MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. BuV67-CWPP chromosome

Total Repeats: 4374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017056	ATT	2	6	834	839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017056	GTT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017056	ACA	2	6	927	932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017056	ACA	2	6	963	968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017056	TAG	2	6	5885	5890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017056	ATT	2	6	5896	5901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017056	TCT	2	6	5902	5907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017056	GTT	2	6	5909	5914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017056	TAA	2	6	5927	5932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017056	CAT	2	6	6022	6027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017056	TAA	2	6	6037	6042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017056	ATA	2	6	6120	6125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017056	ATT	2	6	6174	6179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017056	TTA	2	6	7503	7508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017056	ATT	2	6	7554	7559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017056	ACA	2	6	7637	7642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017056	TAT	2	6	8750	8755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017056	TTA	2	6	8863	8868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017056	TAA	2	6	8904	8909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017056	TTA	2	6	9008	9013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017056	ACC	2	6	9081	9086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017056	GTA	2	6	9112	9117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017056	CAT	2	6	9142	9147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017056	ATT	2	6	9155	9160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017056	CAT	2	6	9178	9183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017056	ACA	2	6	9190	9195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017056	TAA	2	6	9199	9204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017056	TTA	2	6	9340	9345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017056	TAT	2	6	9402	9407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017056	AAT	2	6	9452	9457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017056	TAT	2	6	9476	9481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017056	AGA	2	6	11824	11829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017056	ATA	2	6	14381	14386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017056	TTA	2	6	14391	14396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017056	GTT	2	6	14446	14451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017056	TTA	2	6	14460	14465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017056	GTA	2	6	14477	14482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017056	TTG	2	6	14513	14518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017056	ATT	2	6	14527	14532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017056	ATT	2	6	14678	14683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017056	ATC	2	6	14718	14723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017056	AAG	2	6	14829	14834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017056	ATT	2	6	14939	14944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017056	TTG	2	6	14952	14957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017056	ATT	2	6	14998	15003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017056	TAA	2	6	17871	17876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017056	GAA	3	9	17911	17919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017056	ATA	2	6	19090	19095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017056	ACC	2	6	19140	19145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017056	ATA	2	6	19237	19242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017056	TAA	2	6	19250	19255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017056	AAG	2	6	19272	19277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017056	TTA	2	6	19314	19319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017056	CTT	2	6	19388	19393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017056	ATT	2	6	19415	19420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017056	TAG	2	6	19451	19456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017056	AAT	2	6	19580	19585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017056	CAT	2	6	19738	19743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017056	TAG	2	6	19907	19912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017056	GTA	2	6	20031	20036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017056	TAA	2	6	20037	20042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017056	AAT	2	6	20114	20119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017056	GAA	2	6	20214	20219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017056	TAA	2	6	20232	20237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017056	TAG	2	6	20254	20259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017056	AGT	2	6	20347	20352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017056	TAT	2	6	20408	20413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017056	AAT	2	6	20435	20440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017056	ATT	2	6	20594	20599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017056	AAG	2	6	20653	20658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017056	GTT	2	6	20683	20688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017056	AAT	2	6	20720	20725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017056	ATA	2	6	20780	20785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017056	TGA	2	6	21102	21107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017056	TAG	2	6	24401	24406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017056	CAC	2	6	24437	24442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017056	GGA	2	6	24443	24448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017056	TAC	2	6	24993	24998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017056	TTA	2	6	25168	25173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017056	TTA	2	6	26916	26921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017056	TTC	2	6	26936	26941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017056	ATT	2	6	26949	26954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017056	ATT	2	6	27031	27036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017056	CAG	2	6	27060	27065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017056	AAT	2	6	28191	28196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017056	ATT	2	6	28203	28208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017056	TAG	2	6	28243	28248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017056	ATT	2	6	28299	28304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017056	ATA	2	6	28442	28447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017056	TGC	2	6	28547	28552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017056	TTC	2	6	28570	28575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017056	TGA	2	6	28635	28640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017056	TAA	2	6	28702	28707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017056	CAT	2	6	28765	28770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017056	TAA	2	6	28784	28789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017056	TCA	2	6	28946	28951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017056	TAT	2	6	28970	28975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017056	ATT	2	6	29119	29124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017056	AAT	2	6	29128	29133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017056	TGA	2	6	29232	29237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017056	GTA	2	6	29242	29247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017056	ATT	2	6	29286	29291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017056	TAA	2	6	29312	29317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017056	ATT	2	6	29330	29335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017056	TCT	2	6	29365	29370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017056	TTA	2	6	29379	29384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017056	ATT	2	6	29432	29437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017056	ACA	2	6	29454	29459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017056	ATC	2	6	29474	29479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017056	TTA	2	6	29603	29608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017056	TAA	2	6	29652	29657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017056	TAA	2	6	29673	29678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017056	ATT	2	6	29729	29734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017056	TCT	2	6	29752	29757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017056	TAA	2	6	29883	29888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017056	TAT	2	6	29976	29981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017056	TAT	2	6	30065	30070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017056	TAA	2	6	30135	30140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017056	CAC	2	6	30840	30845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017056	TTA	2	6	31004	31009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017056	TCT	2	6	31094	31099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017056	CTG	2	6	31122	31127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017056	CTT	2	6	31133	31138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017056	TAA	3	9	31304	31312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017056	ATT	2	6	31430	31435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017056	AAT	2	6	31488	31493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017056	TCT	2	6	31500	31505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017056	AAT	2	6	31616	31621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017056	ATT	2	6	31658	31663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017056	GTT	2	6	31822	31827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017056	ATT	2	6	31942	31947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017056	ATT	2	6	32005	32010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017056	ATA	2	6	32011	32016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017056	ATA	2	6	32039	32044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017056	TAT	2	6	32104	32109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017056	TAT	2	6	32114	32119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017056	TAA	2	6	32126	32131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017056	ATT	3	9	32145	32153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017056	ACT	2	6	32176	32181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017056	TAT	2	6	32261	32266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017056	ATA	2	6	32315	32320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017056	GAT	2	6	32328	32333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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