057	ATT	3	9	654867	654875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_017057	AGT	2	6	654880	654885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_017057	GT	3	6	654884	654889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_017057	ATG	2	6	654956	654961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_017057	TTA	2	6	656272	656277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_017057	T	8	8	656278	656285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_017057	AC	3	6	656355	656360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4632	NC_017057	ATTAT	2	10	656364	656373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_017057	CTA	2	6	656837	656842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4635	NC_017057	ATT	2	6	656886	656891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4636	NC_017057	TAAA	2	8	656924	656931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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